Basic Information

Symbol
CNDP2
RNA class
mRNA
Alias
Carnosine Dipeptidase 2 CPGL CN2 Peptidase A HsT2298 PEPA CNDP Dipeptidase 2 (Metallopeptidase M20 Family) Glutamate Carboxypeptidase-Like Protein 1 Cytosolic Non-Specific Dipeptidase Cytosolic Nonspecific Dipeptidase Carnosine Dipeptidase II Threonyl Dipeptidase Carnosinase-2 FLJ10830 HEL-S-13 Epididymis Secretory Protein Li 13 CNDP Dipeptidase 2 EC 3.4.13.18
Location (GRCh38)
18:74494112-74523557
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018235.3
Sequence length
4975.0 nt
GC content
0.5224

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1764.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1853.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1221.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001168499.2 NCBI
AGUCUCCACUAGAGACAGGACUGACCAGUUGCUCUUCCUUCCAAGAACC… 4644 nt 0.5142
NM_001370248.1 NCBI
CGUGGUACGGAACCGGCGCCGCGCUUGCUGCUGGUAACAGGGCCUUGCC… 4920 nt 0.5220
NM_001370249.1 NCBI
CGUGGUACGGAACCGGCGCCGCGCUUGCUGCUGGUAACAGGGCCUUGCC… 5242 nt 0.5193
NM_001370250.1 NCBI
GCGCUGGAGCCUGUGUGGCCUCUUGGUCAGGUGCUUGUGGAGGUUUAGC… 4988 nt 0.5194
NM_001370254.1 NCBI
CGUGGUACGGAACCGGCGCCGCGCUUGCUGCUGGUAACAGGGCCUUGCC… 5195 nt 0.5222
NM_018235.3 NCBI
CGUGGUACGGAACCGGCGCCGCGCUUGCUGCUGGUAACAGGGCCUUGCC… 4975 nt 0.5224
Summary

CNDP2, also known as tissue carnosinase and peptidase A (EC 3.4.13.18), is a nonspecific dipeptidase rather than a selective carnosinase (Teufel et al., 2003 [PubMed 12473676]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in human post-mortem blood samples identified the CNDP2 as a protein-coding gene with a negative coefficient in a post-mortem interval (PMI) prediction model, indicating its down-regulated expression pattern after death and its inclusion in the down-regulated cluster used for estimation [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].