Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF652_0003000
Sequence Length
2790 nt
GC Content
0.4158
ACAGGGUAUGUGUUUACGGUAAUAUUCAUAUGACUCAAGAGGAUAGGUGGGUUGGCUAAACAGCAAUGUGAGGUAUGUCACAAAGCAAAUUAUAUGCCCUUCUAAGCUUUUUAAAAAUUAAUAUUGGAUGGUUUUAUUUUUCUUGGAACCAUAUCAACCUCAUGGUUAUGGUUUCUUAGAAUUUAGACUCCUGUGCAACUGACAUAUAAAAAAUCACCGACUUACUGAGUGAAUGUAGUGAGCUAUGCACAGAACAAAUGUUAAAAUAUUUGGCAACUUUGAAAUUACUCCAAUAAACCUGAAAACAAUUAUAUUUAAACCUAGAUUAUAAAUGAUUUAAGGCCAAGGACAUUUUUCUUCUCUUCUAUAGUUAUGUCAAUUAGCUGUUUUAUUUCCGGGGACCACAAUGCCUGCCCCACUACCCCCUUUGUUCUGCGAGCUCUCACUGUGAUGGACAUGGUGAUUGAUGUUGAAAGAAAGUCAGCCAAUAUAAAGCUCUUGCGUGUUUCAUGCCCAACACGUUGUAAACUAGACUGUAAAGAUCUUGUGGAUAGAGACCGUAUAUUUUGCCAUAUCAGCAUAUUGCGUAGUAUCUAGGAAAAUGAAUGCUGUGCAAUAUUAUUUUAUUCAUCAAAUAUAUACUGUAUGCUAGACACUGUGCUAAGCUCUGAGGAUAUCUCAGUGAACUGGACAGAUGUGGCUUUUGCUGUUGUAAAAUUUAUAGUCUAACAGAAAAUGUUUAUGAAUUCCUGUAAUCCAGUAAAAUAAUGGCUCAUACUGAAACAUUUAAGCAGUUAAAAGCAUUGUAUAUGUAAAGAGUUUAAUAAUUUUGGCCAGGCGUGGUGGCUCAUGCUUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGCCCCAGACAGGUGGAUCACAAGGUCAAUAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAAGAUGGCAAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGUGUGGUGGCGGGCGCCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGAGGCUUAGGCAGGGGAAUCACUUGAACCCAGGCAGCAGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUUGCGUACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGUGAGACUCCAUCUCAAAAUAAUAAUAAUUAUUAUUAUUUAAGCCCUGUUUCUUGUGAUUUAAAUGCAUGCUCUAAAAAGGAAAUAGUGGUAUUACCUGAUUUUUUUCCUCUUUGCUUUUCUUUGUAGAUAAGAUGCUCCCAAGUCCCUUGCAGCUCUCUUCAGAAGAAAAAUCACUAGUGCUCUGCUCUUGCCAUAAUACCAAACCUUUUUGACUCAUGCUUUGGUGCUGCAACACUGGAAGAAUUGCACACAGUUUCCAGGAAUAUCUUUUUUUCAUUUGAGUGAUUCUUUGUGGAUGAGAAAAGAUUUGAGUCUUAAUAAUUACCUUGUUUUAAAGCUAUUUCUUUAUAGUCUGAACUGUUUAAUAAAUUGGGCCACUUACCAAUGAGCCACACAGCCAGUUCUUGUCAGGAGCUGGUUGAAAACUGUGCUGUGCAUGUAGCAGGAAUGGCACAAGAAGAUAGCCGUCGUGGUCAAGUGCCAUCUUCCUUUUAUCAUGGUGCCAACCAAGAACUUGACCUGUCCACCAAAGUGUACAAAAGGGAAUCAGGAAGUCCUUAUUCUGUGUUAGUGGACACCAAGAUGAGCAAACCGCAUCUCCAUGAAACAGAAGAACAGCCAUAUUUCAGGGAGACAAGAGCAGUGUCUGACGUGCAUGCUGUUAAGGAAGACCGGGAGAAUUCUGAUGACACAGAGGAGGAAGAGGAAGAAGUCUCUUACAAAAGGGAGCAGAUCAUAGUGGAGGUAAACCUUAAUAAUCAAACAUUAAAUGUAUCUAAAGGGGAAAAGGGUGUCUCUUCUCAGUCCAAAGAGACUCCUGUUCUUAAGACAAGCAGUGAGGAGGAAGAGGAAGAGAGUGAGGAAGAGGCCACAGAUGACAGCAAUGACUAUGGAGAGAAUGAAAAGCAGAAGAAAAAGGAGAAGAUAGUAGAGAAAGUCAGCGUUACACAAAGGAGAACCAGGAGAGCUGCCUCUGUUGCCGCAGCUACCACUUCCCCUACUCCCAGAACUACAAGAGGUCGUAGGAAGAGUGUAGAGCCACCUAAGCGUAAGAAGCGGGCCACAAAGGAGCCCAAAGCACCAGUCCAGAAAGCUAAGUGUGAAGAGAAAGAGACUCUGACCUGUGAGAAGUGCCCCAGGGUAUUUAACACUCGCUGGUACCUGGAGAAGCACAUGAACGUUACUCAUAGGCGCAUGCAGAUUUGUGAUAAAUGUGGCAAGAAGUUUGUCCUGGAAAGUGAGCUGUCCCUUCACCAGCAAACAGACUGUGAAAAAAACAUUCAGUGUGUUUCCUGUAACAAAUCGUUCAAGAAACUCUGGUCCCUUCAUGAACAUAUCAAGAUCGUCCAUGGAUAUGCAGAAAAGAAAUUUUCCUGUGAAAUUUGUGAGAAGAAAUUCUAUACCAUGGCUCAUGUGCGGAAACACAUGGUUGCACACACAAAAGACAUGCCAUUUACAUGCGAAACCUGUGGAAAAUCAUUCAAACGCAGUAUGUCACUCAAGGUGCACUCCUUGCAGCAUUCUGGAGAGAAGCCCUUUAGAUGCGAGAACUGUGACGAAAGGUUUCAGUACAAGUACCAGCUACGCUCCCACAUGAGCAUUCAUAUUGGGCACAAACAGUUCAUGUGCCAGUGGUGUGGCAAGGAUUUCAACAUGAAGCAGUACUUCGACGAACACAUGAAAACACACACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-776.