Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr19_0142500
Sequence Length
673 nt
GC Content
0.3700
GGUUGAGGAUUGCCUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUCACAUUUGUAGGGCUUCUCUCCAGUGUGUAUCCUCUUAUGUCUAGUUAGGGUUGAAGACCAUAUAAAUGCUUUGCCACAUUCUUUACAUUUGAAGGGUUUCUCUCUAGUAUGAAAUCUUUUAUGUUUAGUAAGGCUUGAGGACCAGUUAAAUGCUUUGCCACAUUCUUCACACUUGUAAGGUUUCUCUCCAGUAUGAAUAAACUUAUGUAUAGUAAGAUUUGAAGAUCGAUUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUCACAUUUGUAGAGUUUCUCUCCAGCAUGUAUUAUUUUAUGUUUAGUAAGGGUUGAGAGUCGCUUAAAAGCUUUGUCACAUUCUUUACAUUUGUAGGGUUUCUCUUCAGUAUGAGUUAUCUUAUGAUUAGCAAGGGUUGAGGAAUUGCUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUUACAUUUGUAGGGUUUCUCUCCAGUAUGAAUUCUCUUAUGUUUAGCAAGGGUUGAAGAACGGCUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUCACAUUUGUAGGGUUUCUCUCCAGUAUGAAUUCUCUUAUGUUUAGCAAGGGUUGAAGAAUGGCUAAAAGCUUUGCCACAUUCUUCACAUUUGUAGGGUUUCUCUCCAGUGUGUAUCCUCUUAUGUCUAGUUAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-149.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -165.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 265.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((.((....((((((((.......((((((((((((((.((((((..(((..........................)))..)))).)).))))))))....(((.....((..((((..((((((((((..........))))))))))))))..))...)))....((...(((.....)))...))......((((.(((.(..((....))..).))).))))....(((((.....)))))...)))))).......))))))))....)).))))))........((((..(((((.(((...(((((.........)))))...))))))))..))))...((((((.(((.((((((.....(((((((((..(((........)))..))))))))).....))))))))).)))..)))..((.((((((.((((.......(((((((.((.......))..)))))))......))))...)))))).))((((((.(((..((((((((....((((((((((.(((((((((.(((..........)))..))))........))))).).)))))))))....)))))))))))...))))))(((((((.((((...)))).))).))))..))(((.((.....)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,({.(((((,{(,...(((((((({{..,,{((((({((((((((,({((((..{({||,||{,{,.....,}},.||,.,,.)))..)))).)).}))))))),,,,(({.....((..(((,.{((((((((((..........))))))))))))))..}),,,))}.,{{{{{...,,,,{{.|||||{|,.,,,,,((((.{((,(,.((,...}|,.}.}}}.})),.,..(({{{.....)))))...{(((((.......(((((((({{,..{((((((({.{((({,(((...||||,.((((((.,......})))},..(((((({,((||(|..(({....})).||.)),,|.}))))))..(((((((((..(((........)))..))))))))}...}}))}.},}))))))),},..}))))))),,..,..}||}}|{{{,|(,((((,,,,,,..,....,)}}},}}}..}})}..,)})))}},|||||||.|||..||||||||,,,..,{|||||||,|||{{{(((.,,|,},,,....,}|},.}}},..,},...)))))}}.)))))))))}}..)))))))),,,.,.,)))))|{{{||{.{(((...)))),}))}))}.}}))||,.||.,||.,,,)))
Back