Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZEB1_0001700
Sequence Length
387 nt
GC Content
0.3230
GUCAAUCACAUAUUUAAUAAUUACUAAAUUCUGUCAGAUUAUUUUAAAAACAGCAACACCAUUUUUUACGCUCACCAACAAUGUAAAAGAACUAUUUUCUCACGUUUUUGCCAGCCUUCGGUAUUGUACAACAUUCUACAUUUUGCUAAUUUUUCAGUUGCUAAAUAUAAUCUGAUAGUUGCUUUAAUUUAUGUUUCUCUGUUUAUUAGGGAGGUUGAUCAUUUCUUCAUAUCCUUGCUAGCUGUUUGGGUUUCCCUUUCCAUAUCUGGCCUAUUCAUACCCUUUACCCCUCUUUUUGGAUAGAUUUCCAUUUCUCUUGUGUAUUUAAGAUGAUAAUCCCCAACGUUUCAGUCAUUUGACUUUGGUACAGGAAUCCUUAAUUUUAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-57.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -63.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 84.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((......(((((.......(((((((((((((((......((((((............(((...(((.(((((...((((.....)))).))))).)))..)))....((((.((((........))))...)))).........))))))))).))))))))))))......)))))))))).((((((.....)))))))))))).)(((.............(((((..((.((((........)))).)))))))..........(((.((((........((((......))))..(((((((......))))).))................((((....))))..)))).))).............)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({({{{{{({{......{{,,,.......(((((((((((({((......((((((............(((...(((.(((((...((({.....}))).))))).)))..}))....{({{.((((........))))...}))).........))))))})}.))))))))))))......}}}}}})}}}.((((((.....)))))))}}}||.}{{,...,,,...,,..(((((.,({.{(((........}})).}.))))),,{,,,,...,,..,,,,........||||,,}...,,}|..,,(((((......))))).)}...,,.{{{{......((((....)))},}))}}.})),............}))
Back