Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr6_0687500
Sequence Length
470 nt
GC Content
0.3128
AAUACAACUGUACUUUUCUUCAGGGUCUAUAUAAAUUUUAAACUCUAAAAAACAUUAAGUGUUAUACAUAUAAGUAAUUUAGCCAUCUACUUUCAAUAGGAUACCAGGCUGAGCUCAUAAAAGAAAAACGCAGGGGAUACAAUAAGACUGAGCAAUAAACUGAGAAAGCAUUUUAAUCUUAGAGACAAAAGACUUAAAGAGUUCUAGUACUGACUUCUUAUUUUAUUUUGAGGAAAAGCAUUUCAGCACCCUAUUUCUGUUUCUCCCAACUAUCAAAUAAAUUAUCAAAUAUAAACUGGAUUGCCACCUGUCAGAAGUUACAGAAGGAAUUCCUCUGUUAAAAAGAUGUUGGGAAAAAAUUCUAGUUUAUCUGUUAAUCUAUGAUUCUAUAAUCGUAUAAAUUCAUCUUCCCCAAAAUAAAAUAAAGGCGCAGGGCCUCAAGCACACCUCAGAAGAUAUUUAAUUAAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-72.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -82.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 103.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((((..(((((((.(((((.((.........)).)))))....(((((...))))).(((......))).(((((((((((..........))))....))))))).......)))))))..))))..)...........(((((......(((.(((..((.((((((((((........)))).)))))).)))))))).........(((((((((((((.((((..((......))....(((((..(((......)))....))))).((((.((...((((((((((((.(((.(.(((.......(((((.((....)))))))......)))).))).)).....)))))))))).)).)))).(((((((....)))))))..........)))).)))))))))))))((((.....)))).........)))))....))))((......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(..((((..(((((((.(((((.{{.........}}.)))))....{((((...})))}.,{{.....,}},.,((((((,,,{.,,,.....,))}}....))))))},,.....}))))))..))))..}...........{{{({.......((((({..{{.,{{{{{((((.,......}))}.))}))),}}}},,}}..,,.,,,.(((((((((((((.((((..((......))...........{{{......|||......,,,.,{{{.{{...(((((((((({{.,,.{({{,(,....,,((((,,((....))))))).,....}})).}))),...,,.}))))))))).}}.}}}}.(((((({....}))))))..........)))).)))))))))))))((((.....)))).........)))))....))))({......))
Back