Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZEB1_0018700
Sequence Length
2703 nt
GC Content
0.4262
AAACAAAUUCAGAUUCAGAUGAUGAAGACAAACUGCAUAUUGUGGAAGAAGAAAGUGUUACAGAUGCAGCUGACUGUGAAGGUGUACCAGAGGAUGACCUGCCAACAGACCAGACAGUGUUACCAGGGAGGAGCAGUGAAAGAGAAGGGAAUGCUAAGAACUGCUGGGAGGAUGACACAGGAAAGGAAGGGCAAGAAAUCCUGGGGCCUGAAGCUCAGGCAGAUGAAGCAGGAUGUACAGUAAAAGAUGAUGAAUGCGAGUCAGAUGCAGAAAAUGAGCAAAACCAUGAUCCUAAUGUUGAAGAGUUUCUACAACAACAAGACACUGCUGUCAUUUUUCCUGAGGCACCUGAAGAGGACCAGAGGCAGGGCACACCAGAAGCCAGUGGUCAUGAUGAAAAUGGAACACCAGAUGCAUUUUCACAAUUACUCACCUGUCCAUAUUGUGAUAGAGGCUAUAAACGCUUUACCUCUCUGAAAGAACACAUUAAAUAUCGUCAUGAAAAGAAUGAAGAUAACUUUAGUUGCUCCCUGUGCAGUUACACCUUUGCAUACAGAACCCAACUUGAACGUCACAUGACAUCACAUAAAUCAGGAAGAGAUCAAAGACAUGUGACGCAGUCUGGGUGUAAUCGUAAAUUCAAAUGCACUGAGUGUGGAAAAGCUUUCAAAUACAAACAUCACCUAAAAGAGCACUUAAGAAUUCACAGUGGAGAGAAGCCAUAUGAAUGCCCAAACUGCAAGAAACGCUUUUCCCAUUCUGGCUCCUAUAGCUCACACAUAAGCAGUAAGAAAUGUAUCAGCUUGAUACCUGUGAAUGGGCGACCAAGAACAGGACUCAAGACAUCUCAGUGUUCUUCACCGUCUCUUUCAGCAUCACCAGGCAGUCCCACACGACCACAGAUACGGCAAAAGAUAGAGAAUAAACCCCUUCAAGAACAACUUUCUGUUAACCAAAUUAAAACUGAACCUGUGGAUUAUGAAUUCAAACCCAUAGUGGUUGCUUCAGGAAUCAACUGUUCAACCCCUUUACAAAAUGGGGUUUUCACUGGUGGUGGCCCAUUACAGGCAACCAGUUCUCCUCAGGGCAUGGUGCAAGCUGUUGUUCUGCCAACAGUUGGUUUGGUGUCUCCCAUAAGUAUCAAUUUAAGUGAUAUUCAGAAUGUACUUAAAGUGGCGGUAGAUGGUAAUGUAAUAAGGCAAGUGUUGGAGAAUAAUCAAGCCAAUCUUGCAUCCAAAGAACAAGAAACAAUCAAUGCUUCACCCAUACAACAAGGUGGCCAUUCUGUUAUUUCAGCCAUCAGUCUUCCUUUGGUUGAUCAAGAUGGAACAACCAAAAUUAUCAUCAACUACAGUCUUGAGCAGCCUAGCCAACUUCAAGUUGUUCCUCAAAAUUUAAAAAAAGAAAAUCCAGUCGCUACAAACAGUUGUAAAAGUGAAAAGUUACCAGAAGAUCUUACUGUUAAGUCUGAGAAGGACAAAAGCUUUGAAGGGGGGGUGAAUGAUAGCACUUGUCUUCUGUGUGAUGAUUGUCCAGGAGAUAUUAAUGCACUUCCAGAAUUAAAGCACUAUGACCUAAAGCAGCCUACUCAGCCUCCUCCACUCCCUGCAGCAGAAGCUGAGAAGCCUGAGUCCUCUGUUUCAUCAGCUACUGGAGAUGGCAAUUUGUCUCCUAGUCAGCCACCUUUAAAGAACCUCUUGUCUCUCCUAAAAGCAUAUUAUGCUUUGAAUGCACAACCAAGUGCAGAAGAGCUCUCAAAAAUUGCUGAUUCAGUAAACCUACCACUGGAUGUAGUAAAAAAGUGGUUUGAAAAGAUGCAAGCUGGACAGAUUUCAGUGCAGUCUUCUGAACCAUCUUCUCCUGAACCAGGCAAAGUAAAUAUCCCUGCCAAGAACAAUGAUCAGCCUCAAUCUGCAAAUGCAAAUGAACCCCAGGACAGCACAGUAAAUCUACAAAGUCCUUUGAAGAUGACUAACUCCCCAGUUUUACCAGUGGGAUCAACCACCAAUGGUUCCAGAAGUAGUACACCAUCCCCAUCACCUCUAAACCUUUCCUCAUCCAGAAAUACACAGGGUUACUUGUACACAGCUGAGGGUGCACAAGAAGAGCCACAAGUAGAACCUCUUGAUCUUUCACUACCAAAGCAACAGGGAGAAUUAUUAGAAAGGUCAACUAUCACUAGUGUUUACCAGAACAGUGUUUAUUCUGUCCAGGAAGAACCCUUGAACUUGUCUUGCGCAAAAAAGGAGCCACAAAAGGACAGUUGUGUUACAGACUCAGAACCAGUUGUAAAUGUAAUCCCACCAAGUGCCAACCCCAUAAAUAUCGCUAUACCUACAGUCACUGCCCAGUUACCCACAAUCGUGGCCAUUGCUGACCAGAACAGUGUUCCAUGCUUAAGAGCGCUAGCUGCCAAUAAGCAAACGAUUCUGAUUCCCCAGGUGGCAUACACCUACUCAACUACGGUCAGCCCUGCAGUCCAAGAACCACCCUUGAAAGUGAUCCAGCCAAAUGGAAAUCAGGAUGAAAGACAAGAUACUAGCUCAGAAGGAGUAUCAAAUGUAGAGGAUCAGAAUGACUCUGAUUCUACACCGCCCAAAAAGAAAAUGCGGAAGACAGAAAAUGGAAUGUAUGCUUGUGAUUUGUGUGACAAGAUAUUCCAAAAGAGUAGUUCAUUAUUGAGACAUAAAUAUGAACACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-667.