Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr3_0650700
Sequence Length
339 nt
GC Content
0.4012
CUGCCUGCCUUGGCCUUCCAAAGUUCUGGGAUUAAAGAUGUGAGCCACUGUGUUCAGUCAGGUACUAUUACUUCUUAAAAUUACUUCCAAAGUCAUCACAAAUUAUCAUUACUUCAAGUGAAUCAAUGCCAUUCCUGGCCUUGAGCCAUAAACUAGGACUAUGUGCAAGCGUAACACAGAUACAUCGUCAAGUUCAGUUUCAGACCACCGUAAUAAAGCAUUACAAAAUUAGUUGCACAAAUUUAGUUUCCUGAUGCAUAUAAAAGUUACAUUUAUGGCCAGGUGUGGUGGCUCAUGUCUGUAAUCCUAGCAAUUUGGGAGCCAGGUGGAUCAUUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-89.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -97.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 59.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((.(((.(((((((...(((((((((.(((((((((((((((....)))).(((((....))))).......((((((...((((.................)))).))))))......(((((.((((((((((((.....((((..(((.((((((............).))))).))).))))....)))))..............((((((..(((((((.(......).)))))))..))))))...................))))))).)))))))))))))))).)))))))))...))))))))))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,(((((,,(({,(((((((...(((((((((.(((((((((((((((....)))).{((((....))))}.......,,{(({...||||............,,{{{,,,...)))))......(((((.(((((((,((((.....((((..(((.(((((,............}.})))).))).)))).,},))}}}......,,......((((((..(((((((,(.....,).)))))))..))))))..............,}}}.))))))).)))))))))))))))).)))))))))...))))))))))))))))..{....,..
Back