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -829.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 616.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....(((((((((((.((((((.(((((.((..((...(((.(((((((((((......))))..(((((......)))))..(((.......))).(((((..((((((((........(((((((((((((((...((((.(((((((((...(((....))))))))))))..)))).........(((((((.((.((((((......((((((......)).)))))))).)).))...)))))))..(((((((....))))))).......)))))))).)))))))..(((.(((.((.(((((((((....)))).))))).)).))).)))...............((((((.((((((((((........((((((...(((((((((.............))))..((((((((.((.(((((......((((((((.....)))))))).((((.((.....)).))))(((..(((.(((((((((((((((........))))))).........((((((..((((.((..((((.(((.((((.((((((((.....(((.((((((((((((((.((......)).))))))))))))))......((((((.((((((...((((....(((((.((((.(....(.(((((.....))))).)....).)))).(((((.((((((....)))))).))))))))))))))...))))))))))))..))).......))))))))))))))))).))..)).))))..))))))....((((.....)))).)))))))).)))(((((((((((((.((((((((..(((((((.((((.(.(..((((((...))))))..).))))).)))))..))..))))....)))))))))))))))))))).....((((((.((((........................)))).)))))).(((((...((((........))))....))))).((((..((((((..((((((((....(((..(((((((.((.......)).))))))))))..))))))))....))))))..))))......((((((((((....))))))))))..((((((((((((........................))))))))).)))..........(((((((((((((.(((((((.(((.....(((..(((((..((((((((((((.(.(.(((((..................(((((((((.................((((.(((((.(((.((((((((((((((((((..((((....)))))))))((..((((((.((((((((((((.....)))...)))))))))(((((....))))).........(((((......(((((((((..(((((....))))).......(((((........))))).(((.(((((((((((((((...)))))))))))).....))))))..((.....)))))))))))))))))))))).)).....((((((((...............((.((((....)))).))))))))))(((.(((....))).)))....(((((.(((....))).)))))))))).)))).)))))))))))))))).....(((((.(((((................))))).))))))))))))))..))))).).)...)))).)))))..))).)))))...)))....))).))))))))))))))))))))((((((....))))))))))).)).)).)).))))..((((......((.........))......)))))))))..(((.(((.((((((.((.........((((.(((((...((.....))....))))).))))...)).))))))))).)))......)))))).))))))))))))))))))))))))))))).....((((......((((.(........).))))....(((.(((...((..((((((..(....)..)))))).))..))).))).)))).....(((((.....((....))....)))))..))))))).((.......))(((((......).))))...((((.(((.......)))..))))..((((.......)))).(((.((((((((((((....)))))))....))))).))).)))...))..)).))))).))))))..)))))))))))....((((.((....)).))))..(((((((.((((.(((.((....)).)))..))))...)))))))((.......))..)(((((((((((.(((......(((((.(((.....(((....(((((((...............(((((((((.(((((((((....)))).)))))..))))))).)).(((((((((((((((.(((((((((.(((......(((((((((........(((((((........((((......(((......))).....))))))))))).......)))))...((((((....(((((((.......))))))))))))).((((.