Basic Information

Symbol
CORO1A
RNA class
mRNA
Alias
Coronin 1A Coronin-1 HCORO1 P57 Tryptophan Aspartate-Containing Coat Protein Coronin-Like Protein P57 Coronin-Like Protein A Coronin-1A Clipin-A TACO Coronin, Actin-Binding Protein, 1A Coronin, Actin Binding Protein, 1A Clabp TACO CLIPINA CLABP CORO1 IMD8
Location (GRCh38)
16:30182817-30189085
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007074.4
Sequence length
1623.0 nt
GC content
0.6198

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-695.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -719.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001193333.3 NCBI
AUUCAUUGUCUUGACAAGAGCAUCUUCAGCGGGCGAGUCCCCGGCUCCU… 1741 nt 0.6221
NM_007074.4 NCBI
AUUCAUUGUCUUGACAAGAGCAUCUUCAGCGGGCGAGUCCCCGGCUCCU… 1623 nt 0.6198
Summary

This gene encodes a member of the WD repeat protein family. WD repeats are minimally conserved regions of approximately 40 amino acids typically bracketed by gly-his and trp-asp (GH-WD), which may facilitate formation of heterotrimeric or multiprotein complexes. Members of this family are involved in a variety of cellular processes, including cell cycle progression, signal transduction, apoptosis, and gene regulation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been defined on chromosome 16. [provided by RefSeq, Sep 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CORO1A (Coronin-1A) was the only protein found to be upregulated simultaneously in both transcriptomic and proteomic analyses of infarcted left ventricular tissues, with its expression increasing over time after acute myocardial infarction induction [Wu et al. DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110701].