Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr7_0684000
Sequence Length
2610 nt
GC Content
0.4843
GUGUGCGCCACUAUACCUGGCUAAUUUUUCUAUUUUUUGUAGAGAUGGGGUCUCGCUACGUUGCCCAGGACUAACAUGCUUCUUCAUCACAGGCACUCAGCAGCACAAAGACUCUCGUCCUGAAUCAUUUCCCUUCCCCUAAAUGAAACCUUGCUUCUUACCUCGUGACUGUAAGAGGCGGGGUUUCCGAGACGAAUGUUUGAAGUGGGACUGGGUGGCCUCGUGAUGAAGGUCAAAGCUCGAGGACUCCUGAACUGGAUCCAGAGGCACCAUCCCCCUUGCGAGCAUCUCAGGUCCAUGAACUUGACCUGGGACCUGAAGACAGACAGGUUGGGCUUGUGGGUAAAUCACUUUGUAAAUGGGAAUUAAAAUAUUUAAAAACAGACCAUGAGUAUGCCAGUGGAUGCAGGAAGAAAGCCAGAACAUUUUUAAGACAGAGUAACCACCUAAUAACCUAAAGCCUGCCAAUACUUCUCCUGGCUCCAGUUUCAACGUCUGUGCCCUGCUCACACAUAAUAGGUUUCACCUCUUUUUACCUGUUGUCCUGAUAAAUCAAGCUCCAAGUCUUCUAGAAGGGUCACGGCCUCCUCUCCACUAUCGGGGCGGUAUUCCUGCAGCCAGACCUGGAGCUCCUUGGGCAGGAUGGAAAGAAACUGCUCUAGCACCAGAAGCUCCAGGAUCUGUUCCUUGGUGUUUAUUUCUGGCCGCAGCCACUGAUGACAAAGUUCCUUCAGCCGACUGAGAGCCUCUCGGGGCCCAAAAGUGUUCUGGUAACAGAAGCGCCUGAAGCGUUGGCGGAAUAUCUCUGGGUCUGGAGGAGGCGUGUCCUGUAGGGUGGAAUCCUGCCCCCACAUGUGGUCUUCCUCAUCUUCCUCUUCCACCUUCACUAUUACGAUACCAUCCUUCUCCUGUGCAGCCUGUGGGGACAGACCCGUGGCUUCCCGUGAUUCAGCAGUCAUCAUUCAGGCUCCAGGAACUGACUUGAUCCAAACAGGGUCUGUGCUCACCUUUAUGUCCUGGGAGGUUUUAUGAUGUGUUUCUUUACUAUUCCUGAAGUAUAAAAAAAAAGUCAUUAGUACGUACCUUUACAAAAAGUGAUCUGUGCUGCUAACACUUUAUAGGAGGCAGCACAUCGAGGCACUAUCAGAACGCUCCUGAGGCCGGGGGUGGUGGCUCACGCCUGUAAUCUCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAGGCCAAUCGCCUGCGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAGUCAGCAGGGCAUGGUGGCAGGCGCCUGUAAUCCCAGCUACUCGGAAAGCUGAGGCAGGAGAAACGCUUGAACCCAGGAGGUGGAGGUUGUAGUGAGCCGAGAUUACGCCACUGCACUUCCUACCUGGGAGACAAGAAGUUAAACUCCGUCAAAAAAAAAAAAAUCCUGACAAAUCGAGGAAAAAACUGUACAAUCUCCACUGUCACUUCAUAUAUCAAGAUUUGCAAACAGAAACCUCAAACAGGCCGACUCCACCCUCAGGGUGUUUGCUUGGAGUCAGAGUGAUUUACCUGCAGGUUGACAGCAGGUUACGAAAUGGAGCAUUAACAGUGCCCAGCCCAGAGAGCUGAAUGUUAGCAGAGUGCCAGGUGCCAGGCUUAAAGCAGUACACGCACCAUCUUCUUUUGUCCCUACAACAGCCCUAGCAGGUCGGCCAAACUGUUAAGUGCUGUUUUACAAAUGACAUAACUGAGGGUUAGGUUUGCUCAGUAGUAGGUGGCUGCCUACUGGAGUCAAUAUUCAACCAAAUUUGAAGCCCUGGGACCUACUUUUGUACCAUCCAGCUACUUUUGCUAUUUUUAUGAGUGACUUGGGCAGUUAAAUUGUGGUUUCCAAAGUACAAGAUGAUCCGCAAAGGAUACAGAAAGAAAAUAAUUGGAAUGUCUGUAUCUUAAAAGAGAGAGAAAUUAAGCUAUAAAUUGACACUAAUACACUUACUUAGUCUGUGCUGACCUGUCACAGGUGUUGUUCAUUUUAGACAUUGUGAUGUAGACUGGUUUAUCUGAGACCAGUUAUGUGAAAUAAUGGAUUUCUAAAUCUAGCUUUGGCUGGGCGCAGUGGCUCAUGCCUAUAAUCCCAAAACUUUGGGAGGCCAAGGCGUGCGGAUCACGAGGUCAGGAGAUCGGGACCAUCCUGGUCAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAUAGAAAAAUUAGCUGGGCGCGGUGGCGGGCACCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGAAGGAGAAUCACUUGAACCCAGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCGCGCCACUGCACUCCAUCCUGGCCACAGAGCGAGACUCUGUCAUAAAAGAGACAAGCAGCUUUAAAGAUUCUUGUGGCCAGAUAUGGUAGCUCAUGCCUAUAAUUCCAGCCCUUUGGGAGGAUGAGGCAGGAGGAUGCUUGAAGCCAGAAGUUUGAGACCAGCCUGGGCAACAUAGCAAGACCCUGUCCCUAUGAAAAAGAAAAAAAUUAGCUGGGCAUGGGGACUGUGUCUGCAGUCACAGCUACUCAGGAGGCUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-910.