Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr8_0028100
Sequence Length
669 nt
GC Content
0.4096
GUCAGAGAAGUCAUCCACUAAUAUAAAUCAAAGUAUGAGAGUCAAAAGGCCUCUCUAGCAUUGUUUAAAGGCUUCUUCAUCUCUUAAAGUUAGAAAGAAGAUAGAGCUGAAGACUAGUCACAGAAUUUAAUUAUAACAUUGACAGAACUUCACAGAAGGCUAAAUUCUCAGCCUAAGCAAAUCUUCUAUGGUAAAGUGAGGGUCCUGUCAGAGUAGGGCCCAGAGCAAAACCAGAGAUUCGCAAUUGGUCCAGAACAUGACACAAUCCCAUAUAACCCAUGGUACUAGAGAUAUCUGUGGUAGAACAACAUAAACCCAUAGGGUUCUAGAAUAGAGCAUACUGUCAAAGUGGAAAACCAUUCAGGUCAUGUAGUCAGGGUAGAAAUGGAACAUCUGAUCUCAAGACUUCAAGUGACCACGAAUCCAGAAGCACCCAUCAUGAAACCCACCAAAUCAUAAGACCAGACAGACUCAGCAGUAUUCCAUUUCUAAUAAAAUGGAAGUAGCUGAUCUGGGCCUAGGGUUGAGCAGGUCCAGAUGGGACAAGGAAGAUGCCCAAACAUGUGACUUGGACAACCAAGUUACUUAACACUAUUGCAUCAGUGCUGCCUCUGAAGUUCAUAUCCACUUGAAGAAAAAAGAAAAAGGCCAAGCUUGGAUAUUGAAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-171.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -182.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 106.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((((.((((((....((((.(((.((..(((((((....)).)))))..)).)))))))..((((((((((.((((..................)))).))))))..))))...................(((((((...........(((((........)))))..((.((((((...((((...((..((((((((......))))))))...))...)))))))))).)).(((((((........))).)))).........((.(((((((((.((....)).))))).............)))).))((((((...))))))...)))))))))))))..(((.....)))..((..((((((((.........)).))))))..)).))))))...))))(.......((((.(((((((((.((..(((..(..((((......(((((.....(((((....((((((((......))))))))...))))))))))......))))..)..))).))))))))........(((((........(((((((((....)))))))))...........))))).....))).))))..(((((((((((((((..................))))..)))))).))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.,({,.((((((....{(((.(((.((..(((((((....)),}))))..)).)))}))}..((((((((((.((((.....{{...........)))).))))))..))))...................(((((((...,,,.....(((((........)))))..((.((((((...((((...((..((((((((......))))))))...))...)))))))))).)).(((((((........))).)))).{{{{....,,.||||{{(((.((....)),)))}}............,|}}}.))|||{{|...}}))},...)))))))))))))..,|,{{{{.((((((,.((((,(((({({.......,.)))}})))}..)))).,..})))))..}}}|.{.,..{{,((((((.((..(((..{..((((.,..{.(((((.....(((((....((((((((......))))))))...))))))))))...}..))))..}..))).))))))))....,,..(((((........(((((((((....)))))))))...........))))).,})}),,)))))}.(((((((((((((((..................))))..))))))}}))))..
Back