Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr9_0416800

Sequence Length

492 nt

GC Content

0.4980

CCUGGCAAGGUGGGAGUCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCAAAUGGUAAAACCCUCUCUCUACUAAACAUACAAAACUUAGCCGGGCAUGGUGGCACGGACCUGUAAUCCUACUACUCGGGAGGCUGAGGCAGAGGAAUCGCUUGAACCCAGGAAGCGGAGGUUGCAGUGAGUUGAGAUCGCACUACUGCACUCCAGCCUGUGCUACAAGAGCAAAACUCAGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCAGCUUGGCCAACAUGGCAAAACCCCGUCUCUACUGAAAAUACAAAUUUAGCCAGGCGUGGUGGCAUGUGUCUGUAAUCUUGGCUUACUGCAACCUCUACUCCCAGGUUCAAGCUAUUCUCCUGCCUUGGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGAUGCCCACCACCACACCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGUUUCGACAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGACCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-277.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -282.80

Frequency: 0.0001

Diversity: 31.39

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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