Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr16_0409300
Sequence Length
1309 nt
GC Content
0.5730
GUGUUUGACAAAUCGAAUUCAUAAAAAGCUCUAUGCCAAGCUGAACUUCAAUGGAAAGGAGCCUGUGUACACGGACAGCACGCGUGAUGGGCUCAGGAGCCUGCCUGUGUACACAGACAGCACACAUGAUAGGCCCGGGAGCCUGUCUGUGUACAUGGACAACACGUGUGACAGGCUCUGAAGCCCAUCUGUGUACACGGACAGCACGUGUGAUGGGCUCAGGAGCCUGCCUGUGUACAUGGACAGCACGCGUGAUAGUCCUGGGAUCCUGACUGUUUACAAAGACAGCACACAUGAUAGGCCCAGGAGCCUGUCUGUGUACACGGACAACACGUGUGACAGGCUCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGUACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGUACACGGACAACACGUGUGACAGGCUCCGAAGCCCAUCUGUGUACACGGACAGCACGUGUGACAGGCCCAGGAGCCCGUCUGUGUACACGAACAGCACGUGUGACAGGCUCUGAAGCCCGUCUGUGUACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGCACACGGACAACACGUGUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGUACACGGACAGCACGGGUGAUAGGCCCAGGAGCCCGUCUGUGUACACGAACAGCACGUAUGACAGGCCCCGAAGCCCAUCUGUGUACACGGACAACACGUGUGACAGGCUCUGAAGCCCAUCUGUGUACACAGACAGCACGGGUGACAGGCCUAGUUUUGCUUCUUCAGUGAAGUUUUGGUGAUGACACAUGAUUUGCUGCAAUCUCUACUGCCAUGCAUCAGCUCUAAAAUGCUGUCAAUCACCGUCAGACAAACCUUAUUACUGGCUGGGCGCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-550.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -569.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 452.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.................((((........))))((((((((.(((..(((((((((((((((((((.....((((.((((((((..((.(((((.(((((((((((((.....((((.(((.(((.((((.(((((((((((((((.((((..((((((((.((((((((..((((((((.....(((((.......)))))))))))))..)))))))).((((........))))))))))))...))))((((..((((.((((((....))))))..((((.(((.(((...((((((((((.....(((((.......)))))))))))))))...))).)))))))((((((.......)))))).)))).)))).........))))))))......((((((((((..(((..((..(((....(((.((((((.......))))))))))))..))..)))..))(((.((((((.......)))))))))(((..((..(((....(((.((((((.......))))))))))))..))..)))..(((((....)))))..)))))))))))))))))))..))).)))))))((((((.......))))))...(((..((..(((....(((.((((((.......))))))))))))..))..)))....(((.((((((.......)))))))))(((..((..(((....(((.((((((.......))))))))))))..))..)))..)))))))))))))...((((((((....(((......)))..(((((((((((((((.(((((((((((.((((((...(((....(((.((((((.......))))))))))))...)))))).)))(((........)))))))))))....((((....)))).)))))))))))))))..))))))))..))))).))..))))))))))))((((((.......))))))...(((......)))..)))))))))))))...(((((((((...(((...((.(((.((((((((.........)))))...))).))).))...))))))))))))(((((.......)))))(((((((.(((..((((.(((((........)))).).))))..))))))).)))..))))))))).)))))))).(((((((((((((.....((((..........(((...))).))))......))).)))).))))))))))))))..((........)))((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({.................{(((,...,,,.}}}}((((((((.(({.,(((((((((((((((((((,..,,((({.((((((((..((,(((((.(((((((((((((..,,.((((.(((.(((.((((.((((((({(({({{{.(({{,,((((((({.((((((((..((((((((.....(((((.......)))))))))))))..)))))))).((((,{,,,,|,}}}}||||||||.|.||||{(((..{,((.((((((....))))))},((((.(((.(((...((((((((((.....(((((.......)))))))))))))))...))).)))))))((((((.......)))))).},||{.,||..|||...,(((.((((((.......)))))))))|||..||..||}...,(((.((((((.......)))))))))|||..||..|||...,(((.((((((.......)))))))))|||..||..||}...,(((.((((((.......)))))))))|||..||..|||...,{((.((((((.......)))))))))|||..||..||}...,{((.((((((.......)))))))))|||..||..|||...,{((.((((((.......)))))))))|||..||..}}}...|(((.((((((.......)))))))))|||..||..|||...,(((.((((((.......))))))))))}|..}}..))}..}))))))))))))...((((((((,...(((......)))..|(((({(((((({{{.{{{{{|||{{{.((((((...(({...,(((.((((((.......)))))}))))))...)))))).)))|||}}}}}},.}},}})))))),...((((....)))).))))))))))))))}..}}||||||,.,,|||.,|,..|||,,}}{|{,((((((.......))))))}}}|||..},..)))..|||||||||||||,..|||||||||...|||.,.||.|||.||||||||}}}},....}}}}}...}}}.|||.}}...)))}})))))))|||||},,..,,)))))|,{{(((,{{{.,|||{.|||||}}}}}}}})}}}.,.))))..)}))))).))}..))))))))).)))))))).(((((((((((((,,..,((((((........,}...}))).)))}......))).))))}}))))))}}}}}},..,,.......,}}},}}},,,}
Back