Basic Information

Symbol
COL26A1
RNA class
mRNA
Alias
Collagen Type XXVI Alpha 1 Chain Emu2 EMID2 EMI6 Emilin And Multimerin Domain-Containing Protein 2 Collagen, Type XXVI, Alpha 1 Collagen Alpha-1(XXVI) Chain EMI Domain Containing 2 EMI Domain-Containing Protein 2 Alpha-1 Type XXVI Collagen Emu2 Gene SH2B EMU2
Location (GRCh38)
7:101362407-101559029
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001278563.3
Sequence length
2978.0 nt
GC content
0.6417

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1402.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1446.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 956.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001278563.3 NCBI
GCCCCCCACACAUUUCCAGCUCGCACCCGGGCUCCGACCGCUCGCCCCG… 2978 nt 0.6417
NM_133457.5 NCBI
GCCCCCCACACAUUUCCAGCUCGCACCCGGGCUCCGACCGCUCGCCCCG… 2972 nt 0.6423
Summary

This gene encodes a protein containing an emilin domain and two collagen stretches. This gene may be associated with aspirin-intolerant asthma. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.