Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr3_0649200

Sequence Length

833 nt

GC Content

0.4358

GUGUGAGCCACCGCACCUGGCCGUAGUCUUGGUUUUAAAGAGUAAUAAAUUAAGAAGAAUAGUUUAAUGGAAACAAUCAAGGCUUUAAUUUUUUUUUUUUCUUUUUUGAGACAGAAUCUCGCUGUGUCGCGAUCCUGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCUGGGUUCAAGCAAUUCUUCUGCCUCAGCCGCCCGAGUACCCGGGAUUACAGGUGUGCGCCACCAUACCCGGAUAAUUUUUGCAUUUUCUGUAGAGACAGCGUUGCACCAUGUUGCCCAGGCUGGUAUUGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCUGCCCGCCUCGGCCGCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCUGGCCUGAAAUUUUUUUAUGUAGGACAAAUUAUAUUCUCUACAGAAUAAGAAAAAGAGAAUCAAUGUAGUUUUUCUUUAAAUCUAGGGACUUUACUAUCUAUGUAAGGACAACUAUGAAACUGAAUAUAGGUUAGAAGACAGUACUGAGACAGCUAGAAAUAAGAAUGCUUAAUCUUGAAAAAUUUGGAGAUUGGACCAAAUUACAAUACACAAAGCAGUACUGAAGAUAAUUCAAAUACAGACUCUCUGUCACUAUAGAAAGAGGUCUAUCUAAACAAAGACAUACAAAGCUUCAAACCACACCCUGCCUAUCUCCAGUGGCUGUUCCUUGAUCUAAGAACCUGAGAGAGGAGCCCCUUACUUCAGGGGUGUCAAUGAAGAGAACUACAAUGAGGUAUGAGAAUUAGGAAUAAGGGGCUGGGCACAGUGGCUCACACCUGUAUUCCCAGCACUUUGCGAGGCCAAGGUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-247.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -265.22

Frequency: 0.0000

Diversity: 178.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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