Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr22_0200600
Sequence Length
234 nt
GC Content
0.5940
GUUUGGUGUCCCAGGGGUACCCCAAUGAGGAGUCAAGAAGCAGCUAGAUGGCUGGAUGCCCAUGGUCAGCCCCUGGGCACAACUCAGUCCCCUGUGCCCUGUCCUCCCCAUCACCUGGGGGCUGCUCACUCAAGCAGCCAGUUCACUCAGUCAGUCAACAAACAGCAACUGUGUGCUGCAGCCACUGUUCUAGGAGCUGGAGGCAGAGCAGGGAACAGGCUAGGCUGCAGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-91.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -94.81
Frequency: 0.0064
Diversity: 54.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((.(((((((((...(((.((.((.(((......(((((....)))))))).)))))))...)))))))))))))))((((((.(((((.((((((((((((((.....))))(((((((......))))))).(((.(((.....))).)))...(((((......)))))((((..(((...)))..))))))))....)))))).)))))...)))))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,..(((.(((((((((...((,{((.((.(((......(((((....)))))))).)))))))...)))))))))))),}|((((((.(((((.((((((((((((((.....))))(((((((......))))))).(((.{((.....}|}.}}}...(((({......))))){{{{..|||..,}))}.)))))}))..,.)))))).)))))...))))).,}...}
Back