Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr22_0199400

Sequence Length

359 nt

GC Content

0.4903

GUCUGAUCAUUUUAUAUAUAUAUUGAAACAUUACUGAGCACCCCAUAUCUACAAUUACUGUCCAUUAAAAAAAGUAAAAAACGCUGGGCGCGGUGGCUCACGUCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUCGGGAGUUUGAAACCAGCCUGGCCAACAUGGCAAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCGGGCAUGGUGGUGGGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGUGGCAGGAGAAUCACUUGAAUCUGGGAGGCAGAGGUUGCAGUGGGCUGAGAUCAUGCCAUUGUACUUUAGCCUGGGCGAUAAGAGCGAAACUUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-101.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -106.69

Frequency: 0.0003

Diversity: 90.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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