Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZEB1_0001100

Sequence Length

1989 nt

GC Content

0.4465

GGAAACACACACCCCUCUGCCUGGCGUGAGAGUUAAAAAAAAAGAGAGACAGCCCGAGGGAUCGAGACCUGAACAUGUGGUGGUGGUUGCACAGUCGCCUUUUCCAGUUUGGAGAGACGUUGUAAGUUGAUUGUAUUUCUGGUUAUCUCGGGGCGAUGCUAUGCUUUCUCUCCCUCUCGUGCAGCAGCGAAAUGUCUGCUGAUUGUUAUUGUCUGGACAGUUCCUGUGGCGAGAGGGGCGAGACUUGUCCGCCCGGGGGCGGCGGGAGCGCAGGGAGAGCAGCCCCCGCCUGCGCCGCCCCGGUACCUGUUUGUAUAAUAAUGGGCGGCAACGGCCCUGCCGCCGGCCGCAGCCCAGGCUAUAUAAGGAAUUACACGUACAUUUCGGACCGAGGGGCUCGCUUUGGUUCCUGCGUUAUUUUUAAAACGACUUUUAAGAGAGGGGCAAUAAAUGCGUCUAUAAUGGGACCGCUGCAGCGUCGAGAAAACGAGGAAAUACGUGUUUAGGAGAAAACUCUCUCGUGCUCCCCCAGCCCCACCCCCCGCGCCUGGGCUCCCUUUCUCCCUCCCCUCUGGGAUGCGAAACGCGAGGUUUUGUAACCUUUCCUGGCAAUUUUAGAUUUUGUGUGGGAUUUCCUGUCUAGAAGCAGAUACGAAGAUUUUUAAGCUGUUUCAAGAUGUUUCCUUCCAAUCCAUAAUUAUAUUUUUAAUAUAUUCGAGCCAUCAUUAAAAUCACUGCUUUCGUGAUUUUAAUUAUUCAAAUAAACACUUGCAUUUUAAAGACGUCUGUUGAUUAUAAACGAAAGGUAUUUUGGUAUUCUCAUUGUGGAGAGAUGACUUGUUAUAGCAAGGAGUGGAGCAUAGGCUAUUGCAAUUUUAAUUUCCUGUUUUAGCGUCAAAUAGUGUGUGUUCCAUAUUGAGCUGUUGCCGCUGUUGCUGAUGUGGCUUUAUGAAAGUUUUCAGUUUAAAUUCUCAACUGGCAAUUGGCCGAAAACUCCCAUCUGAAGACAUGAUCAUCCAAAUGUCAUUUUGUGAUUUGGCUACUGUCUGCUUGACAUAGGAAAGCACUAUCAAGAAAGACUAAUGGAGUGACUAUCAAAAGGAAGUCAAUGGACAACCUUAAACUUCCACCACAAGAGGAAUAUAAAGAGGUCCCUCCUGCACCAAGAAAGAUCUGCAGAUCUUUUUCAGUGUUCUUGGAGGUGUGGGGUGUGAGAACUUGAUCAGUUUGUGUCAGCCACCUUGUUCUCUAAAGUUACAAAUUAUAAUACUGUGGUAGAAACAAAUUCAGAUUCAGAUGAUGAAGACAAACUGCAUAUUGUGGAAGAAGAAAGUGUUACAGAUGCAGCUGACUGUGAAGGUGUACCAGAGGAUGACCUGCCAACAGACCAGACAGUGUUACCAGGGAGGAGCAGUGAAAGAGAAGGGAAUGCUAAGAACUGCUGGGAGGAUGACACAGGAAAGGAAGGGCAAGAAAUCCUGGGGCCUGAAGCUCAGGCAGAUGAAGCAGGAUGUACAGUAAAAGAUGAUGAAUGCGAGUCAGAUGCAGAAAAUGAGCAAAACCAUGAUCCUAAUGUUGAAGAGUUUCUACAACAACAAGACACUGCUGUCAUUUUUCCUGAGGCACCUGAAGAGGACCAGAGGCAGGGCACACCAGAAGCCAGUGGUCAUGAUGAAAAUGGAACACCAGAUGCAUUUUCACAAUUACUCACCUGUCCAUAUUGUGAUAGAGGCUAUAAACGCUUUACCUCUCUGAAAGAACACAUUAAAUAUCGUCAUGAAAAGAAUGAAGAUAACUUUAGUUGCUCCCUGUGCAGUUACACCUUUGCAUACAGAACCCAACUUGAACGUCACAUGACAUCACAUAAAUCAGGAAGAGAUCAAAGACAUGUGACGCAGUCUGGGUGUAAUCGUAAAUUCAAAUGCACUGAGUGUGGAAAAGCUUUCAAAUACAAACAUCACCUAAAAGAGCACUUAAGAAUUCACAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-568.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -607.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 497.22

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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