Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr21_0075400
Sequence Length
992 nt
GC Content
0.4506
GUUCAAGCGAGUUUUGCCAUUUUUUUUUAAGAAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGGUCAGGCUGGUCCCGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCACCUGCCUCGGCCUGGCGUGAGCCACCAUGCCUGCUGGCUAAUCAUAUUUUAACUGCCCCAUUGUUUACAAAUUUCAAUUUUGAAGCCUGUAAUUAACACUGUCUCAGAAACUGAAAUAAUAGGGCACAUGCCAAAGGUCAUUCCUGAGCAUAGAGUCCUUUGAUCCGAGCUGCACUUCAGAGACACCGCCUCUACCUCAUCAUCUUUCACAGCUGAGACAAGAGGCAACUCUGUCCCCCUCGUAACAACCUGAACAGCGGAAACCAGAGGUGGAGGCAGAAACGCUACUGAAGAGCCUGCCAUCAUCCCAACUCUAUUUACAGCUCUUGCUCACUCAGGUAAGGGCAGCUUUUUCCCACAUUCACAAGGACCCCUUGUUAACAUGUCCACAUGCCCCAUUCACUAUGGAAUUCCAUCCAGUCUUCAACCUCACACUCUAACAAAUCAGAGGUCUUAUAUAACAAGGUUUAAGUUGCUGCUGCCUUCUUUGCUAUAUAUAAUUUUGUCCCCCCAAAUGAUGCAAAAUUAUUGUUUUGCGUUCAUUUAUUGAUACUAUAACACUAGUUUUAGACAGUGCUAUUGGUCUCAUCAAAAUCUUAGCAAAUUGUCAUGGGUUCUGAUGAAUAUUACCCAGUGCUCAAUGUUUUCAAUUUACAUAUGCACAUUAAAAAAUUUAUUUGAGGCUGGGUGUGGCGUCUCAUGCCUGUAACCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCGGGUGAAUCACUUGAGGUCAGAAGUUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCACCUGUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCUUAGUCAUGCAUGCCUAUAAUCCCAGCUUCUCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACUCGGGAGGGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-358.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -374.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 131.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.(((((((.....((((((.(.(.((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((.(((((((((.(((((((((((((.(.(((.(((....)))...............(((((.((((((((((..(((((....)))))..))))............((((...)))))))))).)))))...((...(((.....)))..))(((((((....((((..(.((.((.((((((((.....(((((((((((......((((.(.((((.((((.(((....)))))))....(((........))).)))))))))...))))))))))).......)).)))))).))..))))))).....))))))).....(((((((((......))))))))).................((((((...))))))...((((....))))..((((.....)))).....(((((((((((..(((((................)))))..((((((.(((((....(((....))).....))))).))))))...............((((((((((((((....)))))))).))))))..(((.((((......)))).)))(((((((((((((((...))))).....)))))..))))).(((((.............)))))((((...((((.........))))..))))................)))))))))))))).).))))))))......(((((....)))))))))).))))))))).))))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))))).)).).)))))))..............((((............)))).......(((((((....))))))).)))))))...))))))))))((........)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((((((.(((((((.,,{{(((({.{{.{.((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((.(((((((((.(((((((((((((.(.(((.(((....)))...............(((((.(((((({,{{..{((((.,,,|||}|,.|||,....}}}..}}.||||},.,))))))))).)))))..,((,..(((.....))),.})|((((((....((((..(.((.((.((((((((...,.(((((((((((......((((.,.((((.(((,{(((....)))))))....{{(........,},.))))))))}...))))))))))).}.....)).)))))).))..))})))).....))))))}.....(((((((((......))))))))).,...............((((((...))))))...((((....))))..((((.....)))).....((((((((((((((((((................))))}..((((((.(((((....(((....))).....))))).))))))...............((((((((((((((....)))))))),})))))..{({.((((......)))).})}(((((((((({{(({...,}}}}.....))))}..))))).(((((,.....,,.....)))))((((...((((.........))))..))))..............,))))))))))))))).).))))))))......(((({....}))))))))).))))))))).))))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))))))))).)).}.})})))}...,...,,,,...((((........,,..)))).......(((((((....))))))).)))))))...)))))))))|((........))}
Back