Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZZZ3_0000900
Sequence Length
2774 nt
GC Content
0.3864
UUAUCAGAGACUAUUACAGACGAUUGCUGUACUCGAGGCUCAGCGUUCUCAAGCAGUCCAAGACCUUGAAAGUUUAGGCAGGCACCAGAGAGAAGCACUGAAAAAUCCCAUUGGAUUUGUGGAAAAACUCCAGAAGAAGGCUGAUAUUGGGCUUCCAUAUCCACAGAGAGUUGUUCAAUUGCCUGAGAUCGUAUGGGACCAAUAUACCCAUAGCCUUGGGAAUUUUGAAAGAGAAUUUAAAAAUCGUAAAAGACAUACUAGAAGAGUUAAGCUAGUUUUUGAUAAAGUAGGUUUACCUGCUAGACCAAAAAGUCCUUUAGAUCCUAAGAAGGAUGGAGAGUCCCUUUCAUAUUCUAUGUUGCCUUUGAGUGAUGGUCCAGAAGGCUCAAGCAGUCGUCCUCAGAUGAUAAGAGGACGCUUGUGUGAUGAUACCAAACCUGAAACAUUUAACCAGUUGUGGACUGUUGAAGAACAGGUAAUAAAUAUUUCAAAAUCGUGUAGGCUUAAAAAAACAAGUAAACAGUUAACAUCAGAGUCAGUAUUAUGAGGCCAGGUCCAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAUAUGGGUGGAUCACUUGAAGUCAGGAGUUCAAGACCAACCUGGCCAACAUGGUGAAACCCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCGGGUGUGAUGGCGUGUGCAUAUAUAAUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGCAGAGGUUGCAUUGAGCCAGGAUCAUGCCACUGCACUCCAGGCUGGGCAACAGAGUGAGACUCCAUCUCAAAAAGAAAAGAGCCUGUAUUUUGAGUCAGGUGUAUAUUGUUGUAUGUGAUGCCUGUUAGCCAUGAGUUUUAAAUAUUUAGGCUUAUUUUUGUAUACCUUUUUGCAUACGUCAAGAAUUUUGGAUUUUGAGAAUGUGUAAACUUUUGUUUGGGGAUAAUUUUAAAAGAAGGAACCUGGGUUUUGAGAGGGGAGUAGAAGUGGAUAGAAUAAAAUAGAUGUUUUUGUAAUGUAGCUUUGGGAGAGAGAAAAACCUGAGGCCAGUAAAGCUGAGCUUCAAAGUGCAUUCUUAUUUUUGUUGUCGAAGGGAGGUGAGGAAGUCAAGUCAGUUUUGGCAUACAGUUUAGAAUUGUUUUUUGGCUAAUGGCUAGGGUUGUUAGUGGGUGAAGUUUGAGGCACAUCUUUGUCUCAUAUGGCUAUUAACCCCACAGCUAUACAUUUAACAGUUUAUAAAAAGCUUUGGGAAAUCUAUUUAUUUCAAGCAUCCAGAUUUUUCUGCAUCUUUAGGACUAUGAGAAGAUACAGGAGACAAGAAGGAAUAUUAAAAUCAAAUAUUUGAAUAAAGGACCAUACAAAAGAAGGAAAAGCCUCUUUUAAUAGUCGAAAUUUAAGUGAAUUUACACGUUUUUGUUAAAACUGUAGGGGAAAGAAAAGUAAGAAAAGAUUGACCAUCUUUUCUUGGAUUUCAGUGGAUUUAGUGAUUUCAGUGGAAAUCACUAAAAUGUGUAAUCUACCAAUUUGUUUACUUAUUUUCUGUUUUCUUAUGAGAUAUUUUUACUUAUGUGAAUAGAAAACUUUUCUAAGCUCUUUCAUAAGUUUAUUCUCUAAUUUCAUUGUUCCCUGUGAAGUCUUAAGUUUCUAACUAGAAAUUUUUCCUACCAUGAGGAUUUCUAAUUACGUAACCCCCAAAGGUGGGAGAGAGUAUUACAUUUUGAAAUGAAAUGUGAAUGUAUUUAUUUAGAAAUCCAAUAUUUAAAAUUAAAUACAUAUUUUCUUAAAUUUGGUCUUGGGUAUGGCUUAGAAAAAGCUGGAACAGCUACUCAUCAAAUACCCUCCUGAAGAAGUAGAAUCUCGACGCUGGCAGAAGAUAGCAGAUGAAUUGGGCAACAGGACAGCAAAACAGGUUGCCAGCCGAGUACAGAAGUAUUUCAUAAAGCUAACUAAAGCUGGCAUUCCAGUACCAGGCAGAACACCAAACUUAUAUAUAUACUCCAAAAAGUCUUCAACAAGCAGACGACAGCACCCUCUUAAUAAGCAUCUCUUUAAGCCUUCCACUUUCAUGACUUCACAUGAACCGCCAGUGUAUAUGGAUGAAGAUGAUGACCGAUCUUGUUUUCAUAGCCACAUGAACACUGCUGUUGAAGAUGCAUCAGAUGACGAAAGUAUUCCUAUCAUGUAUAGGAAUUUACCUGAAUAUAAAGAACUAUUACAGUUUAAAAAGUUAAAGAAGCAGAAACUUCAGCAAAUGCAAGCUGAAAGUGGAUUUGUGCAACAUGUGGGCUUUAAGUGUGAUAACUGUGGCAUAGAACCCAUCCAGGGUGUUCGGUGGCAUUGCCAGGAUUGUCCUCCAGAAAUGUCUUUGGAUUUCUGUGAUUCUUGUUCAGACUGUCUACAUGAAACAGAUAUUCACAAGGAAGAUCACCAAUUAGAACCUAUUUAUAGGUCAGAGACAUUCUUAGACAGAGACUACUGUGUGUCUCAGGGCACCAGUUACAAUUACCUUGACCCAAACUACUUUCCAGCAAACAGAUGACAUGGAAGAGAACAUCAUUUACUAGUCCUCUUCAACACAUAGCAAUGGUAUCAUUGUUAAUUAUGUGCACAGUUUGGAAAGAUUCUCUGCUUUCCCAGAAAUGACACUCACAGCAUGAGAGCUUCCUGAGUGUUCUCGUCAAGUACAGCUCUGCACCGUUGUGGCUCUAGAUCACUGUUCAGCAGCUGAACAUUCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-739.