Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr6_0687400

Sequence Length

603 nt

GC Content

0.4146

AUUAUACAAGAAAAUUUGGAAUUCAAUGAUGCAACCAUUCAAUCAAAAGGGAUGUUAAGAUUCAUGACCAGUCUUUGAAUUCAGUUUGUGCCACUGGCAGGCAUACAAGUAUGGUAUAAUAAAAAAUAACUGGUCUUUGUCCUAGGUUCUUAGCACAAAGCUCCUAAAACCCUUGAAAUCUACGUAAGUGUCUUUUUCAUGUUAAUGAGAUAACAUUAGGCUGAGGAGCUUCUAGAUAGCUUUAAGACAGGGACUGGUCACUACAAAGACCAUGCCAUGAUUAGAGAGAUGGAACUUGUAGCCCCACCCCCCAGUCUUGCAGGAGGUAAAGGGGCAGAGAUUGAACCCAAUCACCAAUGGCCAAUGAUCUGAUCAAUCAUGGCUAUGUACUCCACAAGACCUCCUAAACAACAGUAGUCUAAGAGCUUCUGAGUUGGAAAACACAUCCAUGUGCUGGGAAGGUGGCACAUCCCAACUCCACAGAGACAGGCUCUGGUGCUUGGAACCCUUUCAGAUCUCACCCUAGGUACUUCUUCAUCUGGCUGUUCAUUUGUAUCCUUUAUAAUACCUUGUAAUAGUAAGUAUAGCAUUUUCCUGAGUUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-150.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -161.67

Frequency: 0.0000

Diversity: 203.46

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(...............)((((((((..(((((.............((((((...(((((..(((.((((.(((((((.....(((((((((((((..(.((((((((((...(((................((.((((((.((((....)))).))))))..))....)))))))...........(((((...((((((....))))))..)))))..(((.((((((((.(((((.(((.((((((.(((..(((...((((((...((((..(.........)..))))...))))))..)))..)))..)))))).(((((((...((((....(((((....)))))....(((((((.((((.......)))))))))))...)))).....))))))).......))).))))).)))))))).)))((((.......))))))))))..)..)))))))))....))))...))))))).)).)))))..)))))..))))))(((((...(((...)))........)))))((((((((...((((........))))..)).)))))).......)))))....))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(...............)((((((((..(((((.............,{((((,{.,{(((,,{{{.((((,(({{(({.....,{{((((((((((.,,.{{{,{{{,{{{,||||,,........,..}}}||||{{{{{|,{{({{{{{|{(,||,|{{{{{{{.....{{{,,.......,...{((({...{{{(((....))))))..))))}}}|,,.||||||||.|{({,,{({|{,{{{{,|(|,,|(({,.,,,,,,.},||||.||.{.....,.,.,}}}}..|}}}}}||||||,,,||{.||,,}}.{||{||{...||||,...(((((....)))))....(((((({,((((.......))))))))))),..}})).....)))))))...,...||,.)))),.}))))}))||||((({.......}}}||||}}||,}..}}))))))),.,,)))),..|||||}}.}},))))),,))})),,))}}}},{|||...,,,,,{|||........}}))}|{(({{{{...((((........}}}}..}).)))))}.,,....)))))....))))))))