Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr14_0142200

Sequence Length

379 nt

GC Content

0.4591

AAAAUCCCAGCAUAUAGGAAAUUAAACAUACUUGUAAGUGAAACACUGGUCAAAGAAGUAUCAGGAUAAGUUUUAAAAUAUUUUAGCCAGGCACUGUGGCUCACACCUGUAAUACUAGCACUUUGGGAGGCCAAGGUGGGGAGAUUACCUGAGCUCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUGACCGGACAUGGUGGCACAAGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAGGCGGAUCACAUGAGAUCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUCGCUGGGUAUGGUGGUGGGUGGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-101.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -110.08

Frequency: 0.0000

Diversity: 101.53

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(..((((((((.((((((............))))))((((...))))((((.....((((...((((..((((((...(((.((.(((((((....(((((((.((...((((.((..((((((((....))))))))...))))))((((....)))).)).)))).)))))))))).)).))).))))))...)))).))))................((((....))))(((....))).....((((((....))))))))))((((((((.(..(((((((...(((((.(((...)))...)))))....))).))))..))))))))).....................)))))).))..)(((.....)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(..{{((((((.({{{{{........,,,.|||}},,(((...|,{(((((({.,.{(((,..(((,..{{{{{{..,|||,||.(((((((....(((((((.,{,.{{(((.{{..((((((((....)))))))).,.,,}))}|{{{..,.)))}.}},}))).)))))))))).,,.||{,||}}}}..,))}}.,,,,.............})))))))...,}}}{{{....))),}}..((((({....})))))|}},((((((((.(..(((((((.{.(((((.{{{,,.},},,,))))),...))),,)))..)))))))))..,..................)))))).))..)(((.....)))