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -791.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 757.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((.((((.((........((((((((((((((...))(((((..(((((((((.(((.(((((.((((((((((((...........)).)))..((((((....)))))).((((.....))))....((((((((((((((..((((((((.(.(((..((((....))))..))).)...))))))))))))))).....))))))).(((((..((((((.((.........((......))...(((((..........))))).........((((((....)))))).(((......)))((((..(((((....)))))..)))))).)))))).))))).....((((((..(.......)..))))))(((.((((.(((((((.........))))))).)))).)))..........)))).))).)))))...))).)))))))))..)))))((((((..............((((((.((((....((((((((....(.((((.((((.((((.(((((((((..((((.(.(((.....((((((((....((((((....))))))(((((((..((((...(((((((..((((((.(((...)))...))))))...)).))))).))))................))))))))))))))))))).)).))...))))))....)))))))((((((((.....((((((..((((((.....(((..((....(((((....((((.(((...(((....))).))).))))..)))))....(((((.....))))).........(((..(((((..(((((..(((((...(((((((((..((((((....((((.(((((.......)))))))))((((((((((......((((((((..((((((........))))))...))))))))(((((.((((((......)))))).)))))..(((..........)))(((((.((((((((((((......((((..((((((((((((((((.((((.........(((((..(((((....((((((((........)).(((((((((((.((....)).))))))))))).((((((.....))))))..((((((...))))))...))))))..))))).)))))((((((((.....((.(((((((......))))))).))..)))))))))))).)))))))...........)))))))))..)))).....))))))))))))..)).)))......((((((.(((((((((..(((((((((((((((.((((((((((((((......((((....))))......(((.....((((((.((.....))))))))....)))((((..((((((((((((((.(((((....))))))))))......((((..(((((((((((.....)))))))))))..)))).(((((((((((((((((....))))))))))........)))))))......))))))))).))))......(((((((((....(((((....)))))((((((...)))))).....)))))))))..)))))).....))).))))).)))))...)))))((((((((....)))))))).((((......))))(((((((...((((.((((((((..(((((((.....(((((((((.....)))))))))(((((((((((((((.........))))))..)))))))))..)))))))..)))))....)))))))..))))))).(((((...))))).))))).........))))))))).)))))).((((..((((((((...........((..(((.....)))..))..........))))))))))))))))))))))........((((......))))))))))...))))..))))).)))))..))))).)))))..)))......(((.((........)).))).))..))).....))))))))))))..))))))))...((((((......)))))).(((((.......))).))..)))).)))).)..))))))))...)))))))))).(((((.(((.......))).))).))((....))((((((((.....)))))))))))))).........(((((.....)))))...........((((((((...((((((........)))))).((((((.(.((...(((((((((....(((.(((.........(((((((...((((((((..(((((.((((.(......).)).)).)).)))....)))))))))))))))........))).))))))))))))...)).).))))))..((.......)).......(((((....)))))..(((((((......((((......))))))))))).(((((...((.......))..)).)))......(((((((...(((.(.(((((((((((((.((...........)).))))))......((((((((....))))))))..))))).))).))))))))))....)))))))).........