Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0869700
Sequence Length
524 nt
GC Content
0.5782
GUGGCCCGGAACCCCACUGAGGUGCCUGGGGUGGGCUGAUGCCCCUCAUUCCUAGAAGAAUGCCCCCACCUGCUGCCACUUGGUUGUCUAGGCUGCCUCUCCUGGUUCAGAACUUGCCCUGCUUCAGCCGGUCAAUGUGGUAGGAGAGCUUGAGUGCAGGCCCCAGCUUCAGGCCCAUGUACUUCAUCAUCAUGUCACUGCGCAGCAGCAGCAGGGCCUUGCCAUCGAUCUCGUGUUUGCGAAACAGGUCAGCGUGGGGUCCAAGCUGAGGAUCAGCUUCCCGGACAAACUGCAUCACAUCCUCGACUGUCCAUGAGGAGGGGUCCCGGCCACUCAGUCGAGAGGCAUCGCGGCUCUCCAGGUAUCGGUCCGACCCUGGGGAACGAUUUAGUUUCCAAAAUGAUUCCAUAUCCCUUCUUUCAUUUGAUCCUUUUAACACUCCCCUGGAGCAUAGCCUGCGCACAGCUGAGGCAGUGCUUGGUGGGAGGCCACAGGAUGAAAGCAAGGGCCGGUGCCUUUGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-196.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -206.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 126.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((.((((.((((((...(((((((((((....))))..(((((......))))).......((.(((((((...((((.((.(((((........(((.........)))......))))))).))))))))))).)).((......))..))))))))))))).(((((((.................((((((....)).))))(((...)))...((((((((....))))....)))).)))))))(((((((((((...)))))))...)))).............((((((........))))))))))))).))))))(...((.((((((((((((..((((((((..(((...))).)))))))).))..............(((....)))..(((((((((((.....((((.......(((((.(.((((((.((((..((...))..)))).)))))).).))))).....)))))))))).))))).)))))))))).)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((,{((((..,{.(((((((((((.((((....))))..(((((......))))).{{{{{(,,((((((.,,{(({,{.||||(({({{(((((((.{.((....{{(,({.((....)).)).))))}}),)))))))),.{(((((((((((.........))))..}))))}}},.......|,..(((({{....)),)))))}}}}.}}},,,||,,((((....))))...,)),)))))))))),,,(((((((...)))))))}}})),,.....))))).,,((((((........)))))))))))}),))))))(...((.((((((((({{({,((((((((..(((...))).)))))))|,|,,....|,,,,....,||,...,,...{((((((((((.....((((.......(((((.(.((((((.((((..((...))..)))).)))))).).))))).....)))))))))).)))))))))))))))).)).)
Back