Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr15_0219100
Sequence Length
366 nt
GC Content
0.5519
AACAGUGGGUUCUACCUUUGUCCCAGGAAGGGGGCCAGUGGCUGAGCCCAUGGAAUUAGUACGGACACGCUUGCUCCCUUUGGAGUCCUCUGAGCUAGAAUUCAGCUCCAUGUCUGAAAGGGGUUUGUUUUUCCGCUUAUUAGCUGAGGAAGGGCUGGCCUUGACAUCCUCAGAAGUGCUGCUGGCAGGUGGGCGGUGCUCUGAAGAAUUCUGGCUGCCCCGACGGCCUUUGCUAUUGGCUCCUGCCCGGGUUUUGCUGCUGUUACUGGUCCCUUUGCUGUCAGAGGCUGUGGCUGUCUCAUUGACAGGUGUAUUACUGUUGGGACGCAUGCGUUUGCCUCUACCCCGGCCAUUGCGCAUUUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-133.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -139.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 72.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((......((((((...(((.(((((((((((((((.((((((............((((...((..(((((.((((((.......(((((.......)))))....)))))).)))))..))...)))).....((((.((((..((((.((((..((..((.(((((.((((((((........))))))))))))).))..)).))))))))......)))).))))..(((....))).)))))).)))......)))))))))))).))).))))))....(.(((((.....))))).)...)))))))).(((...((((((..(((........)))....)))))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((({......((((((...(((.(((((((((((((((.((((((..,,........((((...{(..((,((,{(({(({......(((((.,....})))))...,,}},})})))))..)).,.)))).....((((.((((..((((.((((..((..((.((((,,((((((((.,....,.))))))))))))).))..)).)))))))),.....)))).))))..(((....))).)))))}.))}.....,)))))))))))).))).))))))..,.{.(((((.....))))).},..}))))))),(((...((((((..(((........)))....)))))).)))..
Back