Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr19_0142400
Sequence Length
750 nt
GC Content
0.3653
GAUUGUCUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUCAAAUUUGUAGGGUUUCUCUCCAGUAUGAAUUAUCUUAUGUUUAGUAAGGGUUGAGGAUUGCCUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUCACAUUUGUAGGGCUUCUCUCCAGUGUGUAUCCUCUUAUGUCUAGUUAGGGUUGAAGACCAUAUAAAUGCUUUGCCACAUUCUUUACAUUUGAAGGGUUUCUCUCUAGUAUGAAAUCUUUUAUGUUUAGUAAGGCUUGAGGACCAGUUAAAUGCUUUGCCACAUUCUUCACACUUGUAAGGUUUCUCUCCAGUAUGAAUAAACUUAUGUAUAGUAAGAUUUGAAGAUCGAUUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUCACAUUUGUAGAGUUUCUCUCCAGCAUGUAUUAUUUUAUGUUUAGUAAGGGUUGAGAGUCGCUUAAAAGCUUUGUCACAUUCUUUACAUUUGUAGGGUUUCUCUUCAGUAUGAGUUAUCUUAUGAUUAGCAAGGGUUGAGGAAUUGCUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUUACAUUUGUAGGGUUUCUCUCCAGUAUGAAUUCUCUUAUGUUUAGCAAGGGUUGAAGAACGGCUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUCACAUUUGUAGGGUUUCUCUCCAGUAUGAAUUCUCUUAUGUUUAGCAAGGGUUGAAGAAUGGCUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUCACAUUUGUAGGGUUUCUCUCCAGUGUGUAUCCUCUUAUGUCUAGUUAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-165.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -182.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 270.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...((((((((.......((((((((((((((((((...((........))...)))))))........(((..((((((.((....(((((.((.......((((((((((((((.((((((..(((..........................)))..)))).)).))))))))....(((.....((..((((..((((((((((..........))))))))))))))..))...))).)))))).......)).)))))....)).))))))..)))(((((..(..((........))..)..)))))........))))))))))).......))))))))...))).....((((((.(.((((...((((.(((.((((...............(((((((.((.((...(((....)))....)).)).)))))))..(((((((((..(((........)))..)))))))))(((((((...........)))))))((.((((((.((((.......(((((((.((.......))..)))))))......))))...)))))).))((((((.(((..((((((((....((((((((((.(((((((((.(((..........)))..))))........))))).).)))))))))....)))))))))))...))))))))))))).))))...))))).)))))).)))(.((.((.....)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((...((((((((.....,,((((((({(((((((((...,{{,,|...,||},,.,|{{{|{.....}}}|||,.{(((((.((....((((({((,......((((((((((((((.((((((..((({,,,,{,{......}}}}.,,.....)))..)))).)).))))))))....(((.....((..(((,.,((((((((((..........))))))))))))))..)).,.))).}}}||}...|,.,},.)))}}.,..}}.}}||||.{||,(,,((,.,.,|,.,.,,,.,)),.,..|||||.....}}}))}}})))))).......))))))))...})},||||{({{{{{(.{(((...||||..((((((........))))),..(((((((.(({{({..(((....))).}}.))},}.)))))))..(((((((((..(((........)))..)))))))))...|||||.,||}}|}}}},}},.}}}})}}}{{.,|,,}|{||{{{(,{(,((((,.,,,,,,,...,,}}}}.,},..}})}...}}}}}}|,|((((((.(((..{(((((({,,,.,{{(((((({.{((((((((.,,|,,..,.....)}}..}}}}........))))).),)))))))))}}..)))))))))))...))))))||{||}|.||||...)))}.,))}))).}}}|}|,.||,....,..)))
Back