Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF652_0001700
Sequence Length
1606 nt
GC Content
0.4738
AUAAGAUGCUCCCAAGUCCCUUGCAGCUCUCUUCAGAAGAAAAAUCACUAGUGCUCUGCUCUUGCCAUAAUACCAAACCUUUUUGACUCAUGCUUUGGUGCUGCAACACUGGAAGAAUUGCACACAGUUUCCAGGAAUAUCUUUUUUUCAUUUGAGUGAUUCUUUGUGGAUGAGAAAAGAUUUGAGUCUUAAUAAUUACCUUGUUUUAAAGCUAUUUCUUUAUAGUCUGAACUGUUUAAUAAAUUGGGCCACUUACCAAUGAGCCACACAGCCAGUUCUUGUCAGGAGCUGGUUGAAAACUGUGCUGUGCAUGUAGCAGGAAUGGCACAAGAAGAUAGCCGUCGUGGUCAAGUGCCAUCUUCCUUUUAUCAUGGUGCCAACCAAGAACUUGACCUGUCCACCAAAGUGUACAAAAGGGAAUCAGGAAGUCCUUAUUCUGUGUUAGUGGACACCAAGAUGAGCAAACCGCAUCUCCAUGAAACAGAAGAACAGCCAUAUUUCAGGGAGACAAGAGCAGUGUCUGACGUGCAUGCUGUUAAGGAAGACCGGGAGAAUUCUGAUGACACAGAGGAGGAAGAGGAAGAAGUCUCUUACAAAAGGGAGCAGAUCAUAGUGGAGUGUGUUUCCUGUAACAAAUCGUUCAAGAAACUCUGGUCCCUUCAUGAACAUAUCAAGAUCGUCCAUGGAUAUGCAGAAAAGAAAUUUUCCUGUGAAAUUUGUGAGAAGAAAUUCUAUACCAUGGCUCAUGUGCGGAAACACAUGGUUGCACACACAAAAGACAUGCCAUUUACAUGCGAAACCUGUGGAAAAUCAUUCAAACGCAGUAUGUCACUCAAGGUGCACUCCUUGCAGCAUUCUGGAGAGAAGCCCUUUAGAUGCGAGAACUGUGACGAAAGGUUUCAGUACAAGUACCAGCUACGCUCCCACAUGAGCAUUCAUAUUGGGCACAAACAGUUCAUGUGCCAGUGGUGUGGCAAGGAUUUCAACAUGAAGCAGUACUUCGACGAACACAUGAAAACACACACUGGAGAGAAACCCUUUAUCUGUGAAAUCUGUGGCAAAAGCUUCACCAGCCGCCCCAACAUGAAGAGACACCGCAGAACUCACACAGGCGAGAAGCCCUAUCCAUGUGAUGUGUGUGGCCAGCGGUUCCGCUUCUCGAACAUGCUUAAGGCCCACAAGGAGAAGUGCUUUCGGGUGACCAGCCCCGUGAAUGUGCCACCUGCUGUCCAGAUCCCACUUACAACUUCCCCAGCCACCCCAGUUCCUUCUGUGGUGAACACAGCCACAACCCCAACCCCUCCAAUCAAUAUGAAUCCUGUAAGCACUCUUCCCCCUCGGCCCAUCCCCCACCCCUUCUCACACCUGCACAUCCACCCACACCCUCACCACCCACACCACCUUCCCAUCCCUCCAGUCCCUCACCUCCCGCCACCUCCAGCUCUCUUUAAGAGUGAGCCUUUAAAUCAUAGAGGCCAGAGUGAGGACAACUUUCUGCGGCACCUGGCAGAGAAGAACAGUUCAGCACAGCAUCAUUAACAUCCGUCUCCUUAGUGUGUUCUCCAGGAGACACGUCCCCAUGUGUGAGCGUGCACAGAGGGAGUCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-437.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -469.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 378.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((.(((..((((...)))).))))))..)(................((((((((.((((..........((((....)))).(((.((((..(((((((((...((((((..((((....))))))))))((((..(((..........)))..))))...((((.((((..(((((....)))))....((((....((((....(((((......)))))..))))....))))..(((((........)))))........((((((((((((...)))))))))))).....((((..(((.((((.(((((.(((((((.....(((.((....)).)))..)))))))((((((((((((.((((((((..(((....)))...(((.(((....))).)))..(.(((((.(((....))).))))).).....))).))))).)))))((.....)).(((((.(((((................))))).)))))....(((((((((......).)))))))))))))))...(((.(......((((.....((((.(((((((..((((.((((((((((((((((.((((......((((...((((......)))).....))))......)))).)))))(((((.