Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr8_0029300

Sequence Length

2116 nt

GC Content

0.3403

GAAAGAUAAUUCCAGGAUAAAAUGACUGCUGGCAGUAGGAAGAGGAAGACAAAAAGAGACAAGAAAUUGAGAUACUUCAAAUGUCAAUGGGACUGGAAAGGAUUUGAUAAAGGUGGGUGGCCGCUGUUCCCCUACCUUUGGGCUACGAUAUUUCCUUUGGAAAGGAGGAUUUGGCUGAAAGGUGGUGAAGUAAAAUUCCUCAAUACCUCAGUUAAUGAGCACAGUGCCUUUCCUGGAGGGUCUCUGUGGUAUUCUUCCUAUUCUUUCUUAUACUUCUGUAUUACAUGUUGCCUCACCAUCAGUUUCCUCAUCAGAACAUUUCCCCAUCUCAACUCAUACUUCUGUACCAGCUCUCAUCCUAUUCUCACUUUCUAAGCAAUUAUGAAAUUUCAAGUAAAAAGCAAUAAAUUCCUCACAUUACAAGAUCAAAACCAAAACCACCCUUUUACAUCUUUGGAAUAAAAGCUACAGAAAUUACAUUCUUAUGUCAGCACCAAACUUUAAUGCCUAAGAGAAAUACACUAGAUUCCACUUUUCCACUGUAUCAGUCCCAAGCAUAUCCUAGGUUACAUUAGAAACUACUGCCUCUCUUCCUCAUUGUAUGCACAGUAUACAAAUUCAGAUCCUACACGGUUGAUUUUAAAUCAAAAGGUCAUUUGUCUUUGUGGACAGAAAGAUGAGCCAUAGUAGGUUAGUAUCCUCUGCAAUAAACUCGUAUAUCAUUGGAACUUUUCAUCAAGGCAAGCUUCGUAAUGUUGACUAAUUAUUACUUUAUUUAUUUGUUAAGGCCUGUCUUUCCCACUGGAACAGAUACCAUAUGAGGAGGACAAUAGUUGGCACAUACCAUAUUGUUUGUCACUCAGUGGAAGUUCAAUAAAUAUUUACUGAAUAAUAAUAUACUGUUAUACUAAAAGUUUAUAUGGCAGUGAAUAAUAGAGUGUCAGUUAAAAAAAUACUUCAUCCUAGAAUAAUAUUAGAAGAAUUUGUCCACUUAGAGCUGCAUCAAAGGGAAGAUGGAUUCAUCUUAGUGUUUUUCAUUCUAUAAAGUCUGCAAUGCCAGACAGUUUUCAAAGCCCAAGGGGACAAUGAGCCAACAGUCUUAUCUUUUUCCAUACUCCUGAUAUCAUUGCUCCUAGUAUCAUUACUGCUUAGCUAGGAUUUUAUGAUGUUUCUAUCAAAUAACUGCAACUGUGUCUUUGGAAGUCUUUCUAGUAGGUAACACGGACAGGACUCAAUUGAGUAAAUAGCAUUCAGCAGCUCCAUAUACCAAUUCAGAGUGUAUGGGGAUUUCAUUUAAAAUGGCCUUAAAAUUGCAUUUCUGUUUAUACUCUGAUGCUCAAAAACCUUAAGGCACUUAUAAAUUUUAAUGAAAUUAAAGACUUCUUUUUCUUGUAUGUAUUUCUUGGCUCAGAAUUAAAUUCUUUAUGGUUUAUUUACAGUUACCAGGACUUUACUGAUUACUAACCUGGACAAUGCCUGUUGGCUAUUUACAUCUUAAAAUAUGUCCAGUUAAAUAAAGCUUAUAUUAAAUUAGAAGUACUUUCCUGAGGAAUUUUUAUUUUGAAAAGAAAGAUCUCCCCCCCUAAUAAUAUGAAAAAAGCUAAUUAUAAAAAUACACUGUUAGCAAUAAUGGGGGUCAUAUAAAGAAUACCAGCUUUAGAGCUUUAUCUGUCAACCAUGAAACUGCAUUUUAGUUUUCUGAUUUUAGAUUUCUGUAAAAUGGUAAUGAUAAUAUUUACAUCUCAAGUUGUGAAAAUUAAACAACAAAUUCAUGCUAUUGCUAAUUACAUUUUUUAAUGACUGAUAAAUUCUUCUAAAUUUUAUAUUAGAAAAAAAGCUUAAAUCUUAAUAACUGUGGGUGUUCUUUGGUCAAAGAAGGUAAGCUAUGAAAGUUAACAUUUAUUUCUAUUUGCAUUGACUCCCAGGAAGCAUACAGGAUGCAUAUAAUAACUUCAAAAAUAUGUCUACAGUAUUUCUUGAAUUUCCUUACCUUUUCAUCUAUUACUAUCAUUUCUGGUAGACAGAAUGGUCCCCCAAAGAUGUCCAUGCACUGCACCCUGGACUCUGGGAAUAUGCCACAUUACAUAGCAAAAGGACCUUUUCAAAUGUAAUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-446.82 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -490.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 598.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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