Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_007074.4
Sequence Length
1623 nt
GC Content
0.6198
AUUCAUUGUCUUGACAAGAGCAUCUUCAGCGGGCGAGUCCCCGGCUCCUCCAGCUCCUUCCUCCUCUUCCUCCUCCUCCUCCACCUCCGGCUUUUGGGGGAUCACUGUCCUCUCUCGGCAGCAGAAUGAGCCGGCAGGUGGUCCGCUCCAGCAAGUUCCGCCACGUGUUUGGACAGCCGGCCAAGGCCGACCAGUGCUAUGAAGAUGUGCGCGUCUCACAGACCACCUGGGACAGUGGCUUCUGUGCUGUCAACCCUAAGUUUGUGGCCCUGAUCUGUGAGGCCAGCGGGGGAGGGGCCUUCCUGGUGCUGCCCCUGGGCAAGACUGGACGUGUGGACAAGAAUGCGCCCACGGUCUGUGGCCACACAGCCCCUGUGCUAGACAUCGCCUGGUGCCCGCACAAUGACAACGUCAUUGCCAGUGGCUCCGAGGACUGCACAGUCAUGGUGUGGGAGAUCCCAGAUGGGGGCCUGAUGCUGCCCCUGCGGGAGCCCGUCGUCACCCUGGAGGGCCACACCAAGCGUGUGGGCAUUGUGGCCUGGCACACCACAGCCCAGAACGUGCUGCUCAGUGCAGGUUGUGACAACGUGAUCAUGGUGUGGGACGUGGGCACUGGGGCGGCCAUGCUGACACUGGGCCCAGAGGUGCACCCAGACACGAUCUACAGUGUGGACUGGAGCCGAGAUGGAGGCCUCAUUUGUACCUCCUGCCGUGACAAGCGCGUGCGCAUCAUCGAGCCCCGCAAAGGCACUGUCGUAGCUGAGAAGGACCGUCCCCACGAGGGGACCCGGCCCGUGCGUGCAGUGUUCGUGUCGGAGGGGAAGAUCCUGACCACGGGCUUCAGCCGCAUGAGUGAGCGGCAGGUGGCGCUGUGGGACACAAAGCACCUGGAGGAGCCGCUGUCCCUGCAGGAGCUGGACACCAGCAGCGGUGUCCUGCUGCCCUUCUUUGACCCUGACACCAACAUCGUCUACCUCUGUGGCAAGGGUGACAGCUCAAUCCGGUACUUUGAGAUCACUUCCGAGGCCCCUUUCCUGCACUAUCUCUCCAUGUUCAGUUCCAAGGAGUCCCAGCGGGGCAUGGGCUACAUGCCCAAACGUGGCCUGGAGGUGAACAAGUGUGAGAUCGCCAGGUUCUACAAGCUGCACGAGCGGAGGUGUGAGCCCAUUGCCAUGACAGUGCCUCGAAAGUCGGACCUGUUCCAGGAGGACCUGUACCCACCCACCGCAGGGCCCGACCCUGCCCUCACGGCUGAGGAGUGGCUGGGGGGUCGGGAUGCUGGGCCCCUCCUCAUCUCCCUCAAGGAUGGCUACGUACCCCCAAAGAGCCGGGAGCUGAGGGUCAACCGGGGCCUGGACACCGGGCGCAGGAGGGCAGCACCAGAGGCCAGUGGCACUCCCAGCUCGGAUGCCGUGUCUCGGCUGGAGGAGGAGAUGCGGAAGCUCCAGGCCACGGUGCAGGAGCUCCAGAAGCGCUUGGACAGGCUGGAGGAGACAGUCCAGGCCAAGUAGAGCCCCGCAGGGCCUCCAGCAGGGUCAGCCAUUCACACCCAUCCACUCACCUCCCAUUCCCAGCCACAUGGCAGAGAAAAAAAUCAUAAUAAAAUGGCUUUAUUUUCUGGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-695.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -719.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............((((.(.((((((..(((.((.(((((((.((((.((...((((((((((((((....(((((((....((..((((((((((((((...((((((((((((((((((((.....((((((((((((((((.((....))......((((((((.((((.((...((((....))))....)).)...))).))))).))).......))))))))((((((((((((((((((((.....(((..(((.((((((((.((.(((((.(((...((((((.((.(((.....))).)).)))))).(((....((..(....)..))....))))))))))))).).)))))))..(((((((((((...(((((.((((.(((((..(((((((...))))))).....(((..((((.(((((((.(.(((((.((.((....(((((.((..(((.((..((((((((...((..(((((.((((.(((....)))((((((((.((((.(((((..(((((.........))))))))))..)))).((((.....))))((((...)))).......))))))))))))))))).)))))))))))).)))..)))))))......(((.(..((((..((((....((((((....(((.(((((((((((((...........)))))