Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr6_0687000

Sequence Length

541 nt

GC Content

0.4085

GUUUGAGUGAAGAUGCAAAGUGUACUCACAGAAAUAUGAGAACAUCAGCUACUUGAGAAAGAGGACUGGAGAACUAAGAGGGAAUGAAAAUGAAGUGGUAAGGCAUUCCCAAAACAAAACUCUGAAUUUGACAGUGGUCUUUCCUGCACAGUAUCCUGUUCCUAGAAUAUAAAGUAACAUUACAGUUUUACUGUGAAUUUAAAAAAUACUUUUUGUAACUAGUCUGGGAAUUUAACCUCCAUUAAUAACCUAGAAAAAUAUGCCUGAAGGCAUCCUUGUAUAUUAAUGAGUUGACUGAUGGCUGGCAGCCCAUAGGUAACUUGAGGACAGGGGCUGGACAUCAGAAAGGCCAAAGCAUGACUACAAGGUUGAGACUUUUAUCCCCACCUGUCCCCCCAACCUCUGGAGAGCAGAGAGGGGCUGAAGACUAAGUUGAUCACCAAUGGCCAAUUACGUAAUCAAUCAUGCCUAGGUAAUGAAACUUUCAUAAAAAUCCAAAGGACUAGGUUCAGGAAUUUCUGGAGAGCCGAACGUGCAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-126.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -137.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 156.09

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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