Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr21_0074100

Sequence Length

1230 nt

GC Content

0.4561

AAUAACCCUUAGGGUAAUCCUGAGGACUUUACCAGGCUCCUCUUGCCCAACAUCACCUCAUCCAGAAUCCUAACACUCCCAUUAUCUUCCUCCUUGCAGCUCUGCCACUGUUGUUUGUGGACUCCCUGGAGAAUUAUUCCACUGCUAAUGAAGCCCCCAAGAGACUCAUGCCAUGCUUCCAGUGCUGGCUUUUUGUUAUCAAUAGCUCCUAUGCCUCUAUCCCAAUCUUGUAUGAAGAGAGGUAAAUCCAAGAAUCCCUGUGUUGUAUUUUUUAUAAUAGCUUUGUUGAGACAUAAUUUACACACUAUACAACUCAAAUGAAGUGUACGGUUCGGUGUUCUUAGCAUAUUCACAGGAUGUGCUGACAUCACCACGGUCUAAAUUUAGAACAUUUUCAAAAAGAAACUCCAUACGCAUUAGCAGUCCCUCCUCAUUUUCCCCUAACCUUCCAGGCCCAGCAAUCACUGGUCUACUUUCUGUCACUAUAUACAGACUUGCUUAUUCUGGAGAUUUCAUAGGAAUGGACUCACACAAGCCCUUUGUGUUUGGCUUCUUUUACUUAGCAUAAUGUUUCCAAGGUCCAUCCAUGCUGCAGCAUGUUAUCAGUACUCUUUUUUUUUUUUGAGACAGCGUCUCACUCUGUCACUCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUCAGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCUGGGCUCAACUGACCCUUCCACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGACUACAGGCAUGUGCCACUAUGUUUGGCUAAUUUUUGUAUUGAUGGGUUUCGCCAUGUUGCCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGAGCUCAAGCAAUCCUCCUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGGUAGGAUUACAGGCGUAAGCCACCAAGACUGGCCAUUUGUUUUUGAGGCAGACUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGCACUGCAGUGGCACAAUCAAGGCUCACUGCAGCCUCAACCUCCCAGGUUCCAAUACUUACGUACCCAUUUAUCAGCUCACGAAUACUUGGGCUAUUUCCCAUUUUGGGCUAUUAUGACUAAUGCUGCUAUGAACAUUCAUGUACAAGUUUUUGUGAGAACAUGUUUUCCUUUCUCUGUACACACCUAGGAGUGAAACUGCUGGAUCAUAUGGUAUGCUACAGUUUGAAUGUUUGACCCUCCAAACCACACAUUGAAAUCUGAUCCCCGGUGUUGGAGGUGAGGCACAGUGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-324.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -349.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 376.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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