Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr16_0017200

Sequence Length

2253 nt

GC Content

0.5042

GUUCAAGAGAUUCUCCUGCCUCAGUCACCAUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUCAGUAGAGACGGGGUUUCGGCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCUCCUGCCUCAACCUCCUACAGUGCUGGGAUUACAAGCAUCAGCCACCGCACCAGGUCUUAAAUUCUUUCGAAGCAAAAACGUUUUAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCACAGUGCUGUGGUCAGUCAGAUUGGCCCGUGCUGUCUUCCACCUGGAGCAGAUGCCAGCUGUCCCCACACCCAUUUUCUUCUUCUGUAGUAACUGAAGCGCCUUGGCUGGCCAGGUGACCACUCAGAAUAAAGACAUCUCUCGCCUUCACGUGCAGCCUUGCAGCUGUGGCCGUUUAACUAAUUCCAGCCAAGGUGAGGUUAAUAGGAAGUGAUGCAGGGCCAUGUGCCGUGGCCCGCACCUGGAAUCCCAGCACUCUGGGACGCCGAGGAGGGAGGAUUGCUUUAGCCCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGGCAACACAGUGAGACCUCAUCUCUACAAAAAAAAUUUCAAAAUUAGCUGGGCAUGGUGACAUGCACCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAGGCUAAAGUGGGAAGACUGCUUGAGUCCAGGAGUACAAGGCAGCAGGGAGCCAUAAUCGUGCCACUGCACUGCAGCCUGGGUGACAGAGUGAGACCCGGUCUCAAAAAAAAAAGGAAGCACUACUGGAAGUUGGGGGUAUACCCUUAAAUAAAAGGGGCGAGGCAUGGUGGCUCACACGUGUACUCCCAGCACUUUCAGAGGCCAAGGCAGGAGAAUCGCUUAAGCCCAGGAGUCAUAGAUAAGCCUAGGCAACACAGUGAGACCCUGUCUCUACCAAAAAAAAAAAAUAGAAAAAUGAGCCAGGCAUGGUGGCACGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCAAUUGAGACCGGGAAGUGGAUGCUGCCAUAAGGUAUCAUCAUUCCACUGCGCUGCAGCCUGGGUGACUGCAAGGCCCUGUCUGAAAAAGAAAAACAAGCAGCAGCAGAAAAGGAGGGGGCCGAGGAGGGGGCCUUAUCUCCGCUCUGGCAGAAAUGUGCAUGUGAUGGACACGUGGACAAGGGCAACAUCUGAAAUGUAAUGGCACCACCAAGAAGAGUGGACUGGGCUUCAAACUGUCAAGUGGGAAGAAAGAAAAUUCUACCUUGUCUAAACCAGUGUUGCUCAGGGUCUCUGUCACAGAAACCAGACAACAGCCCGCCUGACACACCACCGAUGCAAUUCCUGGCAAAGCCAUUGACACAUUAGGAGGGGAGCUUUUCAGUCCCUCCCUCAGCCCACACAGGGCAGGGGUGAGCAGAUGAAACUCACAGAAGCCAAGUUUCUAGAGUCCCCGGUGAGAGCAUUUCGUAUCAUUAAGCUGUGACAAUCUUGCUUCAGCAUCUCUCCCUCCUCCCUCGCGUUACUUAGAUGGAAACGUUGGCUCUGUCCCUCCAGAGGAGCCACGGCUGAGGCUUAUGAAGAUGGAUUAGUACAGACUCCUCCAGGAAGCAAUCACUCUUCAUCUCCUCUCAUGCUGGGCCAGCCAGGACGCCCACCGCUGAGCUCGCUGGUAAAUAUGGUCGCAGUCCCCCACCCAACUUCUCCACUCAUUCACCAAACUUAAUAUUCGCCCAAAAAGAGCUUUGCAGAUCUCUUCUUUCCAAGCUAAUCUCUCCACUCCAAGGACUGUGGCUCACCUGUGCAGCAGGACCACACACCGCACUGCUGGGCCUGAAGGCUUCUGGGGCAGGAGGAGAGAAGGGCUAGGAGACCCUGGAAACACAGCAUUGUCUCUGUGUUUUGAGUUUUUCCAUCACUAAAAUGCAUCACCUGAGUCACCAGUGCUACUUAGAAAAGAAGAAAAUCACAUAUAGACUAAUAAGGGUCACUCUUUAAUAAAGAUUUGUGGGUGGAUUUUUUUUUUCCCAAAAUGCACUUUAGAAAUUAGAUUCCUGGCCGGGUGUGGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAAAUAGGCAGAUCACAAGGUCAGGUUUUUACCUGGCCAACAUGGUAAAAACCCACCUCUAUUAAAAGAAAAAAACAAAAAACUAGCUAGGUGUGGUGGUGUGUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCGGGUGGCUGAGGCACAAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGGCAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-844.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -879.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 421.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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