Basic Information
Symbol
ADD3
RNA class
mRNA
Alias
Adducin 3
Gamma-Adducin
ADDL
Adducin-Like Protein 70
Adducin 3 (Gamma)
CPSQ3
Location (GRCh38)
10:109996356-110135565
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
MANE select
Transcript ID
NM_016824.5
Sequence length
4413.0 nt
GC content
0.3947
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1132.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1224.40 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1292.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((...(((((...)))((((....))))((((.((((((((.....((((((((((...))))))))))........((((..(((((...)))))..)).))((..(((.(((((..(((((.....)))))..)))))))).)))))))))).))))....(((((((((((((((((((...(((....)))..(((((((((((...)))).))))))).)))))....((((((((((........))))))))))))))))..)))))))).........))))))).))))))...((((((((.........(((((.......((((((((..(((.((((((..(((.(((.....))).)))..........(((((((((((...((((((((((((((..((((((((.....((((.............((((((........))))))..(((......)))(((((......))))).((.(((((((...........(((((.((((......)))))))))...((((((........)))))).(((...(((((((((.(((...((....))..((((((((((((((((((((((((.......(((((((((..((.....((((........))))......))..)))))(((((((......((((..((.((((((((.(((.(((.((((..(((((((((.(((.........))).))......((((((((((((.(((((..(....)..))))).)))))).....)))))).(((.(((.(((.....)))))).))).((.......))............(((((((((((.((.((((....)))).))..))))).....))).)))..)).)))))..))))...))).))))))))))).))......))))....)))))))...((((...)))).))))))))))))).....(((..(.(((.(((...(((((.(((....))))))))....))).))).)..)))(((((.(((...))).)))))(((.....(((((((.(((((((((((((((......((.((((..............)))).))........))))))))))).))))...)).))))).....))).....))))))..))))))))).(((((((...(((((((((((((((((((((......((((....))))........))))))).)))))))))((((((((..(((.(((((..(((((.(.((((.(((((((((........))))))...))).)))).)............((((((((.((.(((...))).))..))))))))...((((((((((((((.((((((((..(((((((.((((((.........((((((((((.(((...(((((((..(((((((((((((......))))))))....((((((((((....)))))....((((((...((((((...(((.....)))(((.(((((....((((.......))))....)))))))))))))).((((((...((((..(((((((((....((((................))))..)))......(((((......)))))..)))))).(((((((.((((...(((........)))))))((((........(((((((...........))))))).......))))((((((........((((((.........))))))))))))............(((((((........................))))))).......((((......))))...(((((((.(.((.......)).))))))))(((((((.(((((..........)))))...)))))))...(((....))).(((....))))))))))((((.....))))(((((((.......))))...)))...)))).)))))).....................))))))..)))))((((...(((((.....(((((((....))))))).......)))))...)))).(((((.((.(.(((........((((....))))..((((((........))))))....((((.(((((.((.....((((.((((((....((.....))....)))))).)))).....)).))))))))))))...).)).))))).((((..((....))..)))).......................))))).)))))))....)))...))))))).)))..((((((....))))))...)))))).))........(((....)))....((((((.((((.((........)).))))))))))....((.((..((...((((((((..(((((((....)))))))...(((.(((((.(.(((((...((((((((((((........)))).)))...)))))....))).)).).))))).)))....))))))))))..)).))..((((((((........))))))))....(((((.(((((((((...(((((.(((((((((((......(((((((...(((((....)))))...........((((.(((....))).))))......((((....)))).....((((((((((..((((...((((....))))...))))..((((((((((((..((((((.......)))))).....))))....(((((((((((..((........))..)))))))))))(((......)))((((((((((...))))))).))).((..((((((........((((......)))).....)))))).))...)))))))).....(((((((((....)))))))))..........((((((((((.......))))))))))....))))))))))..))))))).....)))))))))))......((.((((((((.(....(((((((((.....((.((.((((((((((...........)))))).)))).)).)).......((((((.......))))))((((.....................((((((((((((((.(((((......))))).)))))))...)))))))..)))).((((((((.((((.....))))...((((((((((..(((((((((......))).))).)))...)))(((((((.(((((.............)))))..(((((((((...(((((((....))))))).....)))))))))