Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ZEB1_0014300

Sequence Length

407 nt

GC Content

0.4521

GACAACCUUAAACUUCCACCACAAGAGGAAUAUAAAGAGGUCCCUCCUGCACCAAGAAAGAUCUGCAGAUCUUUUUCAGUGUUCUUGGAGGUGUGGGGUGUGAGAACUUGAUCAGUUUGUGUCAGCCACCUUGUUCUCUAAAGUUACAAAUUAUAAUACUGUGGUAGAAACAAAUUCAGAUUCAGAUGAUGAAGACAAACUGCAUAUUGUGGAAGAAGAAAGUGUUACAGAUGCAGCUGACUGUGAAGGUGUACCAGAGGAUGACCUGCCAACAGACCAGACAGUGUUACCAGGGAGGAGCAGUGAAAGAGAAGGGAAUGCUAAGAACUGCUGGGAGGAUGACACAGGAAAGGAAGGGCAAGAAAUCCUGGGGCCUGAAGCUCAGGCAGAUGAAGCAGGAUGUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-97.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -106.77

Frequency: 0.0000

Diversity: 94.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((.(((((.(((((((......((((.((........)).))))..((((..(((((((((....)))))))))..))))...))))))).))))))))..(..(((......(((((((((.((.(((...(((((...((.(((..........(((((((((..(((..((((.(.((((..............((((((.((((((.(........).)))))))))))))))).).))))..)))..((.....))..))))).)))).........))).))...)))))((((((.....((.........))....))))))))).)).))))))))).....)))..).....((((((..((((((...))))))........))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,{..{((({.((((((({{.{{{(({{.........{{|,.,}}),}((((..(((((((((....)))))))))..)))),}})),,)))},))))).}},|..(((..,,..(((((((((.((.(((,,{{(({{...|..||,......,,,,(({((((,...,{{..{(((.{.((({....,,........((((((.((((({.{........}.)))))))))))))))),|,|}}|,,|}},||}.,),.,.,|||,,|,|}}},,,...,,,)))),,,.}),})}((((((.....{,.........)}....))))))))).)).))))))))).....}})..}.....((((((..((((((...))))))........))))))......