Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZEB1_0015500
Sequence Length
278 nt
GC Content
0.4173
GACAACCUUAAACUUCCACCACAAGAGGAAUAUAAAGAGGUCCCUCCUGCACCAAGAAAGAUCUGCAGAUCUUUUUCAGUGUUCUUGGAGGUGUGGGGUGUGAGAACUUGAUCAGUUUGUGUCAGCCACCUUGUUCUCUAAAGGGAAAGCCCCUCAAACCAUUUUGUAUUCUGUAUUACACUUCAGAAAGUGUGGAAGCAAAGGUCAUCUAAUCUUUAAAAGAGAUGGGACAACAAAGAAAUUCUAGCCUUUGGAGACAUCUAGACCAGCACUAUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-64.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -70.36
Frequency: 0.0001
Diversity: 45.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((((...(((((.........(((((((((((.(((.(((((.((((..(((((((((....)))))))))..))))....)))))((.(((((..(((((((((((........))))).......))))))..........))))).)).))).))))))))))).....((((((....)))))))))))..)))))..))((...........(((((......(((((..........)))))....)))))..............))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,..(((((...((((({,..,....(((((((((((.(((.(((((.((((..(((((((((....)))))))))..))))....))))){(.(((((..(((((({{({,,,......}}}))....,..))))))..........))))).)}.))).))))))))))).....,{{{{{....,})))))))))..)))))..||(,{((((,...}))))),|},...,..{{....,,,.,,,||||{{....)))})}}{{........))
Back