((((((((.(((......)))...))))))))))))...))))))))........)).)))))))).))).)((((((((...))))))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((((.((((.((.{......((((((((((((({,,,|,((((({,{((((((({.(((.(((({.(((({(({((((..{...,.}..)).)))..,{((((....))))}|.((((.....)))).,..((((((((((((((..((((((((.{.(((..((((....))))..))).}...))))))))))))))).....))))))){(((({,,((({{{.{{.|||..,..{{.,....|,...{{{{(,,,,,....,|||||{{{((,{..((((((....)))))).{{{,,,,,.}}}((((..(((((....))))).,}}}}}}.)}}}}}.,}}}}.||,,((((((,.{,,....,},.))))))(((.((((.(((((((.........))))))).)))).)))......,...)))|}}}}.})))}...))}.})))))))),,)}}})||{{{,..............((((((.((((....((((((((....{.((((.((((...(((.((((,,{,.((((({{,,,,,{|||((((((((....((((({....})))))|||{{((,{{(({{,.(((({((,.((((((.({{...}}}...))))))...},.)))}}.,}}},...............}))))}}))))}}}|{{({,{{,|}.,.,,},,,}}}.))))},.((((((((.....((((((..((((((((((((((..{,....(((((..,.((((.(((...(((....))).))).)))).,)))))...,(((({.....})))}...{{{{{.((((((({(({{.((,((((((,,(((,.,,,,,||,,,}})}}))}..}}}.|||,|}..}}}})}.})))))).}}))},,....,,.{(((((({..((((((........))))))...})))))}}(((({.|{({{{.....,)))))},))))}..))))))))|(((((((((((({((((((((((((......((((..((((((((((((((((.((((.........,{{{((((((((((...)))).)))))}....,,.(((((((((((.((....)).))))))))))).{{{(((.{{,,||||||..{{{{{|.,,)))))}..|||||||..,))))}))}},((((((((.{...{{.(((((((......))))))).}),.)))))))))))).)))))))...........)))))))))..)))).....)))))))))))).(((.((.((({..,(((((.(((((((((..,((((({{,((((((.((((((((((((({,,....,,,|.,|||}||,,....(((.,,..((((({,((.....)))))))).,,.))){{{|,,{{{((({{{{((((.(((((....)))))))))},.....((((..(((((((((((.....)))))))))))..)))).(((((((((((((((((....))))))))))),......,))))))......}}))))))}.||||{{{{{,{,{((((({,,....|||||||}.}}}||||||,,.}))))},,,|,,,.}}}}))},)))))},...,))).))))).)))))}...))))|(((((((....)))))))}.((((......)))){((((((...(((,,((((((((..{{{(((({,...(((((((((.....)))))))))((((((((({((,{({{,.....,))),}),.))))))))),}))))))}..)))))....)))))))..))))))}.(((((...))))).,}},,.........))))))))).))))))))).)).))).{{........}}....,.....((((((.,{.........)..)))))).{{{.,((((.{,,}},,}}}....,{({......}}}|{{....)},))}}..))).......,.............)))))}.....(((,{(........)),}}}....,))))))),,)))))))))))..))))))))...{(((((......)))))}}}))),}}},}}}).)})...)))).)))).,..))))))))...)))))))))).,,{((,(((,,,,,.,||},|}}.||{{....}}((((((((.....)))))))),}}}|||,,,.....{{(({.....))}}}.....,,,...{{{|||,,..|||||{{....,,..||||||{{{((.{{{{{{,..|{,{((((.,{{,{({{({({,{,|||,}|||,||{|||,,.{{|||||,|}.{{(((..{||||{{{.,,||}},,{({{{((((((((||{{{||(((({{{(({(,,,,{.{{{||...,}...,)))}}.))))}})},.,}))}}......,.(((((....))))))))))))))))}..,||,(({{{..,...,,)))))..)))).,,)))},..,))))))).}})},,}},|||||{|||...,....},,,}}||{{{{.{{.,,.....,,,)).))))))..((((((((((((....))))))},..})))))....}}}}||||||....}}},))))},},,....{(((((((.(((......)))...)))))))}))))...))))))))........)).)))))))).))).)((((((((...))))))).....)
Back