Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZNF652_0004900
Sequence Length
1464 nt
GC Content
0.4460
UGCCAUCUUCCUUUUAUCAUGGUGCCAACCAAGAACUUGACCUGUCCACCAAAGUGUACAAAAGGGAAUCAGGAAGUCCUUAUUCUGUGUUAGUGGACACCAAGAUGAGCAAACCGCAUCUCCAUGAAACAGAAGAACAGCCAUAUUUCAGGGAGACAAGAGCAGUGUCUGACGUGCAUGCUGUUAAGGAAGACCGGGAGAAUUCUGAUGACACAGAGGAGGAAGAGGAAGAAGUCUCUUACAAAAGGGAGCAGAUCAUAGUGGAGGUAAACCUUAAUAAUCAAACAUUAAAUGUAUCUAAAGGGGAAAAGGGUGUCUCUUCUCAGUCCAAAGAGACUCCUGUUCUUAAGACAAGCAGUGAGGAGGAAGAGGAAGAGAGUGAGGAAGAGGCCACAGAUGACAGCAAUGACUAUGGAGAGAAUGAAAAGCAGAAGAAAAAGGAGAAGAUAGUAGAGAAAGUCAGCGUUACACAAAGGAGAACCAGGAGAGCUGCCUCUGUUGCCGCAGCUACCACUUCCCCUACUCCCAGAACUACAAGAGGUCGUAGGAAGAGUGUAGAGCCACCUAAGCGUAAGAAGCGGGCCACAAAGGAGCCCAAAGCACCAGUCCAGAAAGCUAAGUGUGAAGAGAAAGAGACUCUGACCUGUGAGAAGUGCCCCAGGGUAUUUAACACUCGCUGGUACCUGGAGAAGCACAUGAACGUUACUCAUAGGCGCAUGCAGAUUUGUGAUAAAUGUGGCAAGAAGUUUGUCCUGGAAAGUGAGCUGUCCCUUCACCAGCAAACAGACUGUGAAAAAAACAUUCAGGUAGGUUUCAUCACCGAGAGGGAAAACUUUUCAGGAUAGAACCUGGCUGUUCAGAUUCAUCUGGUAUCCGCCCAAGAGAAUAAAUGCAAUAGAGGCUGAAGGGACAGUUUUCACCAAUUUAUCAUUUGAAAAGCUCCUGCUUUGGUCUUUUCUAAACCAAGGCUUUUAUUUCAAAAGCAUUAAAUUUGACGCUGGACUAGUGGGAACCCAGGCACACUGGAAGGGGGAUCUGUUAUAGUUGAUUGACCAGGAGGUUAAAAUCAACACCAACUUUGCACUGAGAUUCACUGUUGUAGGACGUGUAAUAGAAUUCAUUCUGGCAUCUUCUCUGUGGAGGUAGGAGUUACUGAUUAAAGGUUAGGAGUAGAGAAAGGUCCCUUUCUGGGUUUACAAGGAUGCCAGAUUCUAGUACAGCUGAUGGGGACAAAAACCAUAAUGACUCAGACCGGUGGAAAUGGAAGAUCUUCAGCAGUGAGUUUGCUUUUACCAUUGGAGAGAUGACAACACUAAAUUUGCCAAGAGGCUGAGCCCAUGGGAAUAUGCAAACUUUAAGCAGAGGCUGAGCUGGUCGAAAAUGUUGCCCACCUGGCAGUAGGGUUACAUAAUGCCACUGUACAGUAUUGUUAAGGUAACAAAAUAACGGUAUUCAAACCAGGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-391.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -421.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 402.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((....(((((.((((((((..(((....)))...(((.(((....))).)))..(.(((((.(((....))).))))).).....))).))))).)))))((.....)).(((((.(((((................))))).))))).)))))))(.(((((...((.(((((((((.....((((((...((((((..(..(((((((((((....(((((((.(((.(((((...(((((.(((((((((((((((....))))..........)))))..)).))))..(((((((..(((((((((((((((.((.........((((.(((((...((.....))....))))).))))...)).))).))))))).)))...((((.......(((((.................................))))).......))))............((....)).....((((((..(....)..)))))).))..))))))).))))).(..((((((.(((((.(((..(((((.((((.((.(((..((.......))(((((......).))))....(((.(((((((((((((..(.((....((((.((((((...(((.((((((((((((....)))))))....))))).))).((.(((.((((...((.(((((..((((((((.......).)))))))..)))))..))....)))).))).))...((((((((((((((((((........((.(((.......))).))((.(((((((.(((.(.((((((.....)))))).)))).))))))).))((....((((.((((((....)))..)))))))....))......)).))))))))))))..))))(((........))).(((((....)))))))))))))))..)))..))))))....(((((.........)))))..))))))).))).....((((.....))))..))))).)))).....(((((((((((....)))))..))))))....)))))...))).)))...)).))))))..).))))).))).))).))))....)))))))))))..)...)))))).((((((...))))))............((((((.((.((.(.(((.(((((.....))))).))).).)))).))))))..............(((((.((((((....((..(..(((((((..(((((......)))))..)))))))..)..)).))))....((.(((.(.(((...)))).))).))..(((.........)))..))))))))))))).....(((((((.((((((((((..(((........)))))))).)))....))...)))))))...))))))))).))...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({(((((({{{{{((.((((,,,.}}}}.,,.,{{,...(((,(((....}}}.||,..,.(((((,(((...,}}}.}}|||,|.,,.|}})|)),}},}|||,({.....}),|((((,{{{{|,,,....,,.,,..,.}}}}}.))))}....{{{{{|{||,,...,).}})))))),,||||||{((((({(((((({.{.,((({{{{{{({.,,{(({,{{,.|||,|{{|,...(((((.((((((({(((((((....))))..........)))},.,)).))))..(((((((..{((((((((((((((.((........,((((.(((((...((.....))....))))).)))).,.)).)))))))))))),}).,.((((.,{..,,((({{.................................}}}}}......,)))),}}}},......((....)).{,..((((((..{....)..)))))).))..))))))).))))).{..((((((.(((((.(((..{((((,((((.((.(((..((.......))(((({.,...,}.))))....(((.((((((({(((((..(,((,.{{((,,,,{{{||,,.(((.((((((((((((....)))))))....))))).))).(({((({,(((...,,...|||.}}},|||}|,,,,.,,}.,}}||||{{{|||,{{{{{,..,}))}))},||...(,((((((((((((((((.,......,,.{{(.......}}}.,|((.(((((((.(((.(.((((((.....)))))).)))).))))))).))|,....((((.((((({....}}),.}))))))....},......)).))))))))))))}},),)|||}}}}}}}},||,(((((....))}}|||}}}}}})}..))),.)))}}}....|||||.,,......,}))}..))))))).))).....((((.....)))).}))})).}))}.....(((((((((((....))))}..))))))....})))).}.))).)))...)).))))))..},)))}},))),))).)))),,..))))))})))),.|{{,}|||||,(({{{,...||||,},,,,........((((((.{{.,({({(((.(((((.....))))).))).),)))).)))))).....,,....,,}))).,)))|||||,,|,|},,|}|{|{{,((.,,(((({{{{.,,,.|{{|||{,|||,|,....,,.....,{,(((....}||..,,|)}}}})..,...}}}}}))}...}),,.)))}}|||||||}|,,..|{||{{|||||{{{{(((.,(((.....,,,|)}}}}}}.}}},.,|||,,.}})))))...,.,,}})})},..)))}})))
Back