(((((((.....)))).))).))).))).)).))).....))))))))))..))).)..).)))((((((....)))))))).))))))))))))))).)))).)))((..((((...))))..)).))))).)))).)).)))....))).))))).))))))..)))......)))))....)))))))))))))))(((((((((.(((((((......))))))).))((((.....((((..(((.((((......(.((((....)))))...)))).))).))))...))))(((((.((.....)))))))......)))))))..(((((.((.((((((.(((((.((....(((.(((((((((.....)))))))...)))))))))))).)))))).).).))))).))).))))).....))))).)))).))))..(((.((.....))))))))))))))))))))))))))..))....)))))))((((.((((.((((((((((((.....))))))(((((....)))))...)).)))))))))))).(((((((((((((((((.(((((........((((.(...........)))))))))).))))))......))))))))).))..))).).))))))).)))...)).)))).).)).)))))).))).))))))).))))..((((((.(((((.((.(.(((.(((..(((((.(..(((.((.((((.....(.((((((((...((.....))...))))))))).....)))))).)))))))))..))).((((...........)))).))).))).))))).....))))))...((.(((((((.(((.((((......)))).))).))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......,,...((({.(.((((((..(((.((.(((({({,((((.((...((((((((((,(,(.,{,{{(((((,,,.((..((((((((((((((...((((((((((((((((((((.....((((((((((((((((.(({{{{||,.{{..,,,,||,|}||||}|,.||((((....))))....||{||,{,,}.))),),))}.......))))))))|{(({({{{(({{{{{|||||||..,,....|{.,{((((((..,.{,,{|.|||}},{{((((|(({(((,..,,|||,||{||||||||||,,{{(({.(((((|..,....,))))}))}}))))||{|}}},)}}}|||,|{(((({{{....,((({((((((((({(((((((...))))))|,,.|||||{{(,{{{{{{{{{{,|||,{((((((((...((((.{.(((((((........)))))))})))){{||,{{{.,.,,,},).))))|||{{{..{{||}|||||}}||{||}}}}}}}},||||||||||..||}|,((((((,{{{(({{((({,,|,,},||.{|,{(({(({{{|,||(({(.{{|{||||{|,,.}|||.||||,||||||{{((({{|||(((.,(({,...,{{((((...,{((.(((({({{(((((.,......}..))))},((((((.....)))).))},}}).))).)).)}}.....))}}})}})}..))}.|..((.{{((((((....)))))).,))})||||||.||,||{{{{((({{({.{{,,..,.}}}}},|}}))}))|,}.)}))}}},..},,)))))},}}))|}))))))},}....|||}|{,{.|||,||},}}))}))|{||||{{{.(((((((......))))))).))}||||,}}},,{{|.|||,|||...,,..}}}.}},}}}).)))..})))}.}})}|||,...|{..,,|||,|,...,.)))})))}})}..))))))),,|{{((.((.((((((.((((,,((....(({.{{(((((((.....)))))))...}})))))))))).)))))).).).))))).))).)))))..,,.})))),)))),))})},|||.{|,,,..)))))))))))))))))}})))))))..})....))))))}((((.((((.((((((((((((.....))))))(((((....)))))...)).)))))))))))).{{(((((((((((((((.(((((........((((.{...........}))))))))).))))))......))))))))).}},,))),).))))))).)))...)).)))).).)).)))))).))).))))))|,}))}..((((((|(((((.({.(.(((.(((..(((((.{..{({.((.((((.....{.((((((((.,,((.....)).}.))))))))}...,.))))}).))}})))))..))).((((...........)))).})).)}).)))))...},}}))))...||,(((((((.{((.((((......)))).))).))))))).}.
Back