Basic Information
Symbol
CPA6
RNA class
mRNA
Alias
Carboxypeptidase A6
CPAH
Carboxypeptidase B
EC 3.4.17.-
EC 3.4.17
FEB11
ETL5
Location (GRCh38)
8:67422038-67746378
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
MANE select
Transcript ID
NM_020361.5
Sequence length
2011.0 nt
GC content
0.4286
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-548.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-589.98 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
449.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCUGCUGCUGCUUGUCCCAAGACCAAGUCGUAAUAGCAACUUCCCUUCC… | 2011 nt | 0.4286 |
Summary
The gene encodes a member of the peptidase M14 family of metallocarboxypeptidases. The encoded preproprotein is proteolytically processed to generate the mature enzyme, which catalyzes the release of large hydrophobic C-terminal amino acids. This enzyme has functions ranging from digestion of food to selective biosynthesis of neuroendocrine peptides. Mutations in this gene may be linked to epilepsy and febrile seizures, and a translocation t(6;8)(q26;q13) involving this gene has been associated with Duane retraction syndrome. [provided by RefSeq, May 2016]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that the CPA6 is a hub gene for a downregulated co-expression module in specific inhibitory neuron subtypes within the medial prefrontal cortex of alcohol-dependent subjects, and this dysregulation was identified as a key transcriptomic change associated with the dependent state [Salem et al. DOI:10.1016/J.Nbd.2023.106361].