Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr2_0409800

Sequence Length

302 nt

GC Content

0.3245

GUUUAAUAUUAUACCUGGCUUCAUUUACUCUCACCAGAAGGAAAAAACUAUGAAAACAUGUCUAAGGAGUACUUUGCUAUCCCAAAACUUUUAAAAAACUUUAAAAAUCUCAAUAUUCUAUUAAAAUAGAAAGACAAUAUAUAUUAGCAAUUUUAGUGGUUUCUGAGCACCGGGCUUGUAUCCAUGAAGACUUUUUGUACCGAUAUAAAUGACACAACUGACUGUGAUUCCAUUUACCUAUAGGGAGCAUUGGACAAAGUGCCUUCUACUCAAUUUUAGGAUCUAAAAACCAAGAGAGUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-43.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -50.09

Frequency: 0.0000

Diversity: 48.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((....)).))((.........(((((((.((....)).......((((....))))....(((((((((((((((((((.....(((((((....))))))).........((((((....))))))........((((((.((((((((.((((....(((((.....)))))...)))).))))....))))...)))))).....((((......))))................))))....))).))))))).)))))......((((((...)))))).....)))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.{,....,}.))({........,(((((((.((....)).......{(((....))}}....(((((((((((((((((((.....(((((((....))))))).........((((((....))))))........{(({{{.((((((({.((((....,((((.....))))}...)))).})))....))))...})))}|{{{{.((((......))))....,}}},.......))))....))).)))))))}}))))......{(((((...)))))}.....)))))))))