Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZEB1_0010100
Sequence Length
371 nt
GC Content
0.6927
GCCGGGCAGAGGCACUCCUCGCUUCGCAGACGGGACGGCGGCAAGGCAGGGGCACUCCUCAUUUCCCAGACGGUGAGGAGGCCGGGCAGAGGCACUCCUCGCUUCGCAGACGGGACGGCGGCAGGGCAGAGGCGCUCCUCAUUUCCCAGACGGUGAGGAGGCUGGGCAGAGGCACUCCUCGCUUCGCAGACGGGGCGGCGGCGGGGCAGAGGCGCUCCUCAUUUCCCACACGGUGAGGAGGCCGGGCAGGGGCACUCCUUACUUCGCAGACAGGACGGCGGCGGGGCAGAGGCGCUCCUUGUUUCCCAGAUGGGGCGGCGGCUGGGCAGAGGCGCUUCUCACUUCCCAUACUGUGAGGCAGCUGGGCAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-158.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -165.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 140.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((.((((....))))((((((((((.((((..((......))...(((.(((((((((........))))))))))))(((..((((..(.(((((((((((....((((..(.((.((.((....)).)))).)...))))...(((((.(((((.((((..(((((.(((((((((((((.......)))).))))))).))..)).))))))))))))))).))(((((((((((.......))).))))))))..(((.(......).)))))))))).)))).)..))))....)))((.(((((.((((.((......)).))))))))))))))).).))))))))).))).)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((.((((....))))(((((((((,.((((.,((......)).,.(((.(((((((({.,...,..)))))))))))),{{..{{((,.|,||||(((((((....({{{.,{|{{.,{.({.,,{||,||||{|.,.,|||.,..|||||||||{|(..,....})).}))))|||{((({...||,,})},,.))))))}.}}}}.},.))))....)))....((((((((((((.......))).))))))))),(((.{.{.....,|||}|}}|}.,||||||||}}|||},,(((,,.,|}},.,,)}.))))).,)}))))))))),.),)))).,.))))))))).))).)))....
Back