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -720.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 605.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..(((...((((.(..(((.((.....)).)))..).))))....)))..))))......((((.(((((((..(((((((...((((.(((((((.(.........).))).)))))).(((..(((((((.........((((.((((......(((((((((((((...(((((((((.(.((((....((((((..((((((...))))))........))))))...........(((.(((..(((...(((...........))))))....))).)))....(((((.(((...))).))))).........)))).)..))))))))).((..(((....))).))(((((.(((((........((((.(((((.((..((((((((.(........).))))))))..)).)).)))(((((((...)).))))).))))......))))).))))).((((.((((((((((((((((.((((.......)))).))))..))))))...((..(((((((........)))))))..))(((((..(((..(((((((((...((.......((.....)).......))))))))))))))..)))))..................((.(.(((((.((((((((((((...........((........))(((.......(((((..((((.......)))).)))))........)))..)))).))))))))))))).))).......(((........))).....((.((((.....(((((..(((((...(((....)))...)))))..))))))))).)).)))))))))).)))).)))))))))......)))).))))......((((((...(((.....((((((((.....................)))))))).............)))...))))))((((((..........))))))((((.(....).)))).)))))))..))).........((((((((..((((..((((((...((((((.(((((..(((((.....(((.((((((...((((...(((((..(((.((((((..(((...((((((.........(((((((.(((((...))))))))))))((((((((.(((((((((........(((((.(((((.((....))...)))))))))).............(((.((.....)).))).............((((((...............))))))........((((((((.((......)).))))))))))))))))).)).((((.(((((((......)).....)))))))))..............................))))))........((((((.((...(((((.((((((((..(((((..(((((((.((.((((((.(((((((((((..((.(((......(((.(((((........))))).)))..((((((((....(((..((((((......(((...((((.....(((((...((((((.((.(((..((..(((...))).))..))).)).))))))...)))))))))..))).))))))...)))...))))))))..))).)).)))))))))...)).)))))).))...............(((((...(((((......)))))..))))).........(((((((((((((.........))))))).))))))......((((((........))))))...))))))))))))..))))))))...(((((((..........((((..(.......)..))))........(((......)))...(((....)))..........(((((.....((.....)).....)))))..)))))))..)))))...)).))))))..))))))...))))))))).))).))))).)))).)))))).)))..............((((........))))......(((((...((((((((((((....(((.(((((.(((.(((.(((.((.....((((((((((............................))))))))))...))))).))).....(((((.........)))))((.(((......))).)).))).))))).))).........((......)).)))))))).))))))))))))))..)))))...)))))).))))))))))..)))))))).....))..))))))))))))))))))........((((....)))).....(((((((.((((((.(((...((((((..(((....))).....))))))...))).))).)))...(((((.....)))))..........))))))).((...((((......(((........))).((((......)))).....))))...))....((((((..((....)).))))))...((((((..((((((.....))))))))))))((((.............))))...........