Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ZZZ3_0001500
Sequence Length
2835 nt
GC Content
0.4113
UGUAUCAGGCUUUUAAGAAACACUGCAGGAUCCUGUCUAUCUUAAUGCUGAUAGAGCUCAGCUAAAAAUUUAGGAGGUUCUAGUAUUCUUCAUGGCUGAAGCUGAGAGAGUCUGAAACCCUGAUGCUUAAGCUCCAUUCUAGAUCAUAGCUCCAACUCCUUCAGGAUAUAAGGAAAAGAGAUUAUAUUUCCACAAUGAUAGAUCUUUGGUUGUACAGGUUUCCCAAUGAGUGGAUCAUGAUGACCGUAUUGUAGGGACUUGCCAUAGUAUGGCUGCUUCCCGAUCUACUCGUGUUACAAGAUCAACAGUGGGGUUAAACGGCUUGGAUGAAUCUUUUUGUGGUAGAACUUUAAGGAAUCGUAGCAUUGCGCAUCCUGAAGAAAUCUCUUCUAAUUCUCAAGUACGAUCAAGAUCACCAAAGAAGAGACCAGAGCCUGUGCCAAUUCAGAAAGGAAAUAAUAAUGGGAGAACCACUGAUUUAAAACAGCAGAGUACCCGAGAAUCAUGGGUAAGCCCUAGGAAAAGAGGACUUUCUUCUUCAGAAAAGGAUAACAUAGAAAGGCAGGCUAUAGAAAAUUGUGAGAGAAGGCAAACAGAACCUGUUUCACCAGUUUUAAAAAGAAUUAAGCGUUGUCUUAGAUCUGAAGCACCAAACAGUUCAGAAGAAGAUUCUCCUAUAAAAUCAGACAAGGAGUCAGUAGAACAGAGGAGUACAGUAGUGGACAAUGAUGCAGAUUUUCAAGGGACUAAACGAGCUUGUCGAUGUCUUAUACUGGAUGAUUGUGAGAAAAGGGAAAUUAAAAAGGUGAAUGUCAGUGAGGAAGGGCCACUUAAUUCUGCAGUAGUUGAAGAAAUCACAGGCUAUUUGGCUGUCAAUGGUGUUGAUGACAGUGAUUCAGCUGUUAUAAACUGUGAUGACUGUCAGCCUGAUGGGAACACUAAACAAAAUAGCAUUGGUUCCUAUGUGUUACAGGAAAAAUCAGUAGCUGAAAAUGGGGAUACGGAUACCCAAACUUCAAUGUUCCUUGAUAGUAGGAAGGAGGACAGUUAUAUAGACCAUAAGGUGCCUUGCACAGAUUCACAAGUGCAGGUCAAGUUGGAGGACCACAAAAUAGUAACUGCCUGCUUGCCUGUGGAACAUGUUAAUCAGCUGACUACUGAGCCAGCUACAGGGCCCUUUUCUGAAACUCAGUCAUCUUUAAGGGAUUCUGAGGAGGAAGUAGAUGUGGUGGGAGAUAGCAGUGCCUCAAAAGAGCAGUGUAAAGAAAACACCAAUAACGAACUGGACACAAGUCUUGAGAGUAUGCCAGCCUCCGGAGAACCUGAACCAUCUCCUGUUCUAGACUGUGUUUCAGCUCAAAUGAUGUCUUUAUCAGAACCUCAAGAACAUCGUUAUACUCUGAGAACCUCACCACGAAGGGCAGCCCCUACCAGAGGUAGUCCCACUAAAAACAGUUCUCCUUACAGAGAAAAUGGACAAUUUGAGGAGAAUAAUCUUAGUCCUAAUGAAACAAAUGCAACUGUUAGUGAUAAUGUAAGUCAAUCUCCUACAAAUCCUGGUGAAAUUUCUCAAAAUGAAAAAGGGAUAUGUUGUGACUCUCAAAAUAAUGGAAGUGAAGGAGUAAGUAAACCACCCUCAGAGGCAAGACUCAAUAUUGGACAUUUGCCAUCUGCCAAAGAGAGUGCCAGUCAGCACAUUACAGAAGAGGAAGAUGAUGAUCCUGAUGUUUAUUACUUUGAAUCAGAUCAUGUGGCACUGAAACACAACAAAGAUUAUCAGAGACUAUUACAGACGAUUGCUGUACUCGAGGCUCAGCGUUCUCAAGCAGUCCAAGACCUUGAAAGUUUAGGCAGGCACCAGAGAGAAGCACUGAAAAAUCCCAUUGGAUUUGUGGAAAAACUCCAGAAGAAGGCUGAUAUUGGGCUUCCAUAUCCACAGAGAGUUGUUCAAUUGCCUGAGAUCGUAUGGGACCAAUAUACCCAUAGCCUUGGGAAUUUUGAAAGAGAAUUUAAAAAUCGUAAAAGACAUACUAGAAGAGUUAAGCUAGUUUUUGAUAAAGUAGGUUUACCUGCUAGACCAAAAAGUCCUUUAGAUCCUAAGAAGGAUGGAGAGUCCCUUUCAUAUUCUAUGUUGCCUUUGAGUGAUGGUCCAGAAGGCUCAAGCAGUCGUCCUCAGAUGAUAAGAGGACGCUUGUGUGAUGAUACCAAACCUGAAACAUUUAACCAGUUGUGGACUGUUGAAGAACAGAAAAAGCUGGAACAGCUACUCAUCAAAUACCCUCCUGAAGAAGUAGAAUCUCGACGCUGGCAGAAGAUAGCAGAUGAAUUGGGCAACAGGACAGCAAAACAGGUUGCCAGCCGAGUACAGAAGUAUUUCAUAAAGCUAACUAAAGCUGGCAUUCCAGUACCAGGCAGAACACCAAACUUAUAUAUAUACUCCAAAAAGUCUUCAACAAGCAGACGACAGCACCCUCUUAAUAAGCAUCUCUUUAAGCCUUCCACUUUCAUGACUUCACAUGAACCGCCAGUGUAUAUGGAUGAAGAUGAUGACCGAUCUUGUUUUCAUAGCCACAUGAACACUGCUGUUGAAGAUGCAUCAGAUGACGAAAGUAUUCCUAUCAUGUAUAGGAAUUUACCUGAAUAUAAAGAACUAUUACAGUUUAAAAAGUUAAAGAAGCAGAAACUUCAGCAAAUGCAAGCUGAAAGUGGAUUUGUGCAACAUGUGGGCUUUAAGUGUGAUAACUGUGGCAUAGAACCCAUCCAGGGUGUUCGGUGGCAUUGCCAGGAUUGUCCUCCAGAAAUGUCUUUGGAUUUCUGUGAUUCUUGUUCAGACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-735.