Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0870800
Sequence Length
170 nt
GC Content
0.3588
GGAAGAAGGGAAAUACCACUUCAACUUCAAUGAGUUGGUGGUAGGAUUUCACAGGGUUCCUAAAGGAAGAAGCCUGGUAAGUUAGGUGCCUGAAUAAUGUAAACCUAUUUGAGAUAGGUACAUGUACAAUAUUAUAUGUAUUCAUACAUUAUCUCAUUUCCAUUUUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-37.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -42.25
Frequency: 0.0007
Diversity: 45.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.(((((.((((((..((((((....)))))))))))).(((((..((((.(((.........))).))))..)))))((((...............))))...(((((((((((((((((......))))))))).......))))))))))))).))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{(({,{((({,((((((..((((((....)))))))))))).,{{||,.((((.(((,,....,..))).))))..}}})|((((..,........|...))))}..{((((((((((((((((......}))))))))...,,,.))))))))))))|.}}}}...,
Back