((((((((...))))).))).......)))))))....)))))))...)).))))))..)))))))))..).)))))))).))))))).))))))))).)))))........))))).)))))))).))))))))))))))..(((((((((((........((((((((..((.(((...(((.((((((((......((.((((((((......)))..))))).)).....)))))))))))))).))....)))))))).)))))))))))...))))).))))).)))....))).)))))......................))))).))))))).......((((((....)))))).....))).)))))))))....)))...............((((.........))))))))))).)).((((....)))).))))..))).)))))...(((.((((((......)))))).))).........))))))))))))))....))))...)))))))...(((.(((((((....))))))).)))...)))))))))))))))))((((......))))((((((((((..(((.((((((......))))))..))).......(((((((.....(((((.(((....))).)))))))))))).)))))))))).((((((((.....))))))))(((((((((((...(((......)))))).))))))))........)))))...((((((((((((((....((((((((.((((...((.....))(((((...)))))..))))))))))))....((((.(...(((((...(((...((.(((((................)))))..))...))).)))))...).))))....)))))))))..)))))..))))))))(((((((...(((..(((.((..((((....)))).)).)))..))).))))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((((,..(((({...})),,||..,{||||((({.((((((((.....,,((((((((,,.,,}}}}}))),,......,,((..(((((...)))))..)).}}{{..(((.(((((..(((((.....)))))..)))))))).}})))))))).))))..,,(((((((((((((((((((...(((...}))},.(((((((((({...})))}})))))).)))))...,((((((((((........))))))))))))))))}.}))))))).........),))))).)))))).,.((((((((,,{,,,.{{((((({,.....((((((({.,(((.((((((..(((.(((.....))).)))..........(((((((((((...((((((((((((((..(((((.,,{,...((((......{,({((,((((((((.....(({{{{{{{,,...,.{{.{{((({,...{,.,{{{,,.(((,,...,.,...))).,.}))|||||||||.||||,,}}))}}.}}},|(((((((({{{{{,{{(.{((,..(((((((((,(({...,...{{||..{{(({(({{(((((((((((((((.......({((({{{{..{{.....((((........)))}......||,,|||}}(((((((......((({,{((.((((((((.(({.(((.((((..(((((({((.(((.,....||.))).)},,,...((((((((((((.(((((..{....}..))))).)))))).....)))))).||{.{{{.{{{.....})},}}.}},.{{.......}}...,,.......{((((((((((.{{.((((....)))).}}..))))).....))).))}..}},,))))..))))...))).))))))))))).)}..,,..})))....))))))).,,||||,.,}}}},})})))))))))).....{{{..{.(((.(({,{{(,((({({,....}},))))).}}}))).))).,}})))|{{{{,({{...}}),))}}|{{{,,,.,{{{(({{.(((({((((((((((,{,|{,{,.,||,....{{{{{.....|})}}}}.,,.....}})))))}}}),,}}}...}}.}}}}||,{,,|||||,..}}}}}},,}}))))))},||||{{{{{,(((({((((((((((((((((......{(((,...}))),,......))))))).))))))))}(((((({{..(((.{((((..(((((.,,{(((,(({((((((........)))))),,,))}.||||.,..,,||......((((((((.((.(((...))).))..))))))))...{(((((((((((((.((((((({..(((((((.((((((......,,,((((((((((.{((.,.(((((((..{{((({(((((((......)))))))}..{(((,({(((((....)))))..,}||{(((,,.((((((.,,,((....,)))(({{(((((.,..((((.......))))..}.)))))))))))))),{(((({...,,,,..((((({{((....((((.,..............))))..}))......,,,((.,....,})))..)))))).||||||{,((((...(({,.......))))))},||,.....,,.(((((((...........)))))))..},...||||((,,{{....{{,.,{{{{{.,.......}}}|||||||}}..,,,,,.....(((((((...,,.,,.......,,.......))))))).......{{{{......}}}}...(((((((.{.{(.,.....)).)))))))){{{((({.(((({....,,..,,))))}...)))))))...|{|,,.,})}.}|{.}},))}})))))),{,,....,{|||{,,((((.|....}))))}}}}}},,.)},}.,))))).........,,.........}))))}}..}}}}||(((.,,(({{{.....(((((({....))))))).......}}))).|,}}}..,{{{{,{{,{.{{,....,,..{{{|....}}}}..{{,,((,,,,,...}}}|||,,.{{({,,{{{||,{{|},,,|{|{.{{||||,,}..,...,}))..},})}}},.})}}.,,|,)).})||,,||||||...)}))})}})).((((..((....))..))))........,.,,||||||.....}}))),))}))))....))}...})))))).}}}..((((((....))))))...}))))).))........{{{....}}},{{,{((((({(((({(,....,}},...|||{|||||}..,{{{,{({{...,,{{{{({|,..(((((((....)))))))..,,{{|||{{({{||{{{{...{,{{{{{{{{,,,,,{,,,,||},..}}.,.))))||,||}}||||{|{|}|}},||,..{{{|||}}|,{{{,{(({{..{{((((((......}.))))))))},}.|||{|.|||{{{|||...,||||}}.{{{,((((........}))).,,,.|{,{{,,...,|||}},,,|||||,((((.{({....))}.)))}......{(((,...}}}},}},.,(((((((((..((((...((((....))))...)))}..((((((((((((.{((((((.......))))))...,.))))....{((((((((((..,(,,,....,)),.))))))))))},,,.....,||}{({(((((((...))))))).,}}.,|..