Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr19_0141500
Sequence Length
780 nt
GC Content
0.4333
ACUUUACCACAUUAUUCACACUUGUAAGAUUUCUCUCCAAUAUGAGUUAUCUUAUCUGUAGUAAGGUGUGAAAACUGGUUAAAGGCUUUGCCAAAUUUUUCCUGUUUGUAGGGUUGCUGUCCAGUAUGAAUUUUCUUAUGUCUGGUUAGGGCUGAGGACCAGAAAAAGGAUUUGCCACAUUCUUCACAUUUGUAGAGUUUUACUCCAGUAUGAAUUACCUUAUGUUUAGUAAAGGUUGAAGACCGGUUAAAAGAUUUGCCACAUUCUUUAUAUUUGUAGGGUUUCUCUCUAGUAUGAAUUUUCUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUCGCUCUGUCGCCCAGGCUUGAGUGCAGUGGCGUGAUCUCGGCUCACUGCAAGCUCCGCCUCCCGGGUUCACGCCAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUCGCAUAGCUGGGACUACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCUAAUUUUUUGUAUUUUUUAGUAGAGAAGGGGUUUCACUGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCCAUCUCCUGACCUCGUGAUCCGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUAGUGGGAUUACAGGUGUGAUAGUAUGAAUUUUCUUAUGGUUAGUAAGGAUUGAAGACUGGUUAAAGGCUUUGCCACAUUUUUCACAUUUGUAGGGUUUCUCUCCAGUGUGAAUUAUCUUAUGUUUAGUAAGAGCUGAGGACUCUUUAAAGGCUUUGCCACAUUCUCCACAUUUGUAGGGUUUCUCUCCGGUGUGCAACCUCUUAUGUCUAGUUAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-223.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -237.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 157.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.....((((((((((((((((..(((........)))..)))))))........)))))))))...))).)))))(((((((.((((.......)))))))))))..(((.(((((((((......))))).)))).)))((((((((..((((((((((((((((.((((.......(((((((((((...))))...)))))))......))))...)))))((((...))))(((..........)))......(((((((...(((((.....)))))))))))).........))))))))))).((((((((...))))))))((..(((((.(((.((((((((((((.(((((......((.......))...))))).)))))))).....))))))))))))...)).((((((((......(((....)))......))))))))..(((((.((((....)))).)))))((((.((((.(.(((((...((((((...)))))).))))))..))))...)))).))))))))(((((......))))).((((((((((..((.(((....(((((((.....)))))))(((((((...(((...((((((((.((((..((((((((.(.((((...))))).)))))))).......))))...)).))))))...)))))))))).(((...))).))).)).))))))))))(((......)))(((.....))))((((........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((...,.((((((((((((((((..(((........)))..)))))))........))))))))).,.))),,))}|(((((({{((((.......))))))))))}..(({.(((((((((......))))).)))).}))((((((((.,{((((((((({....,...,,{{{{{{.,,,||||||||,,,|||},,||||||,..,{{{|||,...,}}}}}|||||,|}}|,(({.,,..,,...}}}......{((((((,.,{((((...,,)))})))))))}....,....}}}}}}}}}}}.((((((((...))))))))((..((((,{(((.((((((((((((.(((((......((.......))...))))).)))))))).....))))))))))))...)).((((((((......(((....)))......))))))))..{((((.((((....)))).))))|((((.((((.{.(((((...((((((...)))))).))))),..))))...)))),))))))))(((((......))))).((((((((((..{{.{{{....(((((((.....))))))){((((({..{(((...((((((({.{{((..((((((((,(.((((...)))),})))))))).......}}}}...))}})))))...)))))))))).(((...))).}}}.)}.))))))))))|({.....,,)){{{....,)))){{{{........})))
Back