Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr14_0142000

Sequence Length

384 nt

GC Content

0.3281

AUUACAGGUGUGAACCACCAUGCCUGGCAAUUUAAUUUUUUUUAACUACUAGAAUUCCGCUAAGUCGAUUGCCUUUGAAAUUAAAAAGCUGUAUUAUAUGAGCUAUUCAAAAUCAACACUGUUAAGAUAUUAGGCAUACAUAAAAAUAUUGAAUACCUUAAUAUGGGGUCUAUAUCAGUGGACCUUAAGUCUACAUCACAGGACUUCAUCUAGCUAAGUUCCUUUUUUGGAACUAAAAUUAAACCAGAAAAUAGUUUUUACUAUAGGUAGAGUCAUUAUUUUAUUUUCAGAUAACAAAGUGUACACAUUAAAAAAAAUAAUAAAAAGAGAUUAGGCCAGAUGCAAUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGGACUUUGGGAGGCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-87.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -95.01

Frequency: 0.0000

Diversity: 84.35

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((.(((...((((((((...((((((((((((.....(((((................(((((......((((..((.(((......(((.....)))......))))).))))......))))).........(((((((.....)))))))(((((((((....)))))))))((((((........))))))..)))))...((((((......)))))).............(((((((((((((((...)))))))..))))))))...............((((....)))).............)))))))))))))))))..))).))).)))))))))))))(.(((..(((...))).))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((((.(((...((((((((...((((((((((((.....{({{,.....,||,.|,.{..(((((,{,{..{{,{..(({({{......{{|}}}.})}}....,,}}}}|.|}}}..,...})})}.........{{({(({....,)))))))(((((((((....))))))))}{(((((........))))))..||}}}|,.((((((......)))))).............,,,(((((.,,,|||}},)})))}|,.|{||||||,{{,...,,,,|...,|||,...,,,,........,,.,.)))))))))))))))))..))).))).)))))))))))))(.(((..(({...})).))).)