Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZEB1_0011100
Sequence Length
1452 nt
GC Content
0.3209
UUUUCAGUUUAAAUUCUCAACUGGCAAUUGGCCGAAAACUCCCAUCUGAAGACAUGAUCAUCCAAAUGUCAUUUUGUGAUUUGGCUACUGUCUGCUUGACAUAGGAAAGCACUAUCAAGAAAGACUAAUGGAGUGACUAUCAAAAGGAAGUCAAUGGACAACCUUAAACUUCCACCACAAGAGGAAUAUAAAGAGGUCCCUCCUGCACCAAGAAAGAUCUGCAGAUCUUUUUCAGUGUUCUUGGAGGUGUGGGGUGUGAGAACUUGAUCAGUUUGUGUCAGCCACCUUGUUCUCUAAAGGGAAAGCCCCUCAAACCAUUUUGUAUUCUGUAUUACACUUCAGAAAGUGUGGAAGCAAAGGUCAUCUAAUCUUUAAAAGGUAUGUAAUCAUAAAAUUUUUUAUGUCAGAUCUUAAUUGAAAAAUAUUACUUAAAACUUGAAAAAAUUACUUAAAAUUGGCAAUUUCUUUUUCGUCUUACAACUUCUUCCUGUCUUCAGGAAAUGAAGAAUAAAUAUGUUGGUUCUAUCAGGGAAACCUUAUGAAGGAUAAGCAAAUUAAUGUCUGUGCUUUACUUCCAAAUUCUGACAUCAGAAAACCUUAUUGUUAACUAAUAUAAUCUAUAGAUGUCUCUCAAAAUGACCAGUCUUAAAUUCAAAUGUCAUUUGGAUAUCAUUAAUUGACUAUGGAGAAGAGCAGAAGCAUGCUGAUUUCGAAAAUGUCAUUAAUAUUAGGAUUAGGUCAGUCUUAGGCAAGAAUACUUUGAAUAACAAGAGACUAAAUGUCUAGUAAAACAUUUUAGAUUGUAAUUCCCAGUAUUCUGUAGUAUUAACAAUGAGACUUAAAGUACUGGUGAAGACAUUAAAUUUGUCCCUUUCAUUUAUCUUUUCUUAAAGCUCUUAAAGUGAUCCUGAAGACUUUAGUUCUACAAAAUGUGAACUUCUUAUGGACCAUUAAAGUGGGGAGUAAUCUGCUGAUUUUUGUCUAGCAACCCUACCUCUGAUGCAGGAUAAUUUUUCAAAACCGUUGUUCUUCCUAUAGCUGUAUAAUAGAAGAUAUUAAAGAGGAAAAAUACUUGUGUGUUUGCUGUUAGAAUGAGGAAAAAAUACAAAUUGGACCUUUUUGAAAAACCUUGAGAACCAAUUUACUUUUUUUGUAUGUAAAUGGUCGAGGAGUUAGAACUAGUCUUGGUUAUUAUAACUGCAGGUAAACUUAAAAGAUUUAAAUCUUCAAAACAGAUAUCAUGUAGGUUUUAUUAGAAAAGAAAUAUAGAUUAUUGGGUGUAUAGAGAUAAUCUAUAUAUACGUACAGUUUUUUUUAAUUUUUAUUUGCAAGAGCAUGCUAAAUAUCUUAGCCUUUAUAAUAGCAUAGAAUAGAAUGGACAAAUAUGUUAUCCCUUUUUGCCAGUUGAGAAAACACUUUGAAUUAAAUCUCCAACCUAAUGAAAAUUAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-332.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -359.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 406.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((((((((((.((((((((...((.((...((.(((((..........))))).)).)).))))))))))..((((.(((((..(((.......))))))))..))))........(((((.((....)).))))).((((..(((((...(((((.........(((((((((((.(((.(((((.((((..(((((((((....)))))))))..))))....)))))((.(((((..(((((((((((........))))).......))))))..........))))).)).))).))))))))))).....((((((....)))))))))))..)))))..))))(((((...))))).......((((((....))))))((((...((((.(((......))).))))...)))).............((((((((((((.((((((((...........((((((....)))))))))))))).)))).)))))))).((((((((.......(((((((....((((((((((((((..(((.(((((.....(((((....)))))...((((((((((((((..............(((((.......(((((((((((((((((((((...))))))))...((((((.(((..(.((((..((((......))))..)))).)....))))))))).)))))))).))))).....)))))((((((((..((((.((((......((((((........))))))....)))).))))..)))))))).))))..)))))))))).....)))))..)))..))))))).)))))))..)))))))....((((....)))).......((((.(((..((((....(((((.(((...))))))))))))..))).))))...((((((.......(((((((....))).)))).))))))))))))))..(((((((.........(((((..(((((.((((....))))...)))))..(((((((((...(((..((((((.(((.((.........)).)))..)))))))))...)))))))))....((((((...(((.(((((...........))))))))))))))........(((.(((..((((((((((.((((((((((.....(((((....))))).(((((..(((...)))..)))))(((((((((((.((((((((((((...........))))))))))))..........))))))))))).)))))))))).......(((((.....)))))..))))))))))..))).))))))))........)))))))....)))))))))))))).....)))))))................))))))((...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((((((((((((((.((((((({...{{.((,..((,(((((..........})))).||||},}|}))))))}..((((.(((({..{((.....,.))))))))..))))...,||,,{((({.{{...,{|{|||||.{(((..(((({...(((((,........(((((((((((.(((.(((((.((((..(((((((((....)))))))))..))))....))))){(.(((((..(((((({{({,,,,.....}}}))....,..))))))..........))))).)}.))).))))))))))).....,{{{{{....,})))))))))..}))))..)))},,,{,...|||||.,{....{{{{{{....|}}}}},,|.,,,,|,,.|||......,,,..,,.....|||{,{{{{{.,,....,,|}}|||}}}.}}}}||||.......{{{{((((((....))))))..))))||,|.|{.{(((.(((((((,(((,...}}}.(((((((....((((((((((((((.{(((.(((({.....(((((....)))))...((((((((((((({.......,....,,{((((.......(((((((((((((((((((((...))))))))...(((((,{(((..{.((((..((((......))))..)))).}....))))))))).)))))))).))))).....))))}((((((((..((((.((((....,.((((((........)))))).,,.)))).))))..)))))))).)))}.,)))))))))).....)))))..)))..)))))))}}})))))..)))))))..,,{|||||||{,{{({,,,..((((.(((..((((....(((((.((,...,)})))))))))..))}.||||...((((((.......(((((((....))).)))).)))))).|{||,||||||||,,{{{{{{{{{{{{||{{{,,((({(.,,.,,...||{{{|,|||||(....(((,...,,,.}}}.,))}))}.)})))),....))})},..,.)))},,}}}..,,))))))}},.{{{{{|..,((||(((((...........))))))))))))))|||},,}}|||,|||,,((({{{{|||||((((((({{.|,..(((({....}}}}}..,,,{,.{||,,.}}}|,}}}}}|,,||||||||.{{{{{{{{{{{(,.,{{{{{{,{}},,,)))))))},.}.....,}}))))))))}.}}})))))}},},}},.(((({.....)))))..}}))}})))),,})}})))))).)))}.,,.}))).,.},...)))))))))))))).....)))))))................))))))({...})
Back