((((((((...(((((.((....)).))))))))))))).....((.((((((.(((........)))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.({{{..{((...((((.{..(((.{{.....}|.}}}..}.}}}}....}},..)})).|.||{(({(((((((((({((((((......(..((..(((....)))..))..).{(((((((.(((.((,(((((((..,{(..((((.(((.....((.(((((,.((((({...,(((((((.((((...,...(((((((((((({...}))))}{((((({((((..({{.,.,.....(((.(((..{{{..,{|,..,.,......}|,}}}....))).)))....(((((.(((...))).))))),,.,,|||}}))},}))}}|..,,((((((.{((,...}}|,,,{..((((((({,{{||{{{{{||{(((|{|{(,.((((((((.{.,....|.}.)))))))}|,{{.,,,{,,{{{{{,....}),))}|{(((,,,.....,,,}},}}}}}.{{,,{(({(({{{((({((((.((((.......)))).))))..})))}}||,{{..(((((((........))))}}},,},((((({{{{(..(((((((((...({.......{{.....}}.......)}))))))))))))}.))))),.....,,,........,||,|.(((((.((((((((((((...........{{........)}(((.,,..,.(((((..((((.......)))).))))).,......)))..)))).))))))))))))).}||{..,,,,||{,.......})}|,,..||.{|||.....(((((..(((((...(((....)))...)))))..)))))}}}}.}},)))))))}}|,,,({(((.{{.((.......,|,.(({......}}),...,,...,)}....}}.})))}.....(((((((({(((((((((,,.({(...............,...((((((.,,.{{....}},,.)))))).(((((({{(((({....,((((..((((((.,.....,,.))))))...(((((((((.,......((((((,{((((((((....))))).))))))..(((((((((((.((((((.(((.((((.......((((...{.(((.(((((((.(((({...}))))))))))).))).,.,..))))........)))).))).)))))))))))))}..)))...(((((..,{....}}.))))}.......{(((..{((((..........))))).)))})))).....,.))))))))).....((((((((.((......)).)))))))).............)))))))))))))))).....|||...})))))))).,.....,,,.......,,........(((((((({....}))),..}))))...}||,.||||,..,|||.,,,,}}}||{|,,,..}}}}.....,,)))))))))}))}))))))),,))}}}),)))}))))}|,{{,(((,{,((((((({....(((,,{(((((......{{{...,(({....,(((((...((((((.((.(((..{{..{{{..,}}).}),,))).)).))))))...))))))}}),.|||,||||||{{{|},...)))))))}})}})}}....,,,..(((..{{|||...,.,....(((((({...}))))))...(((((......))))).})))).,,}......{((((((((((((.........))))))).)))))}....((((((({..{((((((..{(((((.....))))))))},)))).,))))))){{|..((((...))))..}}}.......)))))))..,.....,.,,}.)))))).|,|((....))}......,)))))))......(((..((((.((((....)))).)))).))).........((.{(((...((((((((........))))))))...)))).}).............,)}))...))))))))))))).........,.(({{,.,|{(((((((((((....(((.(((((.(((.,{(,(({.{{.....{(((((((((.,,.{{.........}).,}........)))))))))}...,}}}),))|,,,..{.{,{{{{......,,)))},,{||..,...}))})..))).))))).))).........((......)).))))))))},)))}}))).,..))))).})....))).))))....{(({................}}}}....)).,..))))))),((((...((((....)))).....))))..(((((...((((...((((((.,(((....))).}...))))))}))).))))).,))))).))))))))))))))..}}....})))))))).,}))},||({{{.......}}}}....{|,((((......))))..}}},,.,.........((((((..((....}).))))))...{(({(({,((((((.....)))))))))))}((((.............))))...........((((((((...(((((.((....)).))))))))))))).....((.((((({,(((........)))))))))}}...,
Back