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -794.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 741.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.......((((((........((((.((.((((((((........(((((......)))))........(((((((.(((..(((((((.....((((((..((((((((((.....((((..(((.....(((.((((.(((((((((((....((((((.((......(((((..........))))).........((((((.((((((((.(((((....(((((((((((..((.(.(((((((((.((......)))))))))))...).))..)))))))))))......))))).....(((((((..((.((..(((....)))....)).))..)))))))((((..((((....))))..))))(((((....)))))..........)))))))))))))).))...)))).))...))).)))))...))).)))).)))........(((.....)))(((........))).....((((((.(...).)))))))))..))))......))))))))))))))))..))))))).......((((((((((....((((((((((((..(((.........))).))))).)))))))...........))).)))))))...((((((...........))))))...))).))))))).......)))).)))).)).)))).....)))))))((((..(((((((.((((((((..((((((((((....(((.....)))..))).((((((((.....(((((((((..((((.(((((.(((((..(((...((((..((((...((....(((((....((((((((....((((.(.....).))))...(((((((.((((((((......))))))))...(((((.((((((((..(((.((((((((.(................)))))))))..(((((..((....)).)))))((((..((((..........))))...))))....((((.......)))))))..))))))))))))).....((((.((((((....((((.(((.(((((((.(((((.((((................)).)).))))))))))...)).))).))))(((((.((....)).))))).))))))))))(((((...(((((((((((....(((((((((((((((..(((....(((((((((...(((.(((((((..(((...((((..((.................))..))))...))))))).))))))....))))(((((..........)))))((((((((.(((((((((((....(((((((((((............))).))))))))....((((.((.((((((....(((((((((..(((((...)))))...(((((.......(((((......)))))...(((...((((((((((.....((((((((((((...............))))).)))....))))....)))))).))))))))))))...((((.......))))..((((((((....(((((((........(((..(((((((.(...........(((((((((((((..((.......))..)))))).)))..........((((......)))).........))))......((((((.((((..............))))))))))(((.........)))........(((((((((((((.(((((.(....))))))(((((((((..(((.(((((.(((((....((((((.........((.((((.((((..(..(((.((...((((((....)))))).((((.....)))).....)))))..).)))))))))).........))).))).....))))).))))).)))(((((.........))))))))))))))..(((((((......))))))).((......))...................)))))))))))))((((((....)))))).........).)))))))..)))...........))))))).....))))))))..)))))))))..)))).))))))))....(((.((((.(((((((.........))))))).)))).)))...........)))))))))....(((....))).(((((....)))))....))))))))))......)))))..))))))))).......)))))))))...((((........))))))))).))))))...)))))..((...((.((.(((((((.((((((....))))))................)))))))..)).)).....))..)))))))........................))))))))..)))))....))..)))))))))))..))))).)))))...))))..))))......))))).......))))))))((((((..(((((........)))))...))))))(((((.((((((((.(((.....((((..((((.(((.......((((((((.....))))))))))).)))).......(((((.....))))).....(((.....)))....((((((((........)))).))))((.(((((((.(((.((..((.......))