((((((.{{.....((((......))))..}}.)))))).,,...)))))))).....(((((((({....)))))))))..........((((((((((.......))))))))))}...)))))))))),}}}}}}|}}}..{{{||||||||....,,,|,,||||||||...,}|||||||||||,,,.{|,||,||{{(((((({{{{{{{,...}||||,,||||{||,,,.....,,(({{((,.....,||||}},{(({{{,.............})))||{,|||||{,{,,}||{{|,,,...))))),))}}}))}}.,||,,,,..))||.{(((((({.((((.....))))...(((((((((({.(((((((((......))),}))}})).,.)},(((((((.{{{{{...,|,...,,..||}|},,{{{((((((,..(((((((....))))))).....))))))}}}((((((((...))))).))).,,....)))))))...})))))))...,},,,,,,,.)))))))}...,)})))))}})})))),}}.))))})))),))),.........})))).)))))))).)))))))))))))}..{((((((((({........{(((((({..((.(((...{({.((((((((....,.((.((((({((......))),.})))).)).....)))))))),}}))).))..,.)))))))).})))))))))}...))))).))))).)))....))}}))))},......},}}}||,,||...,}}}}},})))))}}}}}}..((((((....)))))).....))).))))))))).,..}}|,,,......,}},....,..,}}}}},,.))))))))},})}}||,|}..,)))),))))..,)),)))))...{((.((((((......)))))).))).........))))))))))))))....))))...)))))))..,(((.(((((((....)))))))})))}),)))))))))))))))))((((......))))((((((((((..(((.((((((......))))))..))).......(((({{{.,,,,(((({.(((....))).)))))})))))).)))))))))).{(((((((,...,}}}}))}}(((((((({{{..,(((,,....)))))),)))))))}{{{{,...}}}},...{((({{{{{{||{{....{{{(((((,{{.,...{{.....},(((({...}))))..})))))))}}}}....{(((.{...{(((({..((({{{(({(,((,...........)}.}})))).}}))...}.},}))))...,.))))}}..))))))}},..})}},..)))))))){{{{{({,..|{{..{||,{||,{,,,...,||}}.,,.}}}..}}}.,}))}}}.........
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGAGCGCGAGCCGCCAGCCCGUAACGGUCGCCAGUGUGAGGGGCGGGAG… | 4317 nt | 0.3945 | |
| AGUUUCAGUAAUCAUUGUGAAUGAGACUGUGAGAAACUUGGCUUGUUCA… | 4359 nt | 0.3815 | |
| AAACACUUACUACUCAGCAUUGAGAGAAGCUGCUGCUGCUAAUGCUGCU… | 4302 nt | 0.3815 | |
| AAACACUUACUACUCAGCAUUGAGAGAAGCUGCUGCUGCUAAUGCUGCU… | 4298 nt | 0.3811 | |
| AGAGCGCGAGCCGCCAGCCCGUAACGGUCGCCAGUGUGAGGGGCGGGAG… | 4467 nt | 0.3940 | |
| AGAGCGCGAGCCGCCAGCCCGUAACGGUCGCCAGUGUGAGGGGCGGGAG… | 4413 nt | 0.3947 | |
| AAACACUUACUACUCAGCAUUGAGAGAAGCUGCUGCUGCUAAUGCUGCU… | 4206 nt | 0.3809 |
Summary
Adducins are heteromeric proteins composed of different subunits referred to as adducin alpha, beta and gamma. The three subunits are encoded by distinct genes and belong to a family of membrane skeletal proteins involved in the assembly of spectrin-actin network in erythrocytes and at sites of cell-cell contact in epithelial tissues. While adducins alpha and gamma are ubiquitously expressed, the expression of adducin beta is restricted to brain and hematopoietic tissues. Adducin, originally purified from human erythrocytes, was found to be a heterodimer of adducins alpha and beta. Polymorphisms resulting in amino acid substitutions in these two subunits have been associated with the regulation of blood pressure in an animal model of hypertension. Heterodimers consisting of alpha and gamma subunits have also been described. Structurally, each subunit is comprised of two distinct domains. The amino-terminal region is protease resistant and globular in shape, while the carboxy-terminal region is protease sensitive. The latter contains multiple phosphorylation sites for protein kinase C, the binding site for calmodulin, and is required for association with spectrin and actin. Alternatively spliced adducin gamma transcripts encoding different isoforms have been described. The functions of the different isoforms are not known. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that the ADD3 was consistently downregulated in recruited monocytes/macrophages from acute myocardial infarction models, and human studies validated its downregulation in peripheral blood mononuclear cells from patients who developed heart failure post-infarction, with receiver operating characteristic analysis showing an area under the curve of 0.819 for recognizing these patients [Chen et al. DOI:10.1186/s12920-021-00890-6].