(((.....))).))))......)))).......))))))))))))..........((((((.........)))))).)))))))....))))))))..))))))))))..))).)))))..))).)))...))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(....(((((((((((.((((((.(((((.((.,((...(((.((((((((((({{{...,,||..(((((......)))))..||....,...,}|,(((((..((((((({........(((((((((((((((...((((.(((((((((..,(((....))))))))))))..)))).........(((((((.((.((,(((,.....((((({......}).)))),))),)).))...)))))))..(((((((....})))))).......)))))))).)))))))..(((.{((.((.(((((((({....}))),})))).)).))}.)))....,{,.....||||(((({{((((((((((,....,,.{(((({.,.,{{,{((({........{{{{{||||{{.(((,,{{.{{.{{{{{(((((.((((((((.....)))))))|,{{,,{(({{.......)))}}},,,....|||||,,(((((((........))))))}.,...,{.,((((,,..}},|}},}|{{.((((({(,(,...((((((({,......((((((((((((((,{{......}).)))))))))))))}((({..((((.,...((((((((,,,,{(((..{{{((((.(....(.(((((,...,))))).).,,,|,|}||.|||{(,((((((,,..}}}}||,||||||,},||||,...,))))))))))),.}}},..,,}})),,,,,||||,,||{..,})}..}))),..))))),...})))).)))))))).,.))))..}))){{(((((((((((.((((((((..{{(((((.(((({(.(..((((((...))))))..).))))).)))))..}}..))))....)))))))))))))))))))))))}.,|||||}||||,....................}}})))).))))))}(((((...((((........))))....))))).((((..((((((..((((((((....(((..(((((((.((.......)).)))))))))),.))))))))....))))))..))))......((((((((((....))))))))))..((((({((((((.,,,,,......,.,,,{,,....|||}||||}.}}),}}.}}}{{{{((((((((((((.(((((((.(((.....(((,.(((((..((((((((((((.,.(.(({{{.,,.....,,,....{(.(((((((((.................{(((.(((((.(((((((((((((((((.(((({{,{,({{{{||||||,||({,..((((((((((((((({{(.....}}}...))))))))))))}}....,}}||,,.,,......,|||,..,.(((((......}}}}},,}}))})}.......{((((........))))),,{|{{{,((((((((((({...})))))))))))....,||||{|{{{{...,,}}},|,|||||||,.,..,,,.}}}}},,}||||,.)))).,}}}))).....{(.((((....)))).)),,|},,||(((.(((....))).)))...,|((((.(((....))).))))}))))).)))).)))))))))))))))}.....(((((.(((((................))))).)))))))))))))).)))))}.).)...))))},))))..))).)))))..,)))....))).)))))))})))))))))))}||{(({....})))))))}}},}},}},}|{||,,..|}||.........,{{|...,))),,.,,,}})))}}.,}|||(((((((((((.((........,((((.(((((...((.....))....))))).)))).}.)).)))))))))))),}),}.,)))))).)))))))))))))))}})))))))}}}))....,}}.}..,.,.||,,.,..,}}},}).||||,{...((.,..}}.({..((((((..{....)..)))))).}|,{||,.(((((.,((............))..)))))..)}))))}}..))))))).((.......))(((({.,...,}.))))...((((.(((.......)))..))))..((((.......)))).(((.((((((((((((....)))))))....))))).))).)))...)}..)).))))).)))))},.)))))))))))...,((((.((....)).)))),.(((((((.((((.(((.((....)).)))..))))...))))))){{.......,)..)(((((((((((.(((......{{(((,{,({{...(((....(((((((..,...,,.......{{((((({{.|((((((((....)))),}))),..}}}}}}}.},.{{{{{{(((((((((.(((((((((.(((......((({(((((........(((((((........((((......(((,.....))).....)))))))))))......,))))}..,|{{{({,,,.(((((((.,....,))))))))))}}}.((((.(((.....))).))))....,,}})).......))))))))))))..........((((((.........)))))).))))))))}..,}))))))..))))))))))..}))}))))).,))).)))...))))))))
Back