Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr2_0852900
Sequence Length
1258 nt
GC Content
0.3641
CUUUAUUGAUACUUUGCUUUUACAGUUCACAAUGCAUUCCACAGAUUUAGUUCAGUACAGCUUAAACCACAAUGGUAUAAAUCUUCAUUUUGUAAUUAAUAAUUUCUUGCAUAACAAUGUUUGAUAUUUGCAAACAAACAACAUUUUUGGAAGCAUUAGAUUCAGUCCAUAGAUUCUGUGACAAAAUUAACUACAGUCAGUCUGUGCAAUGAAAUUGAUGUUGGAGUUCUAUGUGUGUGGCAUUUCAUGUUGAAAACAGAUGGUAGUGCUCCUAGAAAUAUUUCUUCUUCUAGCUUAUGUGCUUUGGAACUACACAUGUAUAACCAAUGACUGACUCUGAAAUAUCAAGCACUGUGGGGUGGCUGGAAGGUAAAGGUCUAAGCUUUGUGAAACACUAUACAUAUAUAAUCUAUAUUUACUUAUAUUGGCAAUUAAUAUAACAGUAAAAGUCACAAUACACCUAGAACAUACCAGAAAAGCAAGCUUUGUCAUUCCUGCUUUACCGGUAUGAUCUCGUCUAAACAAACAUUUCAUUUCAGAAAAUCUGCAUCAAUCUACACGGACCAUACACAGUGCACAAACUGAAAAGGGCUUUUUUUUUUUUUUUUCUAGCUCCACCAUCUCUGCAACUUGCCAAGAUGCGGCAAGACUAUCUGCAACAAAGUAAAAUAUACAGGUUUUUUAUUCCACCAGUGCCUCAGAUAGAUAGGAAAAAGAUAUGAUUACGGUUUAAAUCCAUACAUAGCAGCUUACAAUACUUAAGAUGAUGAACACAUGGCAGUCAAGACAGGUAAUUUUUCCUCACAACAGUGCAUGGCUAAAAAUAAAGAUCUAACAACGAUCUGUGAAACUGCACUGCAACGUCAAGGUUCGUUCUUCCCUGACCCUCCCCCGUAUAAUCAAAUGAAUAUCCCCUUUAAAGAUGAACUCCUACUAAUUAUUUUGGGCGUUUUCAUUCAGCUUUGCGCUUCAAUCCAGGGAUUUUUGCUUGGAUUUUAGCCAUAGCAUCUUUAACAUUCUUAUUUGCAAGUCCUAGAUAAUGAUCUAUCUGUGCCUGAUGCCGUUCAUAAAUAACAGGAACACUGAAGAGUGAAAUGAGAGCCAAAAUCAGUAGUGUCAGACCAUUAAACAAGGCACCAACAUAGGUAAAUACCCACAUCAACACUGCAAACUUCAGAGAAUCAACUAAAUCAUCAACUAAGAAGAGGCGCCUGAGUUCCUUUAUCGUGCAGUUCACAUGACCAAGAGCAGAAUUACU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-253.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -280.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 315.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((..(((((((((...(((...(((((.(((((.(((((((..(((..................)))..)))))))......(((((...........)))))......((((((.......))))))...........))))))))))...((((...(((((((((((((...........)))))..))))))))...)))).(((((((.((.(((.(((.(((((((((((((((.(((....))))))).)))))).((((((..........)))))).....((((((((....(((....))).....((((.(((((.((..........((((((((..((((((((.((((..((((....(..((((((........................(((((((((((((.....)))))))..))))))..))))))..)))))(((.((((((.(.((((((..............)))))).).)))))).)))......................((((...)))).....)))).).))).)))).))))))))....(((((....(((((((.((((..((((((.((.(((..(((((((((..((((((.......)))))).(((((((..................((((................)))))))))))...(((...((((.........))))...))).......)))).............)))))((((((....((((.(((.((((((((..............((((((((.((.........(((((.......))))))).)...)))))))....((((.((.........)).)))).................((((((.((.(((....(((((((...........)))))))))).)).))))))..(((.((.(((..((((((((.(....).))))))))..))))).)))...........(((((((((.......))))))).))..))))))).).)))))))))))))........)))...)))))))).)))).)))))))....))))))).)))))..))))...))))))))..))))).)))))).)).))))))).((((((......((.((((((......((.((......)).))......))).)))))......))))))......))).)))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.....,|({..(((((((((.,,{{,...{((((.(((((.{((({{{(({.......,,|,,.((({...}))).}}}........,,(((({..,........}}|||.....,||{{{|,...,},)))}}},,....,,,,.)))))))))}.,.((((...((((((({(((((...........)))))..})))))))...)))).{((((({,((.((,,(((.(((((((((((((((.{{{....)),)))).)))))).((((((..........)))))).....((((((((....{((....))}.....{{{(.(((((.(({,....,,..((((((((..((((((({.((((..((((....{..((((((.....,.,...,,{|,....}}}}|((((((((((((,...,)))))))..)))))}..))))))..,))))(((.((((((.(.((((((.,............)))))).).)))))).))).,,...................{((|...}))).....)))).}.))).)))).))))))))....(((((....(((((((.{(((,.((((((.{(.(((..(((((,,((,.,,|||,.}}}}},||||||.,,{{{{{,.....,{{{,{,..,...,|}.,}}}}},....{{{.||..|||||||{{,(((.,.,{{{.{({{{{{{{,,....|||,,.....}||},,,,.......,,)),}}{(({{{...|(((,,{,,.{{{((({{......}}}.....(((((((,{,{.........(((((.......))))),},,..,)))))))....({{{.((.,,,.....}}.)))}.......}||,...,,.{(((((.{{.(({....(((((((...........}}}}}})))).)).)))))}..(({.{(.(((..((((((((.{....}.))))))))..))))).)))}}}},,.....,,{{{{{|{.......}}}}}},.,))})))))),})})),)))))},,,,........)))...}})))))).)))).)))))))....)))))}).)))))..)))}...))))))))..))))),)),...,)),))))))}.{{||{|,,...}||,|{|{{|,.,...||.{{......}},||,,.,,.,},})}))),,...,))))}}.....})}..))))))))).,,,.}
Back