((...........)).)))))....((((((((....)))).))))....)))))))).)))..))))........(((((((((.(((......(((((((((........(((((((........((((......(((......))).....))))))))))).......)))))...((((((....(((((((.......))))))))))))).((((.(((.....))).))))......)))).......))))))))))))((((((((((((((((.........))))))(.(((.(((((..((.(((((...))))).((((((((..(............(((((((.((((.((............(((((..(((((((......(((((...............))))).....)))))))..)))))..(((.....))))).)))))))).)))(((.((((((((((((........)))).))))...)))))))..)..))))))))...(((((..((((...(((.......)))..))))..))...)))............))..))))).))).)......((((((.......)))))).................))))))))))..........))))))).))))....)))).....))))........))))))))).))).))))..))))))))........................((((.((((((.............(((((.....)))))..(((((((.....))))))).)).)))))))).......))))))))).))))))))))).)))...)))))................(((((((.((......))..)))))))((.((((..(((((......)))))..)))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,(({{(((((..((((((((((((.{,{.(({{{.|,.....,.,..,.{(.(((((((((.................{(((.(((((.{{{{(((((((((((((,(((({{,{{({,{,||||||}}|{{{..{(((({({{((((({{{{.....}}}..,)))))))))}|||}....,}}||,,.,,,......|||,..,.(((((......}}}||,,}}))}}}.......{((((........))))),,|||{{,((((((((((({...}))))))))))).....||||{|{{{{.,,,.|}||{,{{{||||..,..,,,.||},,,,}||}|..)))),}}}}}}}.....((.((((....)))).)},,||,,||(((.(((....))).))}..,,{((((.(((....))).)))))))))).)))).)))))))))))))))}.....(((((.(((((................))))).)))))))))))))).}))))}.}.)...))))},))))..))).))))}...{{{(.,,...}}}}(((((,{,.(((((..,((((((....||||||.|,,,.....{(((.({{.(((((.((.(((.....))))).))))).,||{,|},,((.(((.....})).))..}.})}{((((.(((((......,,|{{{,....}}}}}}|((((((((.....,.........(((((((((.(((......((({(((((........(((((((........((((......(((,.....))).....)))))))))))......,))))}..,|{||{{,,,.(((((((.,....,))))))))))}}}.((((.(((.....))).))))....,,}))).......))))))))))))((((((((((((((((.........)))))).,{((,(((((..((,,{{{....,||||.((((((((..(............{(((((({((((.((............(((((..(((((((......(((((...............))))).....)))))))..)))))..(((.....)))}}.)))),))).))))|({((((((((((((........)))).))))...)))))))..)..))))))))..,((((,..,,||},.(((...,,,.}}},,|}}}..}}}..}}}..........,,,,..}}|||{}||{,.....}||{|||}......)))))}.................))))))))))...,......,.,,,,,.....||..............)))))))),.))))).))))).............}}}}}}}.....)))))..}.))))).(({((((({{({..,,........{((((,....))))}|.(((((((.....))))))),,))))))))))...(((((((........))))))).|,...,|},.,,...)),}}..........(((((((.{(......)}..))))))).,.((((..(((((,....,)))))..)))))}}}
Back