Basic Information

Symbol
CPLX1
RNA class
mRNA
Alias
Complexin 1 CPX-I Complexin-1 Complexin I CPX I Synaphin 2 Synaphin-2 EIEE63 DEE63 CPX1
Location (GRCh38)
4:784957-827043
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006651.4
Sequence length
2112.0 nt
GC content
0.6714

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-927.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -962.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 613.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006651.4 NCBI
AGCCGCCGCCGCAGCUCACCGGGCGCCACAUGGACCCAGCCGGCCCGAG… 2112 nt 0.6714
Summary

Proteins encoded by the complexin/synaphin gene family are cytosolic proteins that function in synaptic vesicle exocytosis. These proteins bind syntaxin, part of the SNAP receptor. The protein product of this gene binds to the SNAP receptor complex and disrupts it, allowing transmitter release. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A multi-omics study in humans identified the CPLX1 as both differentially expressed and differentially spliced in the prefrontal cortex (Brodmann Area 9) of individuals with cocaine use disorder [Zillich et al. DOI:10.1038/S41398-024-03139-9].