Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr9_0416000
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.4080
GUUCAAACAAUUCUCAUGCUUGGGACUACAGGCAUGCCACCACGCCCUGCUAAUUUUUGGUUUUGGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGUCAGGCUGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAUACAAAAAAAUUAGCCGGGCAUGGUGGCGUGCACCUGUAAUCCCAGCUACUUGGAAAGCCGAAGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCCAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-80.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -83.77
Frequency: 0.0059
Diversity: 28.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(.((((((.(((((((((.((((((((((((((((.((((.((((((((((.(((((....)))))..(((((.((((...)))).))))).............................................................)))))))))).)))).)))))))))))..))))).))))).....((((....)))))))).)))))).).))))))((((....)).).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.(.((((((.(((((((((.((((((((((((((((.((((.((((((((((,{{(((,,,.|||||..,||||,||||...|}}}.}))))..........................................................},.)))))))))).)))).))))))))))}.,))))).))))},....{{{{....))}))))).)))))).).))))))((((....)).).)
Back