Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr11_0169800

Sequence Length

846 nt

GC Content

0.3735

GUUUAAUCAACAGCAGUUAGUGGCAGAGCUAGAUCUAGAAGCUGAUUUCCUGGGAUGCCCUAUAAAUCAGAAAGGUAAUUCUAUUAUAAAUUAAUAUUACAAGAAUAGAGCUCUAAACUGAAUGAAAAUAGCAAUGACUUCAUGAUCUAAACCAUCACACCCACUAUAGUUGCCUUUGAAAUUUUUCUUACUGGCCAAUGGCUAUUCCUUUAUAUAGAAUAUUUUUAAAUAGAGAGAAGUGGUAAAGAAUUUUAUUAACAUCUAGAGUCUGGAGUAAUCCAGUAUCACUAAGCAUCAUCUGACAUGGUAAAAUUUCCAGUAAGAUCUAUUUAAGGUCCAUUACAGAAUUACUUAAACCUUGUAUUAUUUAAAAAAUAUCUCAAGAGGACAAGUAGUCUACUUCUGCAGGAAAAUAUUUUUAAUACCAACUAUAAAAUGUUUAUAAUUUUAUAUACGUAGAAGACUCAGCAAAAUUUUAUCAGAUCAGGAGAUUAGAGUAUGAACAGUGGGAAUCCGUAACAAAUGUGACUGACUAGCUGGCAACCUGAUGUAAAAACACAGAAGGCUGCCCUAAAAGCAGGAAAAGAGAGUUUAGAAAGCAGUUUUCCUGGUUGGGUUUUCGUUGUGCACCUCACCUGCUCUGGAAGUAGUUUGCUAGCUCUGAUGCUUCAUGGUUCAGACUCCUCAGGUGCACGAUUAAAUUUCCAGAGUUGGUGAACAUGGCGCCACAUGUUUUGCACUCGUAAAUCCGAGGCUUGCGGAUAAUGUGCCGGGAAACCCUCAUGUGGUGUUUAUAUUCCCCGAAGGAAGUGAAAGUGGCACUACAUAUCUGGCACCGGAAACAGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-209.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -224.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 152.24

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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