Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZEB1_0005800
Sequence Length
367 nt
GC Content
0.3678
CAGCUGUUUAAGGAAGACAGAGCAGGCAUUGGAUAAUAUUCUUAUUAAGUUUUCAGUUUAAAUUCUCAACUGGCAAUUGGCCGAAAACUCCCAUCUGAAGACAUGAUCAUCCAAAUGUCAUUUUGUGAUUUGGCUACUGUCUGCUUGACAUAGGAAAGCACUAUCAAGAAAGACUAAUGGAGUGACUAUCAAAAGGAAGUCAAUGAUUUCUUAAGAAUUUACAACAAAACCCUGUCAAAGCAGCAUUCUUACGUGAGAAUUUCACUUACGGGAGAGUUCUUACAGGAUUUCAAGAAGGAAAGCCCUGAAGAGGGACACUGAUUUCCUCAACUGAAUUUAAAAUUGUUACAUGCAGACAUUUUUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-80.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -86.04
Frequency: 0.0001
Diversity: 79.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.....)))))).(((((..(((......(((((((....((((((((..............((((.....))))...........)))))))).((((((((((...(((.((((.((((...(((..((((.....))))......)))...)))).)))))))...)))).)))...)))...(((((((...))))))))))))))......)))...)))))......((.(((((..((((((.......))))))..))))).))..((((.((((......))))..))))..((((((.......))))))..)))..(((((((.((((.......)))).))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.....}))))).(((((..(((......(((((({....((((((((..............{(((.....))))...........)))))))).|{|{({((((...(((.((((.((((...(((.{((((.....)))}.,}...}))...)))).)))})))...)))),))}.,.}}...,(((((((...))))))))))))))......))}...)))))....,.{{.(((((,.((((((.......)))))).,))))),}||.((((.((((......))))..))))..{|((({.......))))))..)))..(((((((.((((.......)))).))))))).
Back