Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr16_0409800
Sequence Length
867 nt
GC Content
0.5940
GUACAGGUUCACCAGCUGGCUCAGGGCAGGGGGCUGGCUUAUUUCAGCAUUGGGUCCAAAGAAGCGGUGACUGGAAACGCUGGCGUCGGGCCGCACACUGCAAGACUCGAGCAGGGGCAGGAGGACUCCAGGGAACAUGGUGAGCGCCUGCUGUAUCAGGAGAGAGGCCUUCUGCCUGGCAGAGCUCUGCUCACACUCAGGGAGGUCUGUCUGCUGGCUCAGCAGGAAAUACGCCAGUGGAACAGAGAAGGCAAAAUUAGGGAGCUGGGACAGGUUCCGAUGAGCCUCCCACUCCUGGAAGAGGCGGAUCAGGUACUCGUAGUUCCGGGCCCGCAAGGCCAGGUGGUCGAUGAGCAGCAGCAUGCAGAGGGGGUCCUCAUCCGGCUCGAGACUCAGGAUGAGCUUGCAGUACUCCAGCGCCGUGCGCGGGCAGCCUCGCUUCUCCAGGAAGCUCAUCUGCUUGUAGAGGGCCAGGUAGAAGCUCCUGUUCUCGGGUCUGCGGUAAUCCAGCCGGCAGGCCCCACUGGUGAGACUGAACAGGGGGUGGAACGCACAUUCCAUGCUGUACAGCGCUCUCUCUACGAGGUCUCGAGCCAUCUCCUGAUCCUCUUGAAAGCGGCAGGCAUCGCUGAGCUGCAGGAGUGAGUCAACGUGGUAAGGGCUCGUCUGGAGCAGAACCACGAUGUUGUUCGGCUCCAUAGACUCCACGGCCACCAGGAACUUGUGCUGAGCCUGCUGGUACUCCUCACUGUGCUCAAACGCAAAGAAGGAGAGGCCUUUUUUUGAUUCCAGCAGCCGCAUGGACAGACCUGGUUUGCUGUAGCGGGGCCAGGUGCUUUUAGGGGUGGUCAGCCAUGUGCACUUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-359.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -376.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 195.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((....)).).)).(((((((((.(.((((((((.((((((((.....(((((.....(((((..((((((.(.((((.(((...((((...((((.........))))..)).))..))).)))).).((.(((((....(((((((..((((.(((.(((((((((...((((((....)))).))......))))))))).))).))))..))))))).....))))))).....(((((((((...(((((.(.(((.((((((((((((((..((((((((....)))..)))))..))).((.(((...))).)).((((.....)))).((((((((..((((.(((...))).(((((((((.......((((((((((((.(((.((((..((.(((((((.((((...)))))))(((.((((((....(((((.(((..((((((((........)))))))))))))))).....(((((((((((......))).))))))))....)))))).))).....((.((((((......)))))).)))))).))))))..)))..)).)))))))))).......)))))))))....(((((.(((...)))..))))).((((((((.(((((((((....((((.....))))...)))))...))))))).)))))...).)))..)))))))).))))))))).)).))).).))))).(((((..((.(((......))).)).)))))..)))))))))...))))))..))))).)))))..(((((((((((....)).))))))))))))....))))))))))))).).))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.({(.((....}}.},)).(((((((((.{.((((((({,((((((((.....(((((.....(((((..((((((.(.((((.(((...({((.{.((((.........)))),,)).)}..))).)))).).,(,(((((,...(((((((..((((.(((.(((((((((,..((({{(,,,.}}))}).....}}))))))))).))).))))..)))))))...,.)))))})}...{(((((((((...,(({({(,({({((({(((((({{{{,,||||||||,,,,)}}..}}|||,,}||,((,((,...|||,||.((((.....)))).((((((((..((({.(({,,.}}}.(((((((((.......((((((((((({,(((.((((,{((,(({(,{(.((((,.{}}||{|{(((.,,,((({{,.,.||)))),..,}||||||}..|.}}}},}},}},,,||||||{{{..(((((((((((......))),})))))))....,,,}}}.,,)}})}}||}((((({......))))))})))))}.)})))),})))..))))))))))))).......)))))))))....(((({.{{{...)))..))))).((((((((.(((((((((....((((.....))))...))))),.,))))))),}))))...,.)))..)))))))).))))))})),)),)))}).))}}}.((((({.,({(({.....,))).,).}))))..)))))))))}}.))))))..))))).)))))..(((((((((((....))}))))))))))))....))))))))))))).}.))).))))))
Back