....))))).))))))).)))))))))))))))))))))).......(((......)))........)))))))..))))).))).))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,,{{,,({((((..{,....((((,(,.{{||||(({{,.....{{{||,,,,,,|||||,,......(((((({.{{{,|{{{{{{{..,,,|||{{|,,{{{{{{{|||,,,..||||,,||{...{{(((.{(((.({((,{{((((...,(((((,.,,....}}|||,..,,,,{,.{{||}}}.....,|..|||||||{{{{{{{(,(({{{,||.(((((((((((..((.(.(((((((((.((......)))))))))))...,.))..))))))))))),,,,..,||||,,||||}|||||...|,||{{{{.,,..|||{{{{}|{|{.{{,|{{..((((..((((....))))..))))(((((....)))))..........})))))}})))}))})),,,))))}},,,.))))))))),,.}}}|},,,.))),.,.....(((,,,..}},(((........}}}..,..{(((({.,...,.))))))}}).,|}}}......))}))})))}))}|}}..,}}}}},.,.,,,,(((((({(((.,,,((((((((((((..{((.........))).)))))},))))))........,,,))).)))))))...{((({{,{........})))))),,,})}.))))))),....,.})}},,)))})}.))}),.,,,)))))))((((..(((((((.((((((((..((((((((((....{({,.,,{|||,{{{|,((((((((..,..(((((((((,{((((.(((((.(((((..(((...{((((.,(((...{{....(((((....((((((((....((((.(.....).))))...(((((((.((((((((......))))))))...(((({{((((((((..(((.((((((((.{...........,....}))))))))..(((((..({....}).)))))((({..((((..........))))...}))}...,((((.......)))))))..)))))))))))))(((....)))({({(((((..........)))))))},..,,{((....))}}......,,..((((((({{,,(((({.(..((.,{{.{((.((((.((.({..((((((..((((((((((..((({...}}}}........})))).||||}((((((..((,{,{{(((((,,,,...(((.((((((...,||}}},|||........}}}},........||{{||||..|))|||||{|||}||.,,,}}},(((((..........))))),{((({{(,{{(((((((((....(((((((((((..........,.))),})))))))....((((.(,{((((((..,.(((((((((..{(((({{.|}},|{{{,{{,........(((((......)))))...|||,.,((((((((((.....((((((((((((,.............}))))).)))....))))....)))))).)))))}))))))...{(({.......))}}..((((((((..{.(((((((........(((..((((((({({.(({{{((,,{{{({((((((((..((,....,}),..)))))).)))}.....,,,,((((,,....}}}}.,,......}}}}....,.((((({{((((..{{{......}}})))))))))){||},,},....}}}........(((((((((((((.(((((.{....})))))(((((((((..(((.(((((.(((((....((((((....,..,.((.((((.((((..,..(((.({...,(((((....)))))|.((((.....)))).,...)})))..}.)))))))))).,,......))).))).....))))).))))).)))(((((.........)))))))))))))),,(((({{{......)))}}}}.,,......|,...,{,.....,}}.....))))))))))))),||,||}}}}),))))...........)))))))..|||.....,,,,,.))))))).,...))))))))..)))))))))}.)))).)))))))).|,,(((.((((.(((((((.........))))))).)))).))).,...,,....))))))))}....{||,,,.})).(((((....)))))....|}))))}}))}))})}))))}..},,))))))...,,..,.,,.})))...))))))}}.)).)))).)))}},,))..).})))).,))}...,{.((.(((((((.{((({{....}}}}}}......,,,..}}...)))))))..)).}}..,))))))))))))).......................,))))))))..)))))....,}..))))))),))}..))))).)))))...)))).})))}......))))).......)))))))),,|,|||,|||||{,.{{..{||||||,,},||,.(((((.((((((((.(((.,,....,{||,|||.,.{{....|}((((((((.....))))))))...,{{{,,,,....,{{{|,,,.,))}}}.....,||......||{.,.((((((((........)))))},)},,.|||||||..|..(({{(,{{{..{{{|.{{...,)).))))})).))))).))))))))))))))))..}}.}||||,,,})})},......}))))))))..))))).})).))))))).))))
Back