Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0871700
Sequence Length
898 nt
GC Content
0.4521
GUGACCAUAUUUGUGUUUUCUAACAUCACUCCAGUCUAUCACUGCAGAGGGAGAGAAAAAUAGUCAUGUGGAAAGAAAGUAUAAGAUUAAAUACUUUUCCAAUUUGGCAGUAUGUAUUAACAGUUUUUAAUAAAGUAAUCCACUUCCGAGAUUCUAUGCUAAGGAAAAAUACUCCAAAAUACAAGAAAAAGGUUUUAUGUAAAAAGCCUUGGCAUUGUUUACAAUAACAAAAAAAGGAACACCUAAAUGUUCAAAAUAGAAGACUGAUUAAGAUUUGAUAAUACAAACACUUGACAAAGUAUUUUGAAGCUGUUAAAUUUUUAAAAGGCUAAAGAACAAAUGGGAAAAUGGUUAUGUUAUGUUAUUAGGUAAAAUAUGGGGAUAAAAAUUAUAUUCAUGGAAUGAUCACAAUUAUUUAAAACACUAAAAACAAACAGCACCCCAGUUAUGGGCUCAACUGUAUCCUCCAAAACUUCAUGCUAAGGUCCCCACUCCGCAGUACCGCAGAAUGUAACUGUAUUUGUGAUGGCAGCGGUGGGCCAUCUGGAGCAGCUGCUGUCAUCAUGCCGGCUGCAGCAGGGAGGCACAGCUGGGAAUGCAUGCUCCAUGGAGCCGGUGGGAGCCUGGGAGCAGGCAGGAGUCCCGCCAUCCUGGGUGCAGCUGCAGCCACCCAAACCGAGGCUGCAAACCCAGACCUCCUGCUCCAUGGAACAGGCAGGAGCCCUGCCGUGACGGGCACAGCUGCAGCCACCCAAAUGUGGCUGCAGACCCAGGUACCCCUGCACUCUUGGGGGUCCAGCCAGGACCCCUCUUCCCUCCCAGGAUCAGAAAUGCCUGCUCCCCCUGCCUGGCUUCUCCCUGCUGUUGGCACCUGUUCUGAUCUUGGAGCAAAGUCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-280.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -296.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 207.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.(((.((((((((....((.((((..(((........))).)))).))......((((..((((((...(((((........)))))))))))...)))).((.(((((((.(((.(((((((..(((..((...............(((((((((.....(((....(((..(........)..)))..))).....)))))))))((((......)))).......(((((......)))))......))..))).))))))).))).))))))).))((((....)))).......((((.((((....))))..))))..)))..))))).))).))))))))((((((((....((((.....(((((((............(((((((((((....)))))))................((((...((((....)))).....))))..............)))).....)))))))........))))....)))))))).......((((((((((((((...((....))....))))))))))))))((((...((((((((((((((..((.......)).)))((((((((((.((((((((((((....))))).....)))))))...((((((.....(((((((...........))))))).)))))).......)))))))))).(((((((((((..((((......))))..)))((((((((......))))))))(((..((((....))))...))).((((((((.....))))))))...........(((.(((......))).))).))))))))....)))))))))))))))......(((((.(((......))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.(((,({(({{{{..,.{{.((((,,({{...,,,,.})),)))),)}......((((.,(((({..,{(((((........))))))))))}.,.)))).((.(((((((.(((.(((((((..(((.,{{,..,,..,.},||,.{((((((((.....(((....{((,.{........},}))}..))).....))))))))|((((......)))),......(((((......)))))......}},.})).))))))).))).))))))).))((((....)))).,{{{..((((.{(({....})))..))))..)))},}}}}},}}}.|}||||||((({((({....((((.....(((((((..............{{(({((({....})))}}}................((((.,.((((....)))).....))))....,}}}....,...,,.....)))))))........)))),,,.}))))))),,,....((((((((((((((,..((....))..).))))))))))))))((((...(((((((((((((.((((.(((...{{{.({((((((((((.((((((((((((....))))).....)))))))...((((((.....(((((((.........,.))))))).)))))).......)))))))))).|,((((((...)))))){{{..{||}|,.,((((((((((......))))))))))...{{{|,...))}},,,....((((((((.....)))))))}..,,{......))}.,}}....))}))},,,))).)}}))))..))))))))))))))).,,{{{{(({{.,{{},,,},},))))))
Back