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -959.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 617.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((((...((((((((((((((((((((((.(((((((((((((.((((((.((((.((((((......((..((((((((((((((((((((...(((..((((..(((((..(((....))).............(((((((((((((((((.........)))))))))))))))))...)))))..))))...)))...)))))).)))).)))))))))).))...(((((...(((((((.((((((((.(((.((((((((((.....((((((.((((((......))))))((((((.((((((....(((..((((((...((((.....)))).......((((((..................(((((..((((((.((.((.(((((.........((((((((((((((.....((((...................((((................)))).(((((((....(((((..((((((((...(((((((((.............)))))))))..(((....)))(((((((.((((......((((..((.(((((............))))).))..))))......)))).)))))))...)))))))))))))..))))))))))).((.((((((((.((((((.....))).))).))....))))))..)).(((.((((.((....((((..((((....)))))))).)))))))))..))))))))))))))..(((......)))..))))).)))).))).)))..)))))((((((((.(((((..(((((((((((............(((.((....)).))).......))))))))).))......)))))...)))))))).....((((..((((......)))).))))))))))..)))))).)))....)))))).)))))).........(((((.....))))).))))))........(.((((((((((((..(((((((((((..((((........))))..........((((((.....(((....)))....)))))).(((((((((..(........)..)))))))))..))))))).)))))))).))))).))).))))))))))).)))((((((((.((.((((((((((((....)))))((((((.....))))))(((((((.(((...)))...)))))))............(((.(((.((..(((((((((((((((.(((..((.((((((.((((((((((((((..(((((.(((((...((((.(((.((((.(((.((((..((((((....((((((.((((((.((.........))))))))))))))..))))))...))))..)))...))))................((((((....)).))))....(((((..((((((((..(((((((............((((....))))..(((.....)))..((((((((((...))))........)))))).)))))))..((((((.(.....).)))))).......))))).))).)))))))))))))).))))))))...))).)))).)))))((((.((((((((....(((((...(((((((((.((..((((..((.(((((((.((((((..........)))))).).)))))).)).....))))..((((((.(.......).)))))))).)))))).))).)))))((((....))))...........))).))))).)))).....)))))))))).)))))))))).))))))))..)).)))..)))..(((((.(((((((((((((.........((((((.....)))).))............))))))..(((.(.(((....))).).)))......))))))).)))))(((((.........)))))..)))))))...)).)))))))).......((((((((((((......(((((((((.....))))))))).......))))))....)))))).(((((....)))))((......)).(((((((....((((((....)))))).....))))))).))))).).)).))))))).)))))....)))))).)))).)))))).))))))))))))).))))))))))))))))))))))...))))))).))))((.(((((((.(((.(((((((((.(((..........))))))...)))))).)))((((..(((((((.((((....)).)))))))))))))...(((((((((((((..(.((.((((........))))))).))))..........)))))))))....((((.(((.(((((((..((((((....))))))..)).))))).)))..))))....(((...((.(((....))).)).)))..(((((...(((...))).)))))..............(((((((((.((.((((...)))).))))).))))))....)).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((((((.,.((((((((((((((((((((({.(((((((((((((.((((((.((((.((((((.......{..((((((((((((((((((((...(((..((((..(((((,.(({....}}}.............(((((((((((((((((.........))))))))))))))))).}.)))))..))))...)))...)))))),}))).)))))))))}.....,(((((...(((((({.((,({{{{.(((.((((((((((,,,{,((((.{(((((((({..,.....}}})}})))||||,.,...,,||||,{{{||||{||||,...{{{|((((({,{,({{{{,......}}}},...,||||{{.}||{|,|,||.(((((,({((({{{,.,(((((,,,,,,,,,..,.{((.({...................|||}|,...........}))))}.(((((((..,,((({(,,(((({(({...(((((((((.............)))))))))..{{{....,},(((((((.((((.,,...((((..((.((({(,...........))))).))..))))..,,..)))).)))))))...}))))))))))}}..))))))).....{(.((((((((.((((((.....)))}})).)),...})))))..)),{||,(({{.{{....|||{.,{{((....)))}|||{{||||}|{{{{{{.|,|{((((((.{{{{....{{.,,....)))))).)))})))},}.}))))))||||||||}{{({{..(({((((((,{..,}|,....,,|{|.{{....)).}})}},}}}},))))),,,..,...,},)),,),,.)))}}|||{{.{,({{{|({(((.({((,((|,,|||||,,,((((({....}))))}....}})))),}}|}}.,,..,..|||||...,.)))))})),)))}}.....,|,{{{||||{((((..(((((((((((..((((........)))}..........||||||.,,..||,.,,,)))....)))))}.(((((((((..(........)..)))))))))..))))))).))))|}}}.})}))}}))}})))))))))).))).,(((((,..,.{||||((((((({{{{{{,,.((((((.....))))))(((((((.(({...}))...)))))))..,,.,,||,..{((,(((.((..(((((((((((((((.(((..((.(((((,,((((((((((((({..(((((.(((((...((((.(((.((((.(((.((((..((((((....(((((,{((((((.((.{......}))))))))))))))..))))))...))))..)))...))))................(((({{....}}.))))....(((((..{{{(((((..(((((((,...........,{{{....}}},..{{{....,|||,.((({{(((((...)))}}.,.,,,}))))}}.)))))))..((((((.(.....).)))))).......))))).}},.)))))))))))))).))))))))...))),}))).)))))((((.((((((((...,({{{{...||((((((({(,..((((..,{.(((((({,((((((..........)))))).).)))))).}}.....))))..{{{|||}|,..,,,.|,|||}}|||{||||,,.})),)))))|||,.,..,,||,.......})})))}))))).)))).....)))))))))).)))))))))).))))))))..)).)))..)))..,|||..||||}}}}}))}}}}}......{((((({{{.{(((((((((......,....}......))))))))))...{{{...(({{{{{...|||||{,,{{{|{,,,{,{{,{{,...,}||{{||||,}}...},,}))))))),,,,,}.}|}}|,((((((.{{{{,(((((((((.....)))))))))}))}...})))))}))))))...}}|,(({{{{|||||((,,....}}}|,,|||,....((((((....)))))),)))))))),)))))))),).)).})))))).)))))....)))))).)))).)))))).))))))))))))).}))))))))))))))))))))).,.))))))).))))((.((((({{.{{{.((((((.(({((,,,{,,.....,,.)))...||||||.||}((((..(((((((.((((....)).))))))))))))).,.(((((((((((((,,(.(({((((........)))}}),,))))....,.,}},)))))))))....((({.(((.((((({{..(((((,....,)))))..)}.))))).)))..||||{,,,{{,....|}|||,,.,),.)))))),......(({,(((.{.(((((((((....((..,.....,..))...))))))))).}.))))))..,}.))))).)))))).)))))))
Back