Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr16_0018300
Sequence Length
340 nt
GC Content
0.5147
AAAGGGUGUGCAUCCCUCCCCCUUCCUGCUUUGAAGUCUCCAUAGUUAACAAAGCUGCAGUGAUACUGACCACCUGGGGCUGUGGUGUGGAUCUGGGCUGAGCUGCUCUGGGCACACAGAGCCCAGAGCACACUACAGAGAGCUAUGGCCGAGACAAUCUUCUCUCCUCCUGGCGGGUCAGUUUCCUGGUCUGUGAAACCAGCCCUCCUCAUCACUACCUCACUCCUUGCCAGGAUGAUUUAACACAACAUCACAGAUCAACAGUCUGGCUCACCGCCAACAGGUACUCAACAAAUGGCAGCUGGAAACACUGUAUUUUUAUAUGAGUGUCUCUGAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-104.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -109.91
Frequency: 0.0001
Diversity: 81.83
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.......))))..(.(((((((((((((.((..((((((((.....((((.(((((........)).))).))))((((((((..((((((((..(.((((...))))..)..)))))))).))))))))....))))))))..((((......)))).(((..(((((((((((.....((((((((((............(((((.((..(.........)..)))))))............)))))))))).....)))))...))))))..))).)))))).....)))))..(((.(((((((((....)))).))))).))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((.......))))..{.(((({{((({((..{,,,((((((({..,..{(((.(((((........))}|)).))||((((((((..((((((((..{.((((...))))..,..)))))))).))))))))}}..})))))))..((({......}})).{{{..(((((((((((..,..((((((((((............(((((.((..{.........}..)))))))............)))))))))).....)))))...))))))..))),{{|||..,,,.,||||.{({{.{||||||{{....,}})